臧宁 作品数:65 被引量:136 H指数:5 供职机构: 广西医科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广西壮族自治区科学研究与技术开发计划 广西省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 理学 更多>>
去除血清中高、中丰度蛋白方法的优化 被引量:2 2011年 目的:通过比较和优化血清样品制备方法,建立简便、灵敏的去除血清中高、中丰度蛋白的方法。方法:运用盐析法、有机溶剂法和亲和层析柱法去除血清中高、中丰度蛋白,经蛋白浓度测定和SDS-PAGE电泳分析,比较3种方法对高、中丰度蛋白去除效果及小分子蛋白的保留和分布情况。结果:乙腈沉淀法能去除血清样品中90%左右的高、中丰度蛋白,同时可残留更多15 ku以下的小分子蛋白;盐析沉淀法和亲和层析柱法均能去除血清样品中大部分高、中丰度蛋白,但所得的15 ku以下的小分子蛋白少于乙腈沉淀法所得到的相应蛋白。结论:用1.2倍体积乙腈沉淀法处理血清样品可去除绝大部分高、中丰度蛋白,同时收获更多的15 ku以下的小分子量蛋白。 胡蝶飞 李国坚 吴继周 臧宁 宁秋悦关键词:血清蛋白组学 SDS-PAGE 涂阴肺结核病人血清蛋白组学研究及SHBG蛋白验证 被引量:3 2016年 目的利用蛋白质组学方法发现和验证涂阴肺结核的候选血清标志物。方法采用i TRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例健康对照者和30例涂阴肺结核患者血清的差异表达蛋白,通过生物信息学分析差异蛋白之间的相互作用;对差异蛋白SHBG进一步ELISA验证,应用SPSS 20.0统计软件绘制ROC曲线。结果三次独立重复实验一共筛选和鉴定置信度在95%以上蛋白283种;以正常人血清为对照,涂阴肺结核患者血清中有差异表达蛋白31种(P<0.05),其中17个蛋白表达上调,14个蛋白表达下调;蛋白相互作用发现SHBG等12种蛋白处于相互作用网络关键节点;ELISA验证结果显示涂阴肺结核组血清SHBG蛋白浓度高于正常对照组和肺炎组(P<0.001),与蛋白组学筛选和鉴定的结果一致;以SHBG检测值绘制的ROC曲线下的面积是0.92(P<0.001),其诊断涂阴结核病的灵敏度和特异度分别是87.14%和85.11%。结论 i TRAQ标记结合MALDI-TOF/MS技术筛选和鉴定到的12种关键节点蛋白可能是涂阴结核病潜在标志物,SHBG是值得进一步研究的肺结核候选血清标志物。 周颖 李翠萍 何晓 李洪涛 臧宁 郑艳燕 何敏关键词:蛋白质组学 同位素标记 STR基因多态性与巴马地区老人长寿的关系 被引量:3 2011年 目的探讨广西巴马长寿老人TH01等15个STR多态位点与长寿的关系。方法调查巴马长寿区长寿老人167例(长寿组),非长寿区的长寿老人22例(对照1组),非长寿区无长寿家族史的健康对照者134例(对照2组)。采用多色荧光标记的聚合酶链反应-短串联重复序列(PCR-STR)技术及自动测序法,检测各组人群TH01等15个STR位点等位基因分型。比较长寿组和各对照组等位基因及基因型频率的差异。结果长寿组分别与各对照组相比频率有差异(P<0.05)的等位基因或基因型如下:TH01-A10、CSF1PO-A9、TH01A9-10频率低于对照1组;D19S433-A17、D7S820-A10、D7S820-A11频率高于对照2组,D7S820-A12/A13/A14三个等位基因、vWA-A17、D8S1179-A15、D5S818 A10-12低于对照2组。结论巴马长寿群体有着自己特有的、异于其他地区长寿群体的STR等位基因分布。在巴马长寿人群中发现了TH01、CSF1PO、vWA、D19S433、D7S820、D5S818、D8S1179等位点等位基因的置换或突变可能与长寿或衰老的进程相关。 张志勇 容敏华 臧宁 廖明 胡天桥 黎湘娟 覃健 农清清 张楠 肖德强 韦世录 李刚 吕泽平 黄和明 何敏关键词:短串联重复序列 基因多态性 胆癌潜在治疗靶点凝溶胶蛋白gelsolin(GSN)抑制肝癌细胞凋亡的作用机制研究 周怡 李洪涛 臧宁 李刚 邓小芳 刘坤 方芳 GSN蛋白是一种钙调节的肌动蛋白结合蛋白,包含782个氨基酸,分子量约为90KD,亚细胞定位在细胞质和细胞骨架,也可分泌至胞外。GO分析指出GSN主要通过分解细胞组分参与细胞凋亡过程;Richard等在Jurkat 细胞...关键词:关键词:肝癌 细胞凋亡 肿瘤治疗 艾滋病治疗药物NRTIs耐药突变位点D30N的引物及其应用 本发明公开了检测艾滋病核苷类逆转录酶抑制剂主要耐药突变位点D30N的ASPCR引物,每个引物对均由上游特异序列和下游序列组成。据此,发明人还建立了相应检测方法及试剂盒。应用本发明可检测HIV‑1病毒RNA的pol基因的2... 梁浩 蒋俊俊 叶力 臧宁 余军 陈荣风 杨全略 黄颉刚 宁传艺 廖艳研 梁冰玉文献传递 巴马长寿人群血清长寿标记蛋白的鉴定及血脂分析 被引量:2 2011年 目的筛选广西巴马长寿老人的血清特异蛋白,并进行分离及鉴定,探讨相关脂蛋白与长寿的关系。方法以巴马长寿区长寿老人62例为长寿组,巴马非长寿区无长寿家族史的健康对照者41例为对照组,用表面加强激光解析电离化飞行-时间质谱检测2组人群的血清蛋白表达谱,并分析差异蛋白;一维电泳液相色谱-质谱技术分离并鉴定目的差异蛋白;再选择包括长寿组的入选者257例长寿老人为长寿老人组,包括对照组的入选者123例非长寿老人为非长寿对照组,检测2组HDL-C和TG水平。结果分子量在1000~10 000,共检测长寿组与对照组表达差异的蛋白有25个(P<0.05),在长寿组高表达的4个蛋白的相对表达量比值>2;对蛋白5336.81进行分离鉴定,其可能与血脂代谢密切相关的载脂蛋白(apo)C-Ⅱ酶解片段;长寿老人组的HDLC水平高于非长寿对照组(P<0.01),2组的TG水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论巴马长寿老人与巴马非长寿区对照人群的血清蛋白图谱存在差异;apoC-Ⅱ蛋白在巴马长寿老人中的适度高表达,可能是其出现动脉粥样硬化、冠心病、脑血栓等心脑血管疾病发生较少的原因之一。 容敏华 张志勇 臧宁 廖明 覃健 农清清 吕泽平 黄和明 何敏关键词:脂蛋白类 质谱分析法 血脂异常 基于质谱鉴定的肝癌标志物的血清iTRAQ分析 被引量:7 2011年 目的:采用核素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术分析已报道的基于质谱鉴定的肝癌标志物在血清中的表达水平。方法:通过PubMed查阅2003年1月-2010年8月发表的,采用差异蛋白筛选结合基质辅助激光解析/电离-飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-fight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)鉴定的有关肝癌生物标志物的文献;同时运用iTRAQ标记技术结合MALDI-TOF-MS串联质谱技术,对20例肝癌患者与20例健康对照的血清进行差异蛋白组学分析。将文献报道的肝癌标志物数据与肝癌血清差异蛋白组学数据进行比对。结果:通过文献检索共获得符合要求的文献22篇,涉及肝癌相关标志物262个。肝癌血清差异蛋白组筛选出表达有显著差异的蛋白51个,其中在肝癌血清中高表达差异蛋白23个,低表达差异蛋白28个;与文献报道吻合的标志物8个,其中与文献报道表达水平一致的差异蛋白为6个[α-1-抗胰蛋白酶(alpha-1-antitrypsin,AAT)、载脂蛋白E(apolipoprotein E,APOE)、蛋白血浆铜蓝蛋白(ceruloplasmin,CP)、甲胎蛋白(alpha fetoprotein,AFP)、补体C3(complement C3,C3)和血清淀粉状蛋白P片段(serum amyloid P-component,APCS)]。结论:血清中鉴定获得的6个与文献报道一致的差异蛋白可能是潜在肝癌标志物,值得进一步深入探讨研究。 张钦乐 杨小丽 李刚 何晓 臧宁 胡艳玲 张学荣 何敏关键词:肝肿瘤 核素标记 串联质谱 HLA-DQB1~*02、03基因及IFN-γ、IL-4与广西壮、瑶族肝癌家族聚集性的相关性 被引量:4 2017年 本研究探讨HLA-DQB1~*02、03等位基因及细胞因子IFN-γ和IL-4与广西壮、瑶族肝癌家庭聚集性的相关性。将来自肝癌高发区,民族为瑶族的肝癌高发家族成员、无癌家族成员各40例及民族为壮族的肝癌高发家族成员、无癌家族成员各48例作为研究对象(采用相同性别,年龄(±5岁)配对方法),采集研究对象外周血并提取全血DNA,采用PCR-SSP技术检测受试者的HLA-DQB1~*02和HLA-DQB1~*03等位基因,IFN-γ及IL-4细胞因子表达水平采用ELISA法检测。结果发现,HLA-DQB1~*02、03基因在壮族肝癌高发家族成员组的表达频率均低于无癌家族成员组(p<0.05);HLA-DQB1~*02基因在瑶族肝癌高发家族成员组的表达频率高于无癌家族组(p=0.002),HLA-DQB1~*03在两组间的表达频率无明显差异(p>0.05)。广西壮、瑶族人群HLA-DQB1~*02、03基因在乙肝病毒感染组及非感染组中的表达频率比较无显著性差异(p>0.05)。壮、瑶族肝癌高发家族成员组IL-4平均表达水平均高于无癌家族成员组,肝癌高发家族成员组IFN-γ平均表达水平均低于无癌家族成员组,差异具有统计学意义(p<0.05)。广西壮、瑶族人群中HLA-DQB1~*02基因阳性和阴性成员的IL-4平均表达水平无明显差异(p>0.05)。广西壮族人群中HLA-DQB1~*03基因阳性成员的IFN-γ平均表达水平高于HLA-DQB1~*03阴性成员(p=0.011),HLA-DQB1~*03阳性和阴性成员的IL-4平均表达水平无明显差异(p<0.05)。本课题得出结论,HLA-DQB1~*02、03基因与广西壮、瑶族肝癌家庭聚集性有关,但存在较大的民族差异;细胞因子IFN-γ及IL-4的表达水平失衡可能是广西壮、瑶族肝癌家族聚集性的危险因素。HLA-DQB1~*03基因导致广西壮族肝癌家族聚集性的发生可能是通过影响IFN-γ的表达水平来实现的。 梁惠萍 卢庭婷 李致忠 黄兰 臧宁 吴继周 吴健林 龚婷婷关键词:IL-4 IFN-Γ 肝癌 家庭聚集性 广西壮族人群CCR5等位基因多态性的研究 被引量:2 2008年 目的:了解广西壮族人群中HIV-1辅助受体趋化因子受体5(CCR5)及其突变体CCR5△32等位基因的频率。方法:以60名土生土长的广西壮族人群为研究对象,根据CCR5△32碱基缺失位置采用3对特异性引物,用PCR扩增全血DNA样本,根据扩增结果判断CCR5野生型和CCR5△32突变体。从中随机抽取3份PCR扩增产物进行测序,通过测序结果与野生型的U95626序列比较来验证PCR扩增结果。结果:60份样本均为CCR5野生型,未发现CCR5△32突变体。结论:广西壮族人群对HIV-1病毒感染可能具有较高的遗传易感性。 麦志丹 臧宁 苏齐鉴 吴书志 苏洁寒 沈菁 肖信 闭志友 梁浩关键词:壮族 人类免疫缺陷病毒 CCR5 CCR5△32 艾滋病治疗药物NRTIs耐药突变位点G73C的引物及其应用 本发明公开了检测艾滋病核苷类逆转录酶抑制剂主要耐药突变位点G73C的ASPCR引物,每个引物对均由上游特异序列和下游序列组成。据此,发明人还建立了相应检测方法及试剂盒。应用本发明可检测HIV‑1病毒RNA的pol基因的3... 臧宁 余军 梁冰玉 蒋俊俊 陈荣风 杨全略 宁传艺 廖艳研 梁浩 叶力 黄颉刚文献传递