秦天
- 作品数：34 被引量：152H指数：7
- 供职机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金中国工程院咨询项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 三种定量方法在温泉水中军团菌连续性监测中的应用被引量：1
- 2013年
- 目的比较传统的平板培养法、荧光定量PCR和荧光染料叠氮溴化乙锭（ethidiummonoazide，EMA）结合荧光定量PCR的方法（EMA-荧光定量PCR）对温泉水中军团菌的检测效果。方法于2011年每月（除5月份）对北京市某温泉度假村的5个温泉池进行采样，每月采集11份水样，全年共采集121份。分别采用传统的平板培养法、荧光定量PCR和EMA-荧光定量PCR方法对水样中军团菌进行定性和定量分析。结果平板培养法、荧光定量PCR和EMA-荧光定量PCR检测温泉水中军团菌污染率分别为74．4％（90／121）、100．0％（121／121）和100．0％（121／121）；3种方法对121份温泉水样本中军团菌定量数值分别为0．10-216．00菌落形成单位（CFU）／ml、1．47-1557．75基因单位（GU）／ml和0．20-301．69GU／ml。荧光定量PCR、EMA-荧光定量PER和平板培养方法对121份温泉水每份军团菌含量检测的中位数（第25百分位数～第75百分位数）分别为75．30（32．51-192．10）GU／ml、36．46（16．08-91．21）GU／ml和5．30（0．00～33．70）CFU／ml。对于121份温泉水水样，3种方法对军团菌含量分析的定量数值差异有统计学意义（X^2=187．900，P〈0．01），其中荧光定量PCR的定量数值最高，EMA-荧光定量PCR的数值次之，平板培养的数值最低。结论荧光定量PCR和EMA-荧光定量PCR方法检测温泉水中军团菌的灵敏度优于传统的培养方法，EMA-荧光定量PCR方法适合用于环境水体中军团菌活菌监测。
- 闫革彬王焕新秦天周海健李马超徐颖赵明强邵祝军任红宇
- 关键词：军团菌温泉聚合酶链反应荧光染料
- C群和不可分群脑膜炎奈瑟菌对人喉癌上皮细胞黏附能力的研究
- 2012年
- 目的建立和优化脑膜炎奈瑟菌(Neisseria Meningitidis,Nm)对人喉癌上皮细胞(Human Larynx Carcinoma Epithelial Cell,HEp-2)的黏附实验方法,检测C群序列型(SequenceType,ST)4821序列群和不可分群(Nongroupable,NG)Nm对HEp-2黏附能力的差异性。方法以C群Nm疫苗株C11作为靶菌,选用HEp-2,选择不同的黏附时间和不同的感染复数(Multiplicity of Infection,MOI)确定Nm与HEp-2黏附作用的最适条件,对中国分离的26株C群ST-4821序列群和8株NG Nm菌株进行HEp-2黏附能力研究。结果 Nm与HEp-2黏附研究最适作用时间为4h,最适MOI为100～1000;各血清群参考菌株的黏附菌落数在1.46×105～1.63×106菌落形成单位/毫升(Colony Form ingUnit,CFU/ml);26株ST-4821序列群的C群Nm对HEp-2的黏附菌落数在1.33×105～9.53×106CFU/ml;8株NGNm的黏附菌落数在3.04×105～8.52×106CFU/ml。结论不同血清群Nm对HEp-2的黏附能力存在差异;同是ST-4821序列群的C群Nm对HEp-2的黏附能力存在差异;同是NG Nm对HEp-2的黏附能力存在差异。
- 杨郝亮秦天徐丽任红宇朱兵清邵祝军
- 关键词：脑膜炎奈瑟菌
- 1950-2021年中国斑疹伤寒流行特征分析被引量：5
- 2023年
- 目的分析斑疹伤寒在我国的流行病学特征,探讨我国斑疹伤寒防控工作面临的问题及挑战和策略。方法资料来源于中国公共卫生科学数据中心传染病历史数据库和中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统1950-2021年斑疹伤寒报告数据,采用描述性统计方法、Mann-Kendall检验和圆形分布法对斑疹伤寒的发病情况、死亡情况、病死率进行分析,研究我国斑疹伤寒流行的时间、空间、人群分布和诊断现状。结果1950-2021年,我国共报告斑疹伤寒发病数452965例,死亡数7339例,分别在20世纪50年代、60年代和80年代的14年中报告发病数均过万。20世纪90年代以来,斑疹伤寒发病数和发病率大幅降低,流行强度以散发为主,但安徽省、湖北省和湖南省报告发病数呈上升趋势。斑疹伤寒在全年均可发病,但可呈现一定的季节聚集性,我国斑疹伤寒的发病率高峰集中在夏、秋季,不同省份斑疹伤寒的月发病高峰从北方至南方逐渐向前推移。斑疹伤寒发病的男女性别比为1.01∶1(18529∶18366),近年来女性发病数逐渐超过男性;≤9岁人群发病数占比最大(18.9%),≥50岁人群发病数呈增加趋势;发病人群职业以农民为主,并呈逐年增加趋势,学生和散居儿童发病数占比也较大。斑疹伤寒病例从发病日期至诊断日期间隔时间的中位数为6 d,实验室确诊病例占比较低,检测方法为外斐反应为主。结论尽管我国斑疹伤寒流行态势整体好转,仍需警惕局部暴发的风险,其防控工作仍面临很多挑战,需加强斑疹伤寒病原体检测和监测能力建设。
- 韩玲张云飞滕中秋阚飙秦天
- 关键词：斑疹伤寒立克次体流行病学特征
- TaqMan-探针实时荧光定量PCR同时检测立克次体目中7种重要病原菌被引量：2
- 2023年
- 目的建立及优化检测立克次体目中7种重要病原菌的TaqMan-探针实时荧光定量PCR(qPCR)方法,可同步检测并明确感染类型。方法根据普氏立克次体、莫氏立克次体和斑点热群立克次体ompB基因、恙虫病东方体groEL基因、查菲埃立克体16S rRNA基因、嗜吞噬细胞无形体gltA基因和贝氏柯克斯体com1基因序列合成引物和探针,优化反应体系及反应程序至同一方案,对该方法灵敏度、特异性和重复性等进行评价,并使用该方法对模拟样本和实际样本进行检测。结果7种病原菌标准曲线的Ct值与模板拷贝数均呈良好的线性关系(均R^(2)>0.9900),所建立方法最低检测限均为1×10拷贝数/μl且具有良好的特异性。96份蜱虫核酸提取物样本中,1份样本检出贝氏柯克斯体,3份样本检出斑点热群立克次体;80份不明原因发热患者血标本DNA中,1份样本检出恙虫病东方体,2份样本检出斑点热群立克次体。结论本研究基于TaqMan-探针qPCR方法,将7种病原菌反应体系及反应程序优化至同一方案,克服目前不同立克次体目病原菌采用不同的反应体系和反应程序的缺点,可将临床样本中立克次体目的7种重要病原菌精确定位检测至种,明确感染病原菌类型并缩短检测时间,有助于对患者的精准诊治。
- 靳晓晶滕中秋徐佩星孙向荣王文覃新程秦天
- 安徽省马鞍山市蜱携5种病原体的检测研究
- 2024年
- 目的了解安徽省马鞍山市蜱携5种重要病原体的感染情况,并分析其与我国既往检出病原体的亲缘关系。方法在马鞍山市周边13个村庄采蜱642只,采用形态学和线粒体COI基因鉴定蜱种。对于土拉弗朗西斯菌检测16S rRNA,巴尔通体检测ssrA,立克次体检测16S rRNA、ompA和ompB,无形体检测16S rRNA和gltA,柯克斯体检测groEL和rpoB。在公共数据平台选取有代表性的序列,与本研究测序获得的基因序列比对,采用MEGA11.0构建系统进化树。结果在640只长角血蜱中共有36只蜱检出立克次体,其中20只蜱中检出黑龙江立克次体,16只蜱中检出敬信立克次体,2只蜱中检出牛无形体,186只蜱中检出柯克斯体样内共生体。本研究检出的黑龙江立克次体HY2和安徽省B8菌株聚在一个分支,敬信立克次体QL3和山西、江苏的聚在一个分支,而牛无形体JX4和山西省的聚在一个分支。经分析,还有17只蜱存在合并感染。5种病原体在2只龟形花蜱中均没有检测到。结论本研究首次在安徽省长角血蜱中检出敬信立克次体。对于斑点热立克次体和牛无形体,建议当地卫生部门做好相应的防控措施。
- 杨国栋杨锟江良梁吴铭洪颖项可霞何佳龚磊宋丹丹包名家李兴洲秦天王艳华
- 关键词：立克次体无形体长角血蜱系统进化分析
- 无锡市不同场所冷却水中军团菌污染状况和菌株分子生物学特性研究被引量：4
- 2012年
- 目的了解无锡市不同场所冷却水中军团菌污染状况和菌株分子生物学特性。方法于2009-2010年对无锡市城区56家场所的冷却水采集平行水样各500ml，共112份，进行军团菌检测和定量培养，对分离到的菌株进行血清分型、PFGE分型、基因序列分型（SBT），并测定菌株在细胞内的生长能力。结果56家场所的冷却水水样中，军团菌阳性率为39．3％（22／56），总计分离到29株军团菌，血清型包括LP1、LP3、LP5、LP6，以LP1为主，占65．5％（19／29）。29株军团菌PFGE分型得到17个不同带型，其中PFGE带型各异的10株军团菌SBT分型亦不相同。以LPl菌株（ATCC33152）为参照，WX2011062（LP6）、WX2011067（LP5）细胞内繁殖能力较强[感染当天细胞内菌量分别为（5．5±1．32）×10^5、（3．9±0．60）×10^5、（7．8±0．76）×10^5CFU／ml，感染第3天细胞内菌量分另1为（58．3±1．61）×10^5、（2700．0±655．74）×10^5、（3066．7±208．17）×10^5CFU／ml]。结论无锡市不同场所冷却水普遍存在军团菌污染，菌型呈现基因多态性，存在巨噬细胞内生长能力较强的菌株。
- 张琦陈茸肖勇刘斌秦天邵祝军周伟杰
- 关键词：军团菌分子分型细菌分型技术
- 基于蛋白质组学技术的新型冠状病毒感染诊断研究进展
- 2021年
- 2020年,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)席卷全球,对全球人民的生命健康造成重大危害并给全球公共卫生系统带来巨大负担。到目前为止,核酸检测是新型冠状病毒肺炎诊断的主要方法和标准,同时其他技术方法也竞相开展,蛋白质组学技术即为其一。该技术在疾病机制研究、诊断方法开发、病原鉴定等领域已广泛应用,在SARS-CoV-2感染诊断中则主要针对病毒颗粒和感染病毒后人体体液的蛋白质组。其中,基于病毒颗粒的蛋白质组学在早期诊断中具有巨大潜力,而基于体液的蛋白质组学不仅可用于早期诊断,在监测感染进程,甚至预测病程走势和评价预后恢复等方面均有良好的应用前景。本研究就全球范围内蛋白质组学技术在SARS-CoV-2感染诊断中的研究及其应用进行综述和展望。
- 李天一王磊秦天张建中阚飙徐建国肖迪
- 关键词：蛋白质组学质谱新型冠状病毒生物标志物
- 银色棒状杆菌健康携带株耐药性及毒力基因分析
- 2022年
- 目的 首次从健康人呼吸道分离到银色棒状杆菌,可进一步探究这一细菌的耐药性和致病性获得此种细菌更加全面的信息。方法 采用生化鉴定和16S rRNA全长基因序列分析法对2020年大学生健康体检中采集的咽拭子样本进行银色棒状杆菌的分离鉴定,同时对鉴定菌株进行抗生素耐药性测定、基因组测序和耐药基因、毒力基因分析。结果 从717份健康大学生咽拭子分离到5株银色棒状杆菌。药敏结果表明这5株菌均对青霉素、莫西沙星、庆大霉素耐药;4株菌对环丙沙星、克林霉素耐药,存在多重耐药情况。基因组序列分析发现,对克林霉素耐药的菌株均含有耐药基因erm(X),分离菌株携带有Sigma A、GroEL(Hsp60)/Cpn60.2、Nucleoside diphosphate kinase(NDK)、EF-Tu、 MprA/B、 DtxR以及Irp6和HmuTUV等毒力因子,致病性分析结果表明5株银色棒状杆菌均携带glyA1、mihF、CarD等10个与结核分枝杆菌的毒力密切相关的基因。结论 首次从健康人咽部分离到银色棒状杆菌,其携带耐药及毒力基因。
- 连星星秦天董魁李振军杨才新蒋艳李银妹杨晶徐建国
- 关键词：耐药性条件致病菌鼻咽部
- 荧光PCR检测军团菌方法的优化及应用被引量：8
- 2011年
- 军团菌病（Legionellosis）是由军团菌（Legionella）引起的一种急性呼吸道疾病。有超过20个血清型的军团菌可以引起人类疾病。目前军团菌检测方法主要是培养检测法和针对嗜肺军团菌检测的PCR法，
- 秦天胡光春任红宇朱兵清刘尊玉邵祝军
- 关键词：军团菌病荧光PCR急性呼吸道疾病嗜肺军团菌
- 206株中国环境分离嗜肺军团菌1型菌株基因序列分型研究被引量：2
- 2015年
- 目的对中国不同自然环境来源分离的嗜肺军团菌血清1型菌株进行分子分型和种群结构分析。方法应用7个基因（fla A、pil E、asd、mip、momp S、pro A、neu A）序列分型方法（Sequence based typing,SBT）对不同环境来源的206株嗜肺军团菌血清1型菌株进行分型研究,通过查询嗜肺军团菌SBT数据库（http：//www.ewgli.org）和用Bio Numerics软件构建最小生成树揭示菌株的分子分型和种群结构特征。结果 206株菌分成54个ST型（IOD=0.7205）。其中49株温泉水分离株分成25个ST型（IOD=0.9498）,各位点Nei指数0.7721~0.8563;130株冷却塔水分离株分成31个ST型（IOD=0.6453）,各位点Nei指数为0.4227~0.4970;27株管道水分离株分成3个ST型（IOD=0.1453）,各位点Nei指数为0.1425~0.1453。ST1型含108株菌,占52.4%,是优势带型。54个ST型形成5个克隆群。通过中国菌株和其他20个国家的菌株综合分析,共计1199株菌分成304个ST型,形成21个序列群。其中ST-1型为全球优势型别,其余型别和序列群呈地区性分布特征。结论中国环境分离的嗜肺军团菌1型菌株具有高度复杂的基因多态性和种群结构,其中ST1是我国也是全球环境菌株的优势型别。
- 任红宇周海健李马超朱兵清邵祝军秦天
- 关键词：嗜肺军团菌
