熊英
- 作品数：139 被引量：483H指数：10
- 供职机构：江西省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：江西省卫生厅科技计划项目江西省卫生厅基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学轻工技术与工程更多>>
- 江西省2009年至2012年甲型H3N2流感病毒耐药性分析被引量：6
- 2014年
- 目的分析江西省2009-2012年甲型H3N2流感病毒M2以及NA基因的特点,掌握其耐药情况,为临床治疗和疾病控制提供参考。方法从江西省流感监测网中随机选择19株甲型H3N2流感病毒,经核酸提取和one-step RT-PCR扩增M以及NA基因片段,双向序列测定,采用DNAStar5.0和Mage4.0序列分析软件分析M2以及NA基因特征以及耐药性位点。结果 19株毒株M2基因31位氨基酸均由丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N);所有毒株NA蛋白催化活性位点和辅助位点均未发生氨基酸替换。结论 19株毒株均对金刚烷胺类药物耐药,对流感病毒神经氨酸酶抑制剂药物均敏感,但仍应加强对流感病毒的耐药性监测。
- 李健雄熊英施勇龚甜周珺徐刚
- 关键词：M2耐药性
- 一种检测人腺病毒3型的荧光RPA引物和探针及其应用和检测方法
- 本申请涉及一种检测人腺病毒3型的荧光RPA引物和探针及其应用和检测方法，所述引物和探针是基于人腺病毒3型Hexon基因上Loop1区域设计的，在稳定的扩增体系中，仅对人腺病毒3型进行特异性的扩增，而不对其他型别的人腺病毒...
- 张艳妮肖芳刘师文吴杨博文刘晓庆熊英李健雄
- rRT-PCR法在脊髓灰质炎病毒型内鉴定中的应用被引量：1
- 2015年
- 目的应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(rRT-PCR)对脊髓灰质炎病毒(PV)进行型内鉴定,并对该方法进行评估。方法采用世界卫生组织(WHO)推荐的脊髓灰质炎ITD和VDPV rRT-PCR方法对江西省既往分离的14株脊髓灰质炎毒株和2013年分离的15株脊髓灰质炎毒株进行ITD和VDPVs筛选,并将检测结果与毒株的VP1编码区核苷酸序列测定结果进行比较分析。结果 ITD rRT-PCR的实验结果除1株毒株漏检外,其余与毒株的VP1编码区序列测定结果完全相符,VDPV rRT-PCR的结果与VP1编码区序列测定结果不完全相符,共有14株Ⅱ型脊髓灰质炎病毒疫苗类似株被错判为VDPV株,11株Ⅲ型VDPV株错判为疫苗类似株。结论对脊髓灰质炎型内进行rRTPCR鉴定的方法可以替代中和试验的常规检测方法,但不能完全取代测序技术用于脊髓灰质炎VDPV的鉴定。
- 李建雄熊英施勇刘师文刘晓庆肖芳
- 关键词：实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应脊髓灰质炎病毒
- 2010年江西省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析被引量：3
- 2015年
- 为鉴定引起2010年江西省急性出血性结膜炎（Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC）疫情的病原体,并对其进行基因进化分析,本研究采集了20份门诊AHC患者眼结膜拭子,对其进行病毒分离,随后通过逆转录-聚合酶链式反应（Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR）方法分别检测阳性分离物中肠道病毒70型（Human enterovirus type 70,EV70）、柯萨奇病毒A24变异株（Coxsackievirus A24variant,CV-A24v）和腺病毒。并对CV-A24v分离株进行VP1区和3C区全序列测定,分析其与全球流行CV-A24v的基因进化关系。20份标本中有10份病毒分离阳性,PCR检测证明引起本次AHC流行的病原体为CV-A24v。基于3C区构建的基因进化树表明10株江西CV-A24v与全球2010年后分离到的其它CV-A24v同属于GenotypeⅣ基因型的Cluster 5群（GⅣ-C5）,而且在GⅣ-C5内江西CV-A24v又分属于A和B两个传播链。基于VP1区构建的基因进化树将全球2000年后分离到的CV-A24v分成5组Group1~5（G1~5）,江西CV-A24v属于G5,这些毒株在VP1区进化树中同样分属于A和B两个传播链。本研究表明2010年至少有两个CV-A24v传播链在江西同时流行。VP1区基因进化树对全球2000年后分离到的CV-A24v的组群划分与3C区基本一致,而且与3C区呈现同样显著的年代聚集性。
- 严冬梅熊英张勇杨倩张曙霞龚甜祝双利王东艳朱晖许文波
- 关键词：急性出血性结膜炎
- 江西省2013年疑似麻疹病例病原学实验室监测结果分析被引量：4
- 2015年
- 目的分析2013年江西省疑似麻疹病例病原学实验室检测结果,为进一步消除麻疹提供科学依据。方法采用实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(real-time RT-PCR)方法,对2013年疑似麻疹病例咽拭子标本进行麻疹病毒核酸检测,对核酸阳性标本进行麻疹病毒分离培养,并对分离到的麻疹毒株进行基因型别鉴定。结果 2013年全省共采集麻疹疑似病例咽拭子标本1 197份,检出麻疹核酸阳性55份,阳性率为4.59%;共获得16株麻疹毒株,分离率为29.09%,均为H1a基因型。结论江西省需要进一步提高麻疹病例咽拭子标本采集率和采集质量,充分阐述麻疹病毒基因型别特征,为努力实现消除麻疹目标提供实验室依据。
- 龚甜熊英张艳妮施勇徐刚
- 关键词：麻疹病原学
- 江西省风疹病毒E1基因特性与疫苗株基因差异分析
- 2015年
- 目的研究江西省2006年-2012年风疹病毒毒株的基因特性,为江西省的风疹防治策略提供科学依据。方法采集风疹疑似病例咽拭子标本进行病毒分离,对分离到的风疹病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒E1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit 7.0、Mega 3.0生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析。结果江西省2006年-2012年共分离到13株风疹毒株,均为麻风疹1E基因型,为本省风疹病毒本土野毒株。各分离株之间E1基因核苷酸同源性为97.8%～100%,氨基酸同源性为98.8%～100%;与疫苗株BRDⅡ株（RVi/Beijing.CHN/80）核苷酸同源性为89.3%～89.7%,氨基酸同源性为98.8%～99.6%,大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列比较保守。结论江西省2006年-2012年风疹病毒分离株为1E基因型,我国风疹疫苗株BRDⅡ株在分子水平上对本省疫苗保护效果较好。
- 龚甜熊英张艳妮吴建英朱丰秀刘丽
- 关键词：风疹病毒E1基因
- 江西省汉坦病毒分离及其S和M基因特征分析被引量：3
- 2015年
- 目的对2011年江西省采集的鼠肺标本进行汉坦病毒的分离鉴定,了解分离病毒株的基因特征。方法采用Vero-E6细胞对阳性鼠肺标本进行病毒分离,采用直接免疫荧光法和RT-PCR方法对毒株进行鉴定。扩增分离株的S、M片段基因进行克隆测序。运用DNAstar软件包和MEGA3.1软件对序列进行分析。结果从15份标本分离到2株来自褐家鼠的汉城型汉坦病毒。对其中1株病毒的S、M片段进行了克隆和序列测定,其中S片段含1 772个核苷酸,编码429个氨基酸;M片段含3 651个核苷酸,编码1 133个氨基酸。经核苷酸和氨基酸同源性分析,新分离株与国内外汉城型病毒核苷酸同源性94.8%~98.0%,氨基酸同源性98.2%~99.6%。与汉城型标准株80-39株相比,S片段仅1个氨基酸位点发生变异;M片段有9个氨基酸位点发生变异,糖基化位点的数目和位置没有发生变化。结论从江西省褐家鼠分离到两株汉城型病毒,病毒基因变异较小,型别相对稳定。
- 刘师文徐刚施勇龚甜李健雄刘晓庆熊英
- 关键词：汉坦病毒病毒分离M基因S基因
- 三种实验室检测方法在疟疾检测中的应用比较被引量：3
- 2017年
- 目的探讨三种实验室检测方法对疟疾检测的应用价值。方法分别采用传统镜检法、巢式聚合酶链反应(PCR)法及实时荧光(Real-Time)PCR法,对江西省2012年-2014年的61份疟疾疑似病例血样进行检测。结果巢式PCR法和Real-Time PCR法的结果一致,与镜检结果有17份样本不一致。结论巢式PCR法和Real-Time PCR法检测疟疾感染具高度敏感性和特异性,对疟疾鉴别诊断和明确诊断具有重要价值。
- 施勇龚甜李健雄肖芳周珺熊英
- 关键词：疟疾巢式聚合酶链反应镜检法
- 江西省2007年麻疹病毒分离株血凝素基因序列分析被引量：3
- 2009年
- 目的：研究江西省2007年麻疹病毒流行株的基因特性,为江西省的麻疹防治策略提供科学依据。方法：采用RT-PCR方法,对2007年麻疹暴发疫情分离到的麻疹病毒扩增血凝素（hemagglutin,H）基因,并对扩增出的核苷酸序列进行测定和分析。结果：2007年江西省3株麻疹病毒分离株均为麻疹H1基因型,属于我国麻疹病毒的优势株。各株分离株之间H基因氨基酸的同源性为99.0%-99.7%;与中国疫苗株沪191株的H基因氨基酸序列比较,其同源性为97.6%-98.2%。结论：江西省2007年麻疹病毒分离株为H1基因型。
- 龚甜熊英施勇刘丽萍方晓艳
- 关键词：麻疹病毒血凝素基因
- 基于纳米孔靶向全基因测序技术的新冠肺炎病例快速鉴定研究
- 2024年
- 目的探索快速识别新型冠状病毒的方法,为新冠肺炎防控提供技术支撑。方法分别运用基于三代纳米孔测序技术平台MinION Mk1C和基于二代测序技术平台Ion Torrent S5的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)靶向全基因组测序技术对1例境外输入新冠肺炎确诊病例进行基因组测序。使用artic-ncov2019软件、CLC Genomics Workbench(Version 21.0)软件和DNAstar软件等进行数据处理和分析。结果基于三代纳米孔测序技术平台MinION Mk1C和基于二代测序技术平台Ion Torrent S5分别在7 h和30 h左右获得SARS-CoV-2全基因组数据,分别为29848bp和29801bp,两者共同29801bp数据部分同源性100%,经分析为新冠病毒B.1.1.7变异株。结论在对该病例样本的全基因测序中,基于三代纳米孔测序技术平台MinION Mk1C的SARS-CoV-2靶向全基因组测序技术将检测周期缩短至7 h左右,能够实现快速、准确地对SARS-CoV-2进行实时测序。
- 李健雄施勇徐刚肖大瑾刘师文熊英龚甜
