沈彤 作品数:19 被引量:82 H指数:5 供职机构: 上海市血液中心 更多>> 发文基金: 上海市自然科学基金 上海市卫生局科研基金 上海市医学领先专业重点学科基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 更多>>
使用Taqman PCR技术建立人类血小板抗原-1~5、15分型体系 被引量:1 2011年 目的了解上海地区单采血小板献血人群HPA-1~5、15多态性分布,分析评估新的分型技术。方法利用TaqMan PCR技术对500份上海地区单采血小板供者标本进行HPA-1~5、15抗原系统等位基因分型,并随机抽取100份标本使用PCR-SSP技术进行比对。结果 HPA各等位基因频率分别为HPA-1a:0.999,HPA-1b:0.001,HPA-2a:0.953,HPA-2b:0.047,HPA-3a:0.582,HPA-3b:0.418,HPA-4a:0.999,HPA-4b:0.001,HPA-5a:0.988,HPA-5b:0.012,HPA-15a:0.524,HPA-15b:0.476;有1份标本HPA-5等位基因与SSP检测结果产生差异。结论上海地区HPA各等位基因频率与国内各地区人群分布无明显差异,与中国汉族人群HPA分布情况基本吻合,实验数据经验证符合Hardy-Weinberg平衡定律,实验结果准确可靠;HPA-5差异经测序验证判断可能由PCR-SSP非特异扩增所致;TaqMan技术在HPA抗原系统分型应用中特异性高,反应时间短,具有良好的应用前景,是现有技术方法的一种重要补充。 沈彤 赵玉林 刘熔增 刘达庄关键词:HPA TAQMAN PCR 基因频率 多态性 汉族人群Tap1和Tap2基因座等位基因频率和基因型频率分布 被引量:1 2009年 本研究分析汉族人群tap1和tap2基因座等位基因和基因型频率的分布及意义。运用TaqManPCR分型技术调查339例中国健康汉族人群随机样本tap1(transporter associated with antigen processing)和tap2基因座等位基因频率和基因型频率分布,并计算个体鉴别力、累积鉴别力、多态性信息含量、无偏倚期望杂合性、观察杂合性等遗传参数。结果表明:共有5种tap1等位基因(tap1*0101、020101、020102、0301和0401)和4种tap2等位基因(tap2*0101、0102、0103和0201)被检出,tap1实际检出基因型8种,占理论基因型的53.3%,tap2实际检出基因型6种,占理论基因型60%。Tap1和tap2基因型分型结果符合Hardy-Weinberg定律(p>0.05)。Tap1*0101(79.79%)和tap2*0101(82.74%)在中国汉族人群中分布最广。结论:Tap1*0101和tap2*0101在汉族人群中分布最广。Tap1和tap2基因座具有一定的信息量和个体鉴别能力,可用于人类遗传学、遗传疾病基因连锁分析、法医学亲子鉴定和个体识别等研究领域。 沈武 沈彤 印彪 郑皆伟 刘达庄 冯明亮关键词:汉族人群 基因型频率 SNPs组合鉴定TAP等位基因的方法 本发明涉及等位基因的鉴定方法,公开了SNPs组合鉴定TAP等位基因的方法,包括下列步骤:检测待测样本TAP基因上TAP1的第599、762、997、1910、1943和1983位点碱基的SNP分型获得TAP1的SNP分型... 冯明亮 刘达庄 印彪 沈彤 黄慧文献传递 利用HPA-1~3,5和15系统多态性估算中外不同人群遗传距离 2008年 依据血小板同种抗原5个系统的遗传多态性,采用聚合酶链反应序列特异性引物技术,对1000名中国汉族无关献血者HPA-1~3,5和15系统进行基因分型,计算基因频率。使用DISPAN软件及PHYLIP软件计算不同群体间遗传距离并绘制系统树。系统树显示,亚洲人群先与欧洲人群相聚,之后再与非洲人群相聚,非洲人群位于系统发生树的最顶部;印度人群处于亚洲人群与欧洲人群之间;南美洲巴西白人与欧洲人群聚在一起;大洋洲的波利尼西亚人与亚洲人群聚在一起。此研究从一个侧面证明了人类“非洲起源说”,印证亚洲人群由南亚向东南亚再向东亚迁徙的路线,并推断出欧洲人群由南欧向北欧、西欧迁徙的线路。HPA能有效估算不同人群间遗传距离,分析人类迁徒过程,HPA可作为遗传标记应用于人类进化的研究。 冯明亮 黄慧 沈彤 张晰 印彪 杨建豪 刘达庄关键词:系统树 单采血小板输血反应调查及其输注无效解决策略 被引量:31 2008年 目的调查单采血小板输血反应发生率,并探讨血小板输注无效解决策略,以提高血小板输注的安全性和有效性。方法调查上海地区5家临床医院单采血小板输注情况,统计紫癜、发热、寒颤等输血反应发生比例,并对这些发生输血反应的样本进行HLA和HPA抗体筛选。对抗体阳性患者进行HLA和HPA分型,并从建立的已知HLA和HPA型单采血小板供者库中寻找HLA或HLA交叉反应抗原组(CREG)和HPA相同供者,进行血小板同型(或配合型)输注。结果调查期间5家医院共输注单采血小板2194袋,发生各类输血反应53例,输血反应发生率2.42%,HLA和HPA抗体检测阳性率为24.5%。施行同型(或配合型)输注3例,其中1例24h血小板回收率超过80%。结论与手工混合血小板相比较,输注单采血小板可显著降低输血反应的发生。临床血小板同型(或配合型)输注策略,对提高血小板输注的安全性和有效性有着积极意义。 张晰 冯明亮 沈彤 沈伟 王健莲 刘达庄关键词:单采血小板 输血反应 HLA HPA 中国汉族人群HLA-DM多态性与强直性脊柱炎疾病关联分析 2012年 目的比较中国汉族人群强直性脊柱炎(AS)与健康对照HLA-DMA/HLA-DMB各SNP位点及等位基因多态性,分析可能的AS疾病易感位点及基因。方法选取110名AS患者和1 000名健康无关献血者,利用Taq-Man PCR技术对7个DMA和DMB SNPs(single nucleotide polymorphisms)位点进行了基因分型,运用SPSS软件及Arlequin3.1软件统计基因频率和单体型相关参数。结果 AS组DMA*01∶02基因频率(19.55%)显著低于对照组(28.05%),AS组DMA*01∶02-DMB*01∶01单体型频率(17.51%)也显著低于对照组(26.87%);AS组与对照组DMA p496和DMB p590 SNP位点多态性、DMA*01∶02等位基因以及DMA*01∶02-DMB*01∶01单体型分布差异有统计学意义(P<0.05)。结论 DMA*01∶02等位基因和DMA*01∶02-DMB*01∶01单体型可能对于AS疾病具有保护性作用,未来有必要在其他人群中进一步确认并研究其基因功能。 刘熔增 冯明亮 沈彤 赵玉林 刘达庄关键词:中国汉族 HLA-DM 多态性 强直性脊柱炎 疾病相关性 HPA和HLA已知型的血小板供者库建立及应用 目的:开展血小板同型或配合性输注是预防和治疗免疫性血小板输注无效(PTR)的良策。为此建立一定规模的HPA和HLA已知型血小板资料库,为临床提供匹配的单采血小板,是血小板输注安全有效的保障。方法:对所有供者库单采血小板进... 陆萍 沈彤 沈伟 凌冰 冷闻彪 孟妍 范文明 管珏 黄晨佳 杨军 周国平 刘达庄关键词:临床用血 汉族人群血小板同种抗原HPA-3、HPA-9w多态性分布 被引量:5 2007年 目的研究我国不同汉族人群血小板同地区种抗原HPA-3、HPA-9w多态性。方法采用聚合酶链反应.序列特异性引物(polymerase chain reaction-sequence specific primers,PCR-SSP)技术对1000名来自不同省份汉族无关献血者进行HPA-3、HPA-9w抗原基因分型。结果在调查的1000名汉族人群中11PA-3a、1-1PA-3b基因频率分别为0.5935和0.4065,HPA-9全为a/a纯合子。经X^2检测,符合Hardy-Weinberg平衡。不同地区汉族人群之间比较,广东省与陕西、黑龙江、浙江、云南、江苏5省的HPA-3多态性分布差异有统计学意义,其余省份之间多态性分布差异无统计学意义。中国汉族人群与越南人、澳大利亚人HPA-3的多态性分布差异有统计学意义。结论在随机输血中供受者HPA-3抗原不配合比例达0.3661,这为研究同种免疫血小板减少症、开展血小板同型输注提供了理论基础。 黄慧 冯明亮 沈彤 沈伟 印彪 刘达庄关键词:基因频率 血小板输注 中国汉族人群人类血小板抗原HPA-15(Gov)多态性调查 被引量:19 2006年 目的研究中国汉族人群人类血小板抗原HPA15(Gov)系统多态性,评估其在血小板配型输注中的作用。方法采用PCRSSP技术对1000名来自不同省份汉族无关献血者进行HPA15系统基因分型。结果HPA15在所调查的7个省份汉族人群中的分布差异无显著性意义,在1000名汉族中HPA15a和15b基因频率分别为0.5320和0.4680,与HardyWeinberg平衡吻合;与其它种族的HPA15分布相比较,也无显著性差异。在随机输血中HPA15a和15b抗原不配合的机会分别为0.1711和0.2029。结论本调查数据表明,随机输血中供受者HPA15抗原不配合比例在中国汉族人群中高达37%,这对研究同种免疫血小板减少症和开展血小板同型输注具有指导意义。 冯明亮 沈伟 黄慧 王健莲 沈彤 张晰 孔祥荣 杜可明 杨建豪 刘达庄关键词:抗原 输血 基因频率 汉族人群人类血小板抗原-1系统a/b/x等位基因多态性调查 被引量:2 2010年 目的:调查HPA-1抗原系统a/b/x等位基因在汉族人群中的多态性分布。方法:利用聚合酶链反应-序列特异引物技术(PCR-SSP)技术对1000例中国无关健康汉族人群样本进行HPA-1抗原系统等位基因分型,随机抽取部分样本进行测序验证。结果:本次调查共检测到HPA-1a/a基因型988个,HPA-1a/b基因型12个,未检测到HPA-1x等位基因。结论:HPA-1抗原系统在中国汉族人群中以HPA-1a等位基因为主(99.4%),HPA-1b分布频率较低(0.6%)。目前国内尚未发现HPA-1x等位基因,有必要进一步扩大样本对不同地区、不同民族进行多态性调查。 沈彤 冯明亮 印彪 赵玉林 刘熔增 刘达庄关键词:中国汉族人群 HPA-1 等位基因 多态性