杜文佳 作品数:10 被引量:2 H指数:1 供职机构: 兰州大学第二医院 更多>> 发文基金: 甘肃省应用技术研究与开发专项计划项目 国家自然科学基金 甘肃省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
基于生物信息学的椎间盘退变miRNA-mRNA调控关系的分析 2022年 目的:通过使用生物信息学方法分析高通量芯片,揭示与椎间盘退变(IDD)相关的信号通路和miRNA-mRNA的调控关系。方法:首先,从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载了IDD相关的两个数据集:GSE56081和GSE116726。使用R编程环境的limma软件包鉴定出IDD样本和正常样本的差异表达基因(DEGs)和差异表达miRNA(DE-miRNAs),并且对DEGs进行了GO(Gene Ontology)功能富集分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析,以鉴定IDD中DEGs相关的生物学功能。通过miRTarBase数据库筛选出DE-miRNAs经过试验验证的靶基因,并将靶基因与DEGs取交集,最终构建高度可信的miRNA-mRNA调控关系网络,通过Cytoscape软件将其可视化。结果:总共筛选出523个DEGs和858个DE-miRNAs。GO分析表明,DEGs可能参与的生物过程(BP)包括生物调节、代谢过程、对刺激的反应、多细胞生物过程、细胞通讯、定位等;细胞成分(CC)主要涉及细胞膜、细胞核、含蛋白质复合物、细胞外基质、细胞投射、细胞骨架等;分子功能(MF)主要包括蛋白质结合、离子结合、核酸结合、转移酶活性、水解酶活性、结构分子活性等。KEGG途径分析表明,鉴定出的DEGs可能主要通过TGF-β信号通路、TNF信号通路、雌激素信号通路、PI3K-Akt信号通路四条通路影响IDD的进程。最后分析出32对miRNAs-mRNAs的调控关系。结论:本研究鉴定了可能参与IDD的信号通路和高度可信的miRNA-mRNA调控关系,为研究IDD的分子机制提供了新的理论依据和研究方向。 杜文佳 晏丽 李延宏关键词:椎间盘退变 差异表达基因 生物信息学 一种新型防侧翻型骨科用助行器 本实用新型公开了一种新型防侧翻型骨科用助行器,所述助行器本体包括两侧的均呈n型的左支撑架和右支撑架、用于连接左支撑架和右支撑架的顶端的连接板和靠近底端的连接杆;所述左支撑架和右支撑架上均设有加固杆,其与连接杆设于同一平面... 李延宏 杜文佳 马延超 王景文献传递 一种可伸缩调节的骨科用夹板 本实用新型公开了一种可伸缩调节的骨科用夹板,包括半圆弧状的上夹板和下夹板,二者的一端通过合页铰接,另一端上分别固定有固定耳,该固定耳通过螺栓固定连接;所述上夹板包括设有中空开孔的第一板和第二板;该第二板包括上下叠放且相对... 李延宏 杜文佳 马延超 王景文献传递 Jasplakinolide对氧糖剥夺/复氧星形胶质细胞AQP4蛋白表达的影响 目的 探讨不同浓度微丝聚合剂(Jasplakinolide,JSK)是否可以通过调节大鼠脊髓星形胶质细胞AQP4基因蛋白表达,从而减轻氧糖剥夺/复氧(oxygen-glucose deprivation and reox... 杜文佳关键词:星形胶质细胞 微丝 水通道蛋白4 重构大鼠脊髓星形胶质细胞骨架对AQP4和Kir4.1基因表达影响的实验研究 目的:探讨大鼠脊髓星形胶质细胞体外分离、纯化及培养条件,并对其进行鉴定;探讨不同浓度微丝聚合齐Jasplakinolide (JSK)和不同浓度的微丝解聚剂细胞松弛素D(Cytochalasin D, Cyt D)对大鼠... 杜文佳关键词:星形胶质细胞 细胞骨架 水通道蛋白 文献传递 细胞松弛素D对大鼠脊髓星形胶质细胞水通道蛋白和内向整流性钾通道4.1基因表达的影响 被引量:2 2014年 目的探讨不同浓度细胞松弛素D(CytD)对大鼠脊髓星形胶质细胞骨架重构,水通道蛋白(AQP)1、AQP4及内向整流性钾通道4.1(Kir4.1)基因表达的影响。方法原代培养大鼠脊髓星形胶质细胞,加CytD 0.05μg/ml、0.10μg/ml、0.20μg/ml、0.40μg/ml、0.80μg/ml和1.00μg/ml共培养2 h、12 h和24 h。MTT法检测细胞增殖情况;鬼笔环肽联合Hoechst 33342套染后激光共聚焦显微镜下观察共培养2 h后细胞骨架重构情况;RT-PCR法检测共培养2 h时AQP1、AQP4和Kir4.1 mRNA表达水平。结果细胞生存率随CytD浓度升高和作用时间延长而减少。CytD使大鼠脊髓星形胶质细胞微丝发生解聚、弯曲,但极性未失。CytD 0.05μg/ml、0.10μg/ml、0.20μg/ml和0.40μg/ml上调AQP1、AQP4和Kir4.1 mRNA表达。结论适当浓度CytD可以重建星形胶质细胞骨架,上调大鼠脊髓星形胶质细胞AQP1、AQP4和Kir4.1基因表达。 杜文佳 汪玉良 党跃修 雷栓虎 黄良增 汪静 马靖琳 安丽萍关键词:星形胶质细胞 细胞松弛素 细胞骨架 水通道蛋白 脊髓 一种助行器专用肘部支撑架 本实用新型公开了一种助行器专用肘部支撑架,包括肘托和支撑架;所述支撑架为三角状,其包括呈L状的第一杆和第二杆以及一连接在第一杆和肘托之间的第三杆;所述第一杆的一端通过具有穿孔的第一套管连接在助行器的前侧支腿上,所述第一杆... 李延宏 杜文佳 马延超 王景文献传递 一种骨科手术拉钩用辅助照明装置 本实用新型公开了一种骨科手术拉钩用辅助照明装置,包括截面为U型的壳体和内置纽扣电池的电池盒;所述壳体包括顶面和底面,二者中部的空腔卡在拉钩的侧壁上;所述顶面为中空体,其内设有多个间隔设置的LED灯,LED灯通过导线连接设... 李延宏 杜文佳 马延超 王景文献传递 微丝聚合剂重构大鼠脊髓星形胶质细胞骨架对水通道蛋白4与K+通道蛋白4.1基因表达的影响 被引量:1 2014年 目的:探讨不同浓度微丝聚合剂(Jasplakinolide,JSK)对大鼠脊髓星形胶质细胞水通道蛋白4(aquaporins-4,AQP4)和K+通道蛋白4.1(potassium ion channel protein-4.1,Kir4.1)基因表达的影响。方法:分离培养原代大鼠脊髓星形胶质细胞并鉴定,采用浓度为0.05μg/ml、0.10μg/ml、0.20μg/ml、0.40μg/ml的JSK干预细胞2h。噻唑蓝比色法(3-4,5-Dimethylthiazol-2-yl-25-diphenyltetrazolium brom,MTT)检测细胞的增殖情况,激光共聚焦显微镜观察细胞骨架的变化和Real-time PCR法检测AQP4和Kir4.1 mRNA表达的变化。结果:0.05μg/ml、0.10μg/ml、0.20μg/ml和0.40μg/ml浓度的JSK在干预细胞2h时与空白对照组相比对细胞的增殖无明显差异(P>0.05),各浓度间相比无统计学意义。激光共聚焦显微镜观察0.05μg/ml、0.10μg/ml和0.20μg/ml浓度的JSK可以使得微丝空间结构发生重构,而0.40μg/ml浓度则使细胞微丝发生破坏。Real-time PCR检测显示,0.05μg/ml、0.10μg/ml、0.20μg/ml和0.40μg/ml浓度的JSK均能显著降低AQP4和Kir4.1基因的表达,并与对照组相比有统计学意义(P<0.05),且0.05μg/ml、0.10μg/ml、0.20μg/ml和0.40μg/ml浓度间相比也有统计学意义。结论:0.05μg/ml、0.10μg/ml和0.20μg/ml浓度的JSK可使大鼠脊髓星形胶质细胞微丝发生重构且可以下调AQP4和Kir4.1基因的表达。 杜文佳 党跃修 汪玉良 雷栓虎 黄良增 汪静 马靖琳 安丽萍关键词:微丝 Piezo1介导的流体剪切应力通过增强细胞骨架重组上调成骨细胞增殖 2022年 目的:最近研究发现的Piezo1机械敏感性离子通道或许在骨质疏松的发生、发展过程中起相关作用。本研究探索流体剪切力(FSS)是否通过Piezo1离子通道对MC3T3-E1成骨细胞增殖产生作用。方法:使用本课题组自行研究设计的FSS加载装置,对MC3T3-E1成骨细胞加载不同强度(3、6、9、12、15、18dyne/cm2)流体剪切力,使用Western Blot方法观察促进Piezo1蛋白表达的最佳FSS条件,探究激活剂(Yoda1)和抑制剂(GsMTx4)对Piezo1表达的影响。使用Western Blot及EdU染色观察成骨细胞增殖变化。通过鬼笔环肽染色、免疫荧光以及EdU染色探究细胞骨架对成骨细胞增殖的影响。结果:在不同强度循环流体剪切力下,6dyne/cm2时成骨细胞内Piezo1蛋白表达量最高。激活剂Yoda1浓度在20μM作用3h上调细胞内增殖相关蛋白PCNA、MCM2、Cyclin D1表达,细胞增殖率明显增加;抑制剂GsMTx4浓度在0.5μM作用2h下调细胞内增殖相关蛋白PCNA、MCM2、Cyclin D1表达,细胞增殖率明显下降。而使用胞松驰素D(Cyto D)抑制细胞骨架蛋白后会进一步抑制成骨细胞的增殖。结论:(1)对成骨细胞加载6dyne/cm^(2)循环FSS45min后,细胞内Piezo1蛋白表达最高;(2)Piezo1介导的FSS通过上调细胞骨架重组促进MC3T3-E1成骨细胞增殖。 杜文佳 何良志 刘众成 詹红伟 姜金关键词:流体剪切力 成骨细胞 细胞增殖 细胞骨架