徐琼 作品数:14 被引量:27 H指数:3 供职机构: 青海省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
2019-2020年西宁地区丙型肝炎病毒感染者基因序列分析 2022年 目的了解2019—2020年西宁地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染者HCV感染株基因型。方法采集2019—2020年青海省疾病预防控制中心门诊HCV感染者抗体阳性血清108份,采用实时荧光定量PCR法(RT-PCR)进行HCV-RNA阳性筛查,对HCV-RNA阳性标本进行RT-PCR特异性引物扩增后用直接测序法进行HCV基因片段的测序。结果108份HCV抗体阳性血清标本中共检测到77份阳性血清,经过RT-PCR扩增,共检出54份阳性标本,测序后得到25份核苷酸片段,再经序列测序进化分析得到2a型17份,占总数的68%;1b型8份,占总数的32%。2a型分布于两个不同的分支上,其中一个分支与ZX 2005-197株(KP 721897.1)在同一分支上,此柱为有明显输血史感染柱,另一分支与广州GZ 0160(206047)和KM 26(KF 586099)WL 14(KF 586224.1)的自愿献血者感染株为同一分支;8份1b型分布于3个不同的分支,其中一组与上海的标准株PR 50(HQ 912957.1)在同一分支上,另一组与美国的毒株KY 565218.1亲源关系较近,其余的序列单独形成一个分支。结论西宁地区HCV感染基因型以2a型为主,其次为1b型,此次检测结果与西宁地区其他关于HCV感染主要基因型研究报道有所不同。 徐琼 刘桂香 赵生仓 唐志坚 李崇亥 田登关键词:丙型肝炎病毒 实时荧光定量PCR 基因测序 青海省2016-2018年婴幼儿星状病毒流行情况和基因型分析 2022年 目的了解2016—2018年星状病毒基因型流行情况,为防治星状病毒感染引起的疾病提供实验依据。方法用星状病毒实时荧光PCR试剂盒进行星状病毒阳性核酸的筛查。用星状病毒特异性引物Mn289/270进行RT-PCR扩增,阳性产物回收纯化并直接测序,用Clustal和MEGA3.0生物软件对星状病毒序列进行序列比对和系统进化分析。结果496例儿童腹泻中病毒性腹泻136例,占17.4%,其中17例检测到星状病毒,占3.4%;男性多于女性;年龄分布均是5岁以下儿童,而且小于1岁的儿童12例,占70.58%(12/17);在地区分布上,西宁市占64.70%(11/17)、湟中县占29.41%(5/17)、黄南州占5.88%(1/17)。从标本收集的时间分布来看,阳性病例主要集中在4~6月份,到10~12月又有一个小高峰。7个核酸片段经过测序,6个为基因型1型、1个为基因型2型,在基因1型中4个核酸片段间的同源性为99.0%~100%,与同一型别的其他2个核酸片段的同源性为在88.4-95.7%之间。结论青海省2016—2018年引起婴幼儿腹泻的星状病毒以HAstV-1型为主,同时还存在HAstV-2基因型。 刘桂香 范丽霞 田登 徐琼 赵生仓 张华一 丰艳丽 肖敬玉关键词:婴幼儿 星状病毒 基因型 白刺提取物的急性经口毒性和遗传毒性研究 被引量:2 2017年 目的对白刺提取物进行毒理学安全性评价的实验研究,为白刺提取物的安全性提供理论依据,为其开发利用提供依据。方法急性毒性试验(Test of Maximum Tolerated Dose法):清洁级昆明种小鼠40只,随机分为实验组和对照组,每组20只,雌雄各半。实验组剂量为15.0 g/(kg·BW),对照组为蒸馏水,经口灌胃后,连续观察14 d,观察中毒表现及动物死亡情况。骨髓细胞微核试验:取股骨骨髓,检查骨髓嗜多染红细胞微核发生率。精子畸形试验:取附睾制片,查小鼠精子畸形率。沙门菌回复突变试验(Ames试验):采用平板掺入法;分加与不加S-9混合液两种。结果急性毒性试验(MTD法):雌性和雄性小鼠均未见明显的中毒症状及死亡,两种性别的小鼠的(MTD法)LD50均>15.0 g/(kg·BW);3项遗传毒性试验结果均为阴性。结论在本次实验条件下,白刺提取物急性毒性试验属无毒级;3项致突变表明白刺提取物无明显遗传毒性作用。 高玉清 徐琼关键词:急性经口毒性 遗传毒性 青海地区腹泻病毒病原谱和基因型研究 刘桂香 赵生仓 石燕 徐琼 姜双应 田登 徐莉立 张华一 蒋秀莲 李运萍 王卫军 杨威雄 该项目是卫生部国家科技重大专项“传染病监测技术平台的建立”项目子课题“甘肃及周边省区传染病病原谱流行规律研究”的重要组成部分。应用RT-PCR技术和测序技术对青海省腹泻病毒进行实验室检测和流行病学分析,确定青海省A组轮状...关键词:关键词:腹泻病毒 传染病预防控制 1186名体检人员甲肝抗体(抗-HAVIgG)检测结果分析 被引量:1 2015年 目的通过对1186名青海地区体检人员甲肝病毒保护性抗体(抗-HAVIgG)检测结果进行统计分析,了解其分布特征及甲型肝炎免疫水平现状,为有效预防提供依据。方法采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测甲肝病毒抗体(抗-HAVIgG)。结果11186名甲肝抗体(抗-HAVIgG)受检者检测结果总阳性率74.87%;2男性阳性率78.67%、女性阳性率69.86%,差异有统计学意义(χ2=11.981,P﹤0.01),其中民族对比显示藏族男性阳性率81.85%、藏族女性阳性率59.75%,差异有统计学意义(χ2=24.146,P﹤0.001);310岁以下儿童和11~20岁年龄组阳性率较低,其余年龄组阳性率随年龄增加呈递增趋势,其中藏族儿童阳性率最低。结论青海地区体检人员甲肝抗体阳性率呈现较高增长模式,20岁以下年龄组及藏区妇女儿童是甲肝预防免疫工作的重点人群。 徐琼关键词:甲肝抗体 免疫现状 2016-2018年青海省腹泻婴幼儿中肠道腺病毒流行情况与基因分型研究 被引量:3 2020年 目的了解2016-2018年青海省腹泻婴幼儿中肠道腺病毒流行情况与基因分型。方法采集2016年1月-2018年12月腹泻患儿的粪便标本496份,用PCR法进行肠道腺病毒基因分型。结果2016~2018年共检测496份样本,肠道腺病毒阳性42份,阳性率为8.47%,肠道腺病毒阳性率从2016年的4.94%增加到2018年的13.04%(P<0.05)。42份阳性病例中,32份分布在9~12月,小于1岁病例30份,黄南州检出率较高,占9.48%。从42份阳性标本中得到18段肠道腺病毒核酸序列,其中腺病毒41型9份(50.00%),腺病毒2型4份(22.22%),腺病毒40型3份(16.67%),腺病毒1型2份(11.11%)。结论青海省腹泻婴幼儿中流行的肠道腺病毒基因型以腺病毒41型和腺病毒40型为主。 刘桂香 田登 徐琼 赵生仓 张华一 丰艳丽 肖敬玉关键词:肠道腺病毒 婴幼儿腹泻 基因型 西宁地区丙型肝炎的基因分型与药物治疗关系的研究 被引量:5 2008年 [目的]HCV基因型有一定的地域和人群分布特征分布,为探讨我市HCV的基因型与药物的关系,我室用基因生物芯片的技术对西宁市部分HCV进行基因分型,并对临床治疗进行追踪观察和统计。[方法]选取HCV-RNA阳性血清60例,根据HCV5′-非编码区和核心抗原区序列设计聚合酶链反应(PCR)引物和寡核苷酸探针,然后用HCV基因芯片的方法进行基因分型,其中6份标本PCR产物同时进行测序分析。并同时经过一年的药物治疗并追踪观察后。[结果]36份为1b型,占60.66%,转阴11例、转阴率30.55%,2a型21份,转阴13例占61.90%,其余3例未能分型治疗后仍为阳性。经统计学处理,两组比较差异有统计学意义(χ2=4.753,P﹤0.05)6例测序结果与芯片结果一致。[讨论]此次调查以Ⅱ、Ⅲ型为主,与我国HCV基因分型主要以Ⅱ/1b,Ⅲ/2a型的分布相一致。药物治疗效果Ⅲ比Ⅱ效果较好。 刘桂香 田登 杨维雄 徐琼关键词:丙型肝炎 基因分型 药物治疗 2008-2018年常规体检人群丙肝检测回顾性分析 2020年 目的通过2008-2018年丙型病毒型肝炎(简称丙肝)常规体检人群实验室确诊情况的统计分析,了解其分布特征,为有效预防和治疗提供依据。方法采用酶联免疫吸附法(ELISA)初筛抗-HCV,采用实时荧光定量PCR法复检HCV RNA确诊。结果①2008-2018年某疾控门诊确诊丙肝病例992例,年均确诊阳性率5.67%,其中2017年7.93%(χ^2=8.02,P<0.05)、2018年8.02%(χ^2=8.27,P<0.05),与其它年份比较,差异均有统计学意义。②男性共计确诊411例,女性共计确诊581例(χ^2=110.26,P<0.05),不同性别之间差异有统计学意义。③发病率年龄分布以41~50岁组为最高峰,其次为21~30岁组。结论普及丙肝防控知识、积极预防有效管理结合实验室筛查确诊,是减少丙肝传播的重点任务。 徐琼 刘桂香 田登 高玉清 卢囡囡关键词:门诊 丙肝抗体 ELISA PCR 青海省2011-2012年手足口病病原学监测及流行特征分析 被引量:5 2014年 目的分析2011-2012年青海省手足口病病原学特点及流行规律。方法收集2011-2012年青海省疾病监测报告信息系统的手足口病病例资料,对病原学检测结果及流行特征进行描述性流行病学分析。结果2011年青海省报告手足口病病例602例,发病率10.70/10万;2012年报告787例,发病率13.99/10万,比2011年上升30.73%,两年均无死亡病例。2011-2012年发病率居前两位的地区分布为西宁市和海东地区。2011年报告病例高峰期呈双峰型,分别于6月和11月达高峰;2012年呈单峰型,7月达到最高峰。病例主要分布在5岁以下儿童,其中3~岁组为高发年龄组,占23.33%;散居儿童和托幼儿童分别占50.20%和40.39%。两年实验室确诊病例分别为35例和159例,主要病原体均为EV71,分别占实验室诊断阳性病例的77.14%和93.71%。结论青海省2012年手足口病发病流行强度偏高于2011年,病毒株未发生转变,以EV71型为主,基因型为C4基因型中的C4a进化分支,人群主要以5岁以下散居儿童及托幼儿童为主,3岁儿童为高发年龄,重点做好5岁以下散居儿童及托幼机构的手足口病防治工作。 徐琼 徐莉丽 张华一关键词:手足口病 病原学 2016-2017年青海省诺如病毒Ⅱ型基因型流行情况分析 被引量:2 2018年 目的了解2016-2017年青海省诺如病毒Ⅱ型基因型及分子流行病学特点,为全省诺如病毒的防治提供理论基础和实验依据。方法用GⅡ型诺如病毒实时荧光PCR试剂盒检测GⅡ型诺如病毒核酸;用GⅡ型诺如病毒特异性引物COG2F/G2-SKR进行RT-PCR扩增,阳性产物回收纯化后直接测序,用Clustal和MEGA4.0生物软件对诺如病毒GⅡ基因序列进行比对和系统进化分析。结果不同地区来源的粪便标本238份,实时荧光PCR的方法检测GⅡ阳性标本47份,占19.74%。从47份阳性标本中分离到17株诺如病毒Ⅱ型核酸序列,包括诺如病毒Ⅱ型基因型GⅡ.1(4株)、GⅡ.2(8株)、GⅡ.3(2株)、GⅡ.4(2株)和GⅡ.14(1株),分别占23.53%、47.05%、11.76%、11.76%和5.88%。结论青海省流行的诺如病毒GⅡ型存在多种基因型,其中以诺如病毒GⅡ.2型为主,可为诺如病毒的防治提供参考。 田登 刘桂香 徐琼 赵生仓 张华一 丰艳丽 肖敬玉关键词:基因型