刘宏德
- 作品数：38 被引量：39H指数：4
- 供职机构：东南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 预防或治疗阿尔茨海默症的药物、靶点及其应用
- 本发明公开了鸟嘌呤核苷单磷酸还原酶1作为预防或治疗阿尔茨海默症的药物靶标的应用，所述药物为Lumacaftor或其衍生物或含有Lumacaftor的药物组合物。鸟嘌呤核苷单磷酸还原酶1(GMPR1)的水平在阿尔茨海默症患...
- 刘宏德罗坤
- 基于Web技术的核小体在线预测平台实现被引量：1
- 2010年
- 核小体定位是真核生物基因转录调节的重要方式,要彻底了解基因表达调控信息,就必须考虑核小体定位的调控作用,因此提供一个快速、准确的核小体在线预测平台十分必要。基于本实验室开发的运用弯曲度谱预测核小体位置的核心算法,我们构建了基于Matlab Web服务和ASP技术的核小体在线预测平台(http://www.gri.seu.edu.cn/icons/)。本文详细介绍了该平台的设计、实现过程及平台的预测结果。
- 张德金刘宏德袁志栋孙啸
- 关键词：核小体定位MATLABWEB技术
- 一种基于核小体脱氧核糖核酸模版的核小体预测方法
- 一种基于核小体脱氧核糖核酸模版的核小体预测方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1获取待预测DNA序列，长度为T，计算待预测DNA序列弯曲度信号Signal。步骤2建立核小体DNA模版信号P，P的长度为147bp，两端区域...
- 刘宏德谢建明孙啸
- 文献传递
- 染色质构象解析技术——Hi-C及染色质构象信息提取被引量：5
- 2015年
- 真核生物染色质在核内的空间组织形式能影响DNA的空间分布,因而对基因转录、DNA复制等生物学过程具有调节作用。目前对这种空间上高度有序的基因组结构的认识还是粗糙的、碎片式的和不完整的。近年,利用染色质构象捕获技术发展起来的衍生技术——Hi-C技术,是一种研究全基因组范围的染色质相互作用以及探明全基因组的三维结构的分析技术。利用Hi-C技术能够对染色质内部或所有染色质之间的相互作用进行精细分析,从而把基因表达调控引入到空间的、全局性的研究层面,为全面解析与DNA有关的生物学过程的机理开启新的契机。本文主要阐述染色质构象解析技术Hi-C的实验原理、数据处理以及染色质构象信息提取,包括染色质内相互作用情况分析、全基因组基因活性分类、拓扑关联结构域(TAD)和染色质环(chromatin loop),介绍染色质构象信息与基因调控研究方面的国际前沿进展。
- 胡文桥侯越张峰刘宏德孙啸
- 一种非编码区单核苷酸基因组变异的功能预测方法
- 本发明公开了一种非编码区单核苷酸基因组变异的功能预测方法，包括以下步骤：1）染色质开放区域识别；2）转录因子结合位点识别；3）评估单核苷酸变异的作用：基于转录因子的位点特异频率矩阵，计算位于转录因子结合位点区内的单核苷酸...
- 刘宏德孙啸罗坤马伟恒
- 文献传递
- Nucleosome Positioning Regulates 3'end Processing of Protein coding genes in the Human Genome
- Background: It has been reported that 3' end processing is coupled to transcription and nucleosome depleti...
- 黄焕刘宏德孙啸
- 关键词：NUCLEOSOMEPOSITIONINGENDPROCESSINGPOLYADENYLATION
- 基于基因表达谱识别组织样本中细胞类型及组分的方法
- 本发明涉及一种基于基因表达谱识别组织样本中细胞类型及组分的方法，包括1）获得基因表达矩阵中所有基因的特异性得分；2）利用获取得到的基因表达矩阵中所有基因的特异性得分并结合统计检验框架识别潜在的标记基因；3）利用互线性策略...
- 李华梅赵小粼刘宏德
- Nucleosome Positioning of intronless genes in the Human Genome
- Background: Nucleosomes, the basic units of eukaryotic chromatin, which consist of approximately 147 base pair...
- 程向飞侯越刘宏德聂玉敏黄焕孙啸
- 关键词：GENENUCLEOSOMEOCCUPANCYTRANSCRIPTIONALREGULATION
- 预防或治疗阿尔茨海默症的药物、靶点及其应用
- 本发明公开了鸟嘌呤核苷单磷酸还原酶1作为预防或治疗阿尔茨海默症的药物靶标的应用，所述药物为Lumacaftor或其衍生物或含有Lumacaftor的药物组合物。鸟嘌呤核苷单磷酸还原酶1(GMPR1)的水平在阿尔茨海默症患...
- 刘宏德罗坤
- 文献传递
- Morris水迷宫实验图像分析系统及方法
- 本发明公开了一种Morris水迷宫实验图像分析系统及方法，本发明主要实现三个功能：一，计算动物在四个象限中的穿越次数；二，识别动物探查方式；三，计算小鼠穿越热区图。主要通过以下步骤完成分析：图像边缘检测、圆形区域识别、目...
- 刘宏德罗坤
- 文献传递
