黄海生 作品数:27 被引量:147 H指数:4 供职机构: 池州学院 更多>> 发文基金: 安徽省高校省级自然科学研究项目 国家自然科学基金 安徽省教学研究项目 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 文化科学 生物学 自然科学总论 更多>>
代谢网络结构与功能的复杂网络分析 2011年 细胞的新陈代谢过程可以抽象地描述成交互的复杂网络,越来越多的证据表明这种描述和分析有助于理解代谢网络的结构和功能。本文首先对高质量金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)代谢网络数据进行整理,构建了该网络中的所有代谢反应列表。随后用代谢物图(即节点表示代谢物,连线表示代谢反应)来表示这些反应,形成的网络包含了855个节点和1353条连线。最后用复杂网络理论分析了该网络的全局结构特征、巨强连通体的功能模块和关键节点等,并深入分析了网络的蝴蝶结结构,得到的功能模块以及关键节点的生物学功能意义。 丁德武 黄海生 陆克中 何小青 计博婧关键词:代谢网络 复杂网络 社团结构 中心化 基于SVG的组件式LBS系统设计 被引量:4 2007年 基于SVG的组件式移动位置服务(LBS)系统是一个开放的、支持多手机终端的系统,其适用于异构网络平台,具有可扩展性、可重用性及高效性,克服以往LBS系统中地图数据传输量大、异构系统间数据融合性差的特性。系统以Java为开发平台,结合现有的GIS系统以SVG为显示介质,在手机中实现便捷、准确的LBS服务。 帅小应 黄海生 廉东本关键词:移动位置服务 J2ME SVG 周期时间特性的角色访问控制 被引量:4 2009年 针对传统的RBAC模型不能表达时间特性安全访问控制约束的缺点,提出了一个带有周期时间特性的安全访问控制模型。在传统的RBAC模型的基础上定义了周期时间特性的角色访问控制,分析了模型的一致性状态,讨论了一致性状态维护问题,并针对周期时间约束问题提出的相应算法解决了时间授权约束和会话的状态,极大地提高了系统的访问控制能力。 夏启寿 殷晓玲 黄海生 王汝传关键词:角色 角色访问控制 基于Petri网T不变量的PHB新陈代谢建模分析(英文) 被引量:1 2010年 从拓扑结构的角度分析生化反应网络是生物信息学研究中的一个热点问题。通过将两种传统的途径分析方法(基元模式和极端途径)与Petri网的T不变量分析进行了比较,结果表明:它们本质上是一致的,但是采用Petri网的T不变量分析更便捷。然后,利用Petri网技术构建了PHB代谢模型。对该模型作了结构分析,将计算得到的23个T不变量进行了分组:I组表示简单的可逆反应,II组表示循环的反应,III组可用于调控ATP/ADP比率,IV组是与PHB生产直接相关的反应,可用于代谢工程以提高PHB的产率。最后讨论了Petri网的T不变量分析在这个领域中的应用。 丁德武 何小青 陆克中 吴璞 黄海生关键词:代谢网络 PETRI网 系统生物学 基于QPSO-LSSVM的L-缬氨酸发酵建模 被引量:2 2010年 最小二乘支持向量机(1east square support vector machine,LSSVM)是1种新的机器学习算法,它采用结构风险最小化准则,能有效提高模型的泛化能力,且具有运算速度快、抗噪能力强等特点。本文针对最小二乘支持向量机发酵建模中,选择重要模型参数值的问题,提出利用全局搜索能力强的量子粒子群优化算法,优化LSSVM建模过程的重要参数,并将该混合建模方法应用于L-缬氨酸发酵,建立L-缬氨酸产物浓度、菌体浓度和底物浓度等重要过程变量的预测模型,在线预估这些不能在线测量的生化状态变量。实验表明,混合算法所建立起的L-缬氨酸发酵模型在模拟菌体生长、底物消耗及发酵产酸过程的变化等方面都比BP神经网络建模方法具有较小的拟合误差和较好的推广性能,可以为L-缬氨酸发酵生产过程提供动态模拟,具有重要的实用价值。 陆克中 黄海生关键词:量子粒子群优化算法 最小二乘支持向量机 L-缬氨酸 “互联网+”教学质量监控体系的构建与实践--以池州学院为例 被引量:1 2021年 通过分析“互联网+”在教学质量监控中的作用,并论述基于应用型本科高校人才培养目标“互联网+”教学质量监控体系的构建过程,提出了教学质量监控的具体措施,进一步对教学平台的监控实施效果和发展前景深入探究。 王长春 操漫成 黄海生关键词:高校 教学质量 重建代谢网络及其结构与功能的分析 被引量:11 2010年 文中研究重建代谢网络及分析其拓扑结构与功能。首先,详细介绍用于重建代谢网络的主要数据类型以及相关数据库。然后,介绍重建和精练代谢网络的方法,及重建苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)代谢网络的工作。用代谢物图表示该网络,共830个节点,1 132条连线。最后,分析网络的拓扑结构特征,借助代谢网络"蝴蝶结"结构的特征对其予以简化,并从网络的小世界效应、节点度分布和关键代谢物3方面分析其巨强连通体。该巨强连通体的平均路径长度为8.63,节点度分布符合幂律分布,表明它是一个典型的小世界和无标度网络。同时,研究结果表明其关键代谢物均具备重要的生物学功能意义。 丁德武 丁彦蕊 陆克中 须文波 黄海生关键词:代谢网络 度分布 蝴蝶结 小世界 教学督导在教学质量监控中的问题和对策研究——以池州学院为例 2020年 教学督导对于高校教学质量监控机制的建立至关重要,能有效落实教学质量监控闭环运行机制,推动教学改革,保障人才培养质量意义重大。笔者对当前教学督导在教学质量监控中存在的问题及对策进行了探究。 王长春 朱同林 黄海生关键词:教学督导 教学质量 基于SAA的苏云金杆菌代谢网络功能模块 被引量:2 2010年 比较几种常用的社团结构分析方法,讨论它们在代谢网络分析中的不足之处。模拟退火算法在代谢网络模块分析中具有一定优势,选用该算法分析苏云金杆菌代谢网络巨强连通体中的功能模块,并将所得的结果与KEGG数据库中的途径信息进行对比研究,发现大部分的模块都对应于1~2个KEGG途径。进一步的研究表明这些模块均具备重要的生物学功能意义。 丁德武 陆克中 须文波 吴璞 黄海生关键词:社团结构 代谢网络 模块性 模拟退火算法 新建地方本科院校计算机实验室管理探讨 2011年 针对新建地方本科院校由于建设经费不足导致实验室建设落后问题,从合理规划,节约实验用房,预留发展空间;功能整合,节约设备,降低办学成本;合理利用,变废为宝,提高设备利用率;软硬结合,克服设备短缺,有效开展实验教学;课内外结合,构建电子教学平台,分期分批开放实验室这五个方面对实验室的建设进行了一些有益的探索与实践,取得了良好的实际效果。 陆克中 黄海生 方康年关键词:实验室