魏桂芳
- 作品数：21 被引量：149H指数：7
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 肠道微生物群落结构的分子分析
- 肠道菌群对宿主的消化、免疫和抗病等功能具有重要的影响。传统的分离培养技术不能客观全面地反映肠道菌群的结构特征。本研究应用分子生物学技术对人和动物(昆虫和大熊猫)肠道微生物群落结构进行了研究。
过去的研究表明，人...
- 魏桂芳
- 关键词：肠道微生物群落结构分子生物学
- 文献传递
- 用PCR指纹图技术分析焦化废水接触氧化池中悬浮污泥和生物膜的微生物种群组成被引量：26
- 2004年
- 目的 :应用分子生物学方法 ,以处理焦化工业废水 (A2 /O生物膜工艺 )中的悬浮污泥和生物膜的微生物群落作为研究对象 ,分析不同环境微生物群落的组成差异。方法 :首先提取群落的总DNA ,获得ERIC PCR和LP RAPD指纹图谱并进行对比分析 ,然后结合群落探针杂交的技术 ,检查同样迁移率的条带的序列同源性 ,运用UVIBAND/MAP软件比较所得群落指纹图谱的相似性指数 ,从而可以得到群落差异的量化结果。结果 :焦化废水接触氧化池中 ,悬浮污泥和生物膜的微生物群落组成存在相当大的差异。结论 :通过这种差异的比较分析 ,有可能让我们更准确地了解氧化池中微生物的群落组成情况 。
- 李亮魏桂芳童耕雷赵立平
- 关键词：分子生物学悬浮污泥生物膜微生物群落
- 应用TGGE技术分析人肠道中双歧杆菌的组成被引量：16
- 2005年
- 用温度梯度凝胶电泳(TGGE)技术结合16SrDNA克隆、测序,对健康人肠道中双歧杆菌的组成进行了分析。10例健康人肠道双歧杆菌的TGGE分析显示:人肠道内双歧杆菌的组成具有宿主特异性,不同人肠道双歧杆菌种的多样性和种类不同。通过对一健康儿童肠道双歧杆菌属特异性PCR扩增产物的测序及TGGE电泳行为的分析发现,该个体双歧杆菌TGGE图谱中的条带分别代表Bifidobacteriumbifidum、B.infantis、B.longum、B.adolescentis、B.pseudocatenulatum等种和一新种,其中B.pseudocatenulatum(假小链双歧杆菌)是大多数个体共有且较优势的种类。用传统培养方法只检出B.pseudocatenulatum和B.longum两种。基于双歧杆菌属特异性PCR基础上的TGGE方法结合16SrDNA克隆文库分析可较灵敏、直观地反映人肠道中双歧杆菌的组成。
- 庞小燕张宝让魏桂芳赵立平
- 关键词：双歧杆菌
- 应用PCR与温度梯度凝胶电泳分析龈上菌斑微生物群落被引量：3
- 2005年
- 目的应用PCR与温度梯度凝胶电泳(PCRTGGE)分子技术对成年健康口腔的龈上菌斑中微生物群落组成进行分析。方法8例成年个体包括4男4女,年龄19～29岁,分别采取每例个体上下颌牙周龈上菌斑样品,共18份(个体Subl间隔10天采集2次样品)。提取菌斑DNA,PCR扩增16SrDNAV3可变区,产物经TGGE后进行相似系数分析。结果同一个体的上下颌微生物群落组成相似性系数为81%～95%,而不同个体的龈上菌斑微生物群落组成相似性系数,均在60%以下。结论不同个体具有其独特的牙周微生物群落,而且在一定时期内组成稳定。
- 洪纬魏桂芳庞小燕王凌华赵立平
- 关键词：菌斑牙周PCR成年TGGE微生物群落
- 软腐欧氏杆菌的III型分泌系统对梨火疫欧文氏杆菌harpin蛋白的识别与分泌
- 魏桂芳
- 关键词：软腐欧氏杆菌HARPIN蛋白分泌ERWINIA
- 分析比较微生物群落结构的监测方法
- 一种微生物生态学领域的监测方法，具体是一种分析比较微生物群落结构的监测方法。具体如下：选定一对LP－RAPD引物，长度15－24bp，(G+C)含量50％；环境样品中混合微生物总基因组DNA的提取；LP－PCR循环反应，...
- 赵立平魏桂芳
- 文献传递
- 大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)肠道菌群结构分子生态学研究
- 大熊猫是中国本土的国家一级保护动物,现今世界上总共存活的数量不到1,500只。大熊猫主要以竹子为食,然而其肠道结构却与食肉类动物的结构类似,简单的胃、盲肠已经退化,结肠短而简单。那么,大熊猫是如何以食肉类动物的简单的胃肠...
- 魏桂芳鲁海峰林志新赵立平
- 关键词：大熊猫肠道微生物菌群结构OTU
- 文献传递
- 用ERIC-PCR结合分子杂交监测焦化废水处理系统(A^2/O)中微生物群落结构的变化被引量：17
- 2004年
- 建立一种不依赖纯培养 ,可以在废水处理工业现场使用的监测微生物群落结构变化的分子技术。以处理焦化工业废水(A2 /O生物膜工艺 )不同构筑物中的悬浮污泥的微生物群落为研究对象 ,每周采样 1次 ,连续 4周。获得悬浮污泥总 DNA的ERIC- PCR指纹图谱 ,结合分子杂交进一步区分相同条带间的不同序列信息。结果表明 ,在缺氧池 (A2池 )和好氧池 (O池 )之间 ,各个采样点的 ERIC- PCR图谱差异不大 ,悬浮污泥在各构筑物之间交流充分 ;同一采样点的图谱在不同采样时期具有明显差异 ,显示了在此期间微生物群落的连续动态变化过程。通过对生物膜系统中悬浮污泥的微生物群落结构的指纹图谱分析 。
- 陈敏魏桂芳高平平王凌华庞晓燕赵立平
- 关键词：ERIC-PCR指纹图谱分子杂交
- ERIC-PCR分子杂交技术分析大熊猫肠道菌群结构被引量：53
- 2005年
- 目的 了解大熊猫肠道微生物区系结构的相似性和稳定性,并找出大熊猫肠道微生物群落结构的变化与健康状况的关系。方法 对上海动物园及上海野生动物园所饲养的3只大熊猫2次采集的粪便样品进行微生物群落总DNA的抽提,并以此为模板获得反映肠道微生物群落结构特征的ERIC- PCR和Southern杂交指纹图谱,比较各DNA样品指纹图谱的相似性指数。结果 除国庆(大熊猫)的第1次采集的样品(当时处于腹泻状态) ,其他各DNA样品的ERIC- PCR及Southern杂交指纹图谱的相似性都达到85 %～10 0 % ;佳斯及川川(大熊猫) 2个个体2次采集的样品之间ERIC指纹图谱的相似性分别为93%和87% ,而国庆腹泻时的样品与健康时的样品之间则为71%。结论 大熊猫不同个体之间肠道微生物群落结构比较相似,而且同一个体在不同时期表现出比较高的稳定性,但当个体的健康出现问题时肠道优势菌菌群结构有一定波动。所采用的DNA提取方法、ERIC- PCR和Southern杂交指纹图谱的高度重复性证明了之一分子生态学技术在大熊猫肠道微生物区系动态监测中的可行性。
- 鲁海峰魏桂芳李仲逵李红王爱善顾建萍金会宇孙强赵立平
- 关键词：大熊猫SOUTHERN杂交分子杂交ERIC-PCRDNA样品区系结构
- 从粪便样品中检测动物冠状病毒的分子技术研究被引量：2
- 2005年
- 目的感染冠状病毒的动物向环境排毒主要是通过粪便,建立直接从粪便样品对动物冠状病毒进行检测的分子技术具有重要的公共卫生学意义。方法通过计算机模拟和实验方法对已报道的2对针对冠状病毒pol基因的通用引物的通用性进行了验证。不经传统的病毒分离,直接从环境样品中提取病毒RNA,通过一步法RT-PCR进行检测,并通过分子杂交和NestedPCR扩增结合TaqMan探针实时荧光检测的PCR技术,提高对冠状病毒检测的灵敏度和准确度,并对猪、禽冠状病毒感染的临床样品进行分析检测。结果2对引物可以覆盖所有已知的冠状病毒,包括SARS,RT-PCR产物通过测序可以确定冠状病毒种类;实时荧光定量NestedPCR有很高的灵敏度,可以灵敏地检出所有供试的阳性样品,而荧光增量实时监测可以排除凝胶电泳检查的假阳性。结论该研究为从环境中普查和鉴定冠状病毒提供了可靠的技术方法。
- 魏桂芳张宇镭刘惠莉赵立平
- 关键词：冠状病毒通用引物
