韦芳萍
- 作品数:14 被引量:18H指数:3
- 供职机构:广西大学物理科学与工程技术学院更多>>
- 发文基金:广西壮族自治区自然科学基金国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学自动化与计算机技术医药卫生文化科学更多>>
- 基于cvtree方法和复杂网络理论的癌症进化树分析被引量:4
- 2014年
- 进化树是一种能够形象直观地反映出生物进化关系的树型结构图。本文从脑癌、宫颈癌、食道癌、胃癌、胶质瘤、肝细胞癌、肝癌、脑膜瘤、口腔癌、骨肉瘤、胰腺癌、肾癌、眼癌、鳞状细胞癌、甲状腺癌等15种癌症的核酸序列出发,将cvtree方法与复杂网络理论相结合,构建了亲缘关系进化网络,并根据所得网络参数构建进化树。通过分析进化树图形,给出了相关癌症的进化关系,为今后对癌症的进一步研究提供了新的视角。研究结果表明,某些种类的癌症跟其它种类的进化关系较近,而某些种类的癌症则跟其它的进化关系较远;同时,在cvtree方法中取不同的串长值和不同的亲缘距离下,得到的进化树,所反映的进化趋势呈现出一定的规律。
- 沈路明韦芳萍
- 关键词:进化树复杂网络癌症
- tRNA序列的进化网络研究被引量:1
- 2009年
- 根据tRNA序列的反密码子,把3420条tRNA序列分成了21组,其中包括20组氨基酸及1组Stop。通过tRNA序列的相似度构建了1组整体网络和21组子网络,并计算了它们在不同相似度下的平均度、平均聚类系数以及平均最短路径。通过分析、比较和讨论网络中的三个重要参数,进一步说明点突变是tRNA序列进化的重要机制,并反映了它们的进化近似符合中性理论,且在同一组氨基酸和Stop内的tRNA序列在进化历史上的同源关系更密切;同时表明了tRNA序列在进化过程中具有自相似性。
- 陈伯文夏玉显韦芳萍
- 关键词:反密码子相似度网络
- 学习《大学物理》的两个难点
- 2015年
- 《大学物理》是大学课程中一门非常重要的基础课。学习大学物理有两个难点:一是如何掌握微积分在物理中的应用;二是矢量和矢量的计算在物理中的应用。文章对两个难点进行了介绍和引导,给学生学习大学物理提供一些建议和参考。
- 韦芳萍沈路名
- 关键词:微积分矢量大学物理
- HIV全序列中重复序列的研究被引量:1
- 2012年
- 文章统计了HIV全序列中所有不同长度的重复序列,并分析了其重复序列的AT/GC含量。研究发现:(1)重复序列出现的次数n与出现次数为n的重复序列总数N(n)之间存在power-law关系,这表明在HIV全序列中,只有少数重复序列会出现很多次,大部分重复序列只会出现少数几次;(2)HIV全序列中的AT含量高于GC含量,并且对于不同长度K的重复序列,100%AT含量的重复序列总是多于100%GC含量的重复序列,最长的100%AT含量的重复序列比100%GC含量的重复序列要长,这表明HIV全序列在进化过程中可能经受了更多的AT压力。通过对HIV全序列中的重复序列的分析,进一步讨论HIV进化历程及特点。
- 毛源泽韦芳萍岑华佗喻魁兰谢积鉴赵瑞梁家源
- 关键词:HIV
- 原核生物中重复序列的分析及数据库的构建
- 该文主要分析了原核生物重复序列的收集、分类及数据库的构建.该文的前两章对生物信息学及真核生物的重复序列作了简要的概括.它是我们的具体工作(第三到第五章)的基础.第三章分析了原核生物中重复序列的收集.根据收集策略,对四十一...
- 韦芳萍
- 关键词:生物信息学原核生物转座子数据库
- 文献传递
- 利用复杂网络来研究tRNA序列的进化被引量:2
- 2007年
- 根据点突变和互补复制的进化机制构建tRNA序列相似度平行网络和反平行网络并研究了网络的特征.分析发现当相似度很大时,tRNA基因网络出现了无标度(scale-free)的特征.其次,还比较了平行网络和反平行网络的特征,发现在相同的条件下,反平行网络中的tRNA序列间的关系比平行网络中更密切,它们之间的相似程度更高.这同时说明现代tRNA序列由互补复制机制进化的可能性更大.最后根据点突变和互补复制的进化机制建立了一个粗糙的tRNA进化模型.结果发现模型tRNA相似度网络在0.3≤ξ≤0.5条件下,不仅和真实tRNA相似度网络有局部的相似行为,而且网络的整体行为也是相似的.因此现代tRNA序列的合理的进化机制应该是上述两种机制的混合.
- 韦芳萍蓝贞雄
- 关键词:相似度网络
- 生物信息学与重复序列分析被引量:3
- 2002年
- 介绍了生物信息学的含义、主要内容和研究方法 ;阐明研究重复序列的重要意义 。
- 韦芳萍陈光旨戚继
- 关键词:生物信息学基因数据库
- 复杂网络的统计机制及生物网络的发展
- 2007年
- 介绍了复杂网络发展的动力学理论及对生物网络的发展和已经取得的成果进行了归纳和总结。最后利用复杂网络理论建立了一个由不同密码子tRNA序列组成的相似度网络,并研究了网络的拓扑结构和分析其中隐藏的进化信息。
- 韦芳萍蓝贞雄
- 关键词:复杂网络生物网络
- 启发式教学思想在新概念物理教程《电磁学》教学中的应用被引量:3
- 2008年
- 将启发式教学思想应用在电磁学的教学中。通过启发式教学,激发学生独立思考和创新的意识,培养学生的科学精神和获取新知识、分析和解决问题的能力。
- 韦芳萍谭振强
- 关键词:电磁学物理定律启发式教学启发思维
- 关于新概念力学双语教学的实践和思考
- 2008年
- 通过新概念力学的教学实践,提出了在广西高校里实施双语教学,能培养出什么样的人才,如何培养合适广西的双语教师,如何研发适合双语教学的教材等值得探索的问题。
- 韦芳萍蓝贞雄潘大胜
- 关键词:双语教学双语教材