陆瑞群
- 作品数：17 被引量：62H指数：4
- 供职机构：右江民族医学院基础学院更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金国家自然科学基金广西研究生教育创新计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学生物学天文地球更多>>
- 肝细胞癌模型小鼠中外泌体来源RNA剪接基因的功能及差异表达分析
- 2020年
- 目的:探讨模型小鼠肝细胞癌组织(TM)内差异表达的外泌体来源RNA剪接基因(exosome-derived RNAsplicing-related DEGs,ERDs)的变化图谱及AS、SNV和INDEL与基因表达的关系。方法:以健康小鼠肝组织(生理微环境,PM)、模型小鼠无瘤体肝组织(细胞癌前微环境,PTM)和模型小鼠肝细胞癌组织(肿瘤微环境,TM)为材料,分别提取各组样本中的总RNA进行RNA-seq和生物信息学分析,并通过RT-qPCR验证实验结果。结果:与PTM比较,TM中有158个高表达的ERDs;与PM比较,TM中有141个高表达的ERDs;两类对比样本中有21个相同的ERDs在TM中高表达。这21个ERDs主要参与了4个生物学过程(BP)、5个细胞组分(CC)、2个分子功能(MF)和1个信号通路(KEGG pathway)。其功能主要富集在剪接体的功能上,尤其是在剪接体执行剪接过程中ploy(A)RNA结合、核来源的第二步剪接小体的催化作用以及剪接体snRNP组装。结论:TM中高表达的ERDs主要通过poly(A)RNA结合异常,介导错误的RNA剪接和剪接体snRNP组装,可能导致mRNA错乱剪接进而影响模型小鼠肝细胞癌的发生发展。同时,引起基因多态性的可变剪切(AS)、单核苷酸位点变异(SNV)及插入缺失标记(INDEL)与TM中高表达的RNA剪接具有关联性。
- 阮文慧唐玉莲倪安妮李根亮李曙波陆瑞群黄海玲
- 关键词：外泌体RNA剪接剪接体肝细胞癌
- 肝细胞癌源血液相关外泌体组分通过补体和凝血级联参与肿瘤组织天然免疫被引量：4
- 2020年
- 目的:探索肝细胞癌(HCC)来源血液相关外泌体组分参与天然免疫的可能机制。方法:以肝细胞癌模型小鼠的瘤体组织和癌旁肝组织为实验材料,分别提取各组织中的总RNA,通过RNA测序(RNA-seq)和生物信息学手段分析两样本中HCC源血液相关外泌体差异表达基因,并用RT-qPCR验证实验结果。结果:发现在瘤体组织和癌旁肝组织中存在81个HCC源血液相关外泌体差异表达基因。对这些差异表达基因功能富集,共富集到10个生物学过程、4个细胞组分、3个分子功能和2个KEGG通路。进一步分析发现它们主要参与天然免疫反应、血液凝固、炎症反应等生物学过程,以及受体结合、丝氨酸型肽酶活性等分子功能。其中33个HCC源血液相关外泌体差异表达基因参与了补体和凝血级联信号通路。结论:HCC源血液相关外泌体组分可能主要以受体结合、丝氨酸型肽酶催化活性等,通过补体和凝血级联信号途径,参与HCC组织中的天然免疫反应。
- 凌玉金唐玉莲倪安妮廖成传刘明慧梁祯妮李曙波陆瑞群李根亮
- 关键词：肝细胞癌血液外泌体补体天然免疫
- 异常寡核苷酸结合折叠域蛋白基因对肝细胞癌DNA复制起始的影响被引量：1
- 2020年
- 目的关于异常寡核苷酸结合折叠域蛋白基因(OBGs)通过微小染色体维持(MCM)复合物影响肝细胞癌DNA复制起始的报道较少。文中旨在探讨逆转录相关基因(RTGs)在肝细胞癌中的作用及可变剪接和单核苷酸位点变异(SNV)与基因表达异常的相关性。方法选取150只洁净级昆明小鼠,采用随机数字表法取100只,双前肢腋下注射对数生长期肝细胞癌细胞株H22等渗盐水悬液作为H22组,余50只注射0.2 mL不含H22的等渗盐水作为对照组。从H22组小鼠中选出成瘤小鼠,解剖取出瘤体,从对照组小鼠中取健康肝组织。提取H22组和对照组总RNA,分析差异表达基因。筛选差异表达的逆转录相关DEGs(RDEGs),对RDEGs进行GO和KEGG分析。对RDEGs编码蛋白进行互作分析,对RDEGs多态性与基因表达进行相关性分析。结果肝细胞癌中有193个差异表达的RTGs,共参与2个生物学程序、3个细胞组分、1个分子功能、3个信号通路和3个功能部位;其功能主要集中在DNA复制,尤其复制起始中OBGs参与的MCM复合体及端粒复合体构建。可变剪接分析结果显示,4个RDEGs在基因的3个位点发生了差异表达的可变剪接,且可变剪接与相应基因的表达呈正相关。SNV和INDEL分析显示肝细胞癌组织中共有157个RDEGs,发生1541个SNV和78个INDEL位点的改变;上述基因位点的改变主要发生在基因的6个部位,即外显子区、内含子区、基因间区、基因下游区、基因上游区和拼接区;共有28个基因的SNV改变差异有统计学意义(P<0.05)。基因位点多态性分析结果显示,5个OBGs在肝细胞癌中出现了SNV现象,而健康肝组织中则没有SNV。结论RTGs中的OBGs可能在肝细胞癌中通过自身的基因多态性突变引起MCM复合体及端粒复合体的改变,从而调控DNA复制起始及保护端粒的完整性,进而在癌细胞的增殖过程中发挥重要作用。可变剪接及SNV则可能是一些基因表达的重要调控因素。
- 李根亮倪安妮唐玉莲冯权黄小程阮文慧李曙波陆瑞群
- 关键词：肝细胞癌
- 不同岩溶干旱胁迫下青冈栎水分生理对比研究被引量：23
- 2006年
- 通过对广西弄拉典型峰丛洼地生态系统中不同地貌类型的青冈栎(Cyclobalanopsis glauca)叶片的生理生化指标进行测定,结果表明:山顶青冈栎的含水量比山中部的高,但水分饱和亏和需水程度比山中部的低。山顶的小气候环境相对恶劣,青冈栎受到的水分胁迫比较严重,相反,山中部的青冈栎的需水程度比山顶高。山顶青冈栎为适应干旱的环境形成各种结构,如缩小的叶面积、加厚的角质层、凹陷的气孔等,以降低它的蒸腾速度,能有效地控制水分的损失,而对水分供应不足的适应同时也降低了光合作用,因此,岩溶山顶青冈栎的径向生长速度要比山腰的慢得多。
- 邓艳蒋忠诚罗为群陆瑞群邓新辉
- 关键词：青冈栎水分生理水分胁迫
- 肿瘤微环境趋化因子通过与细胞因子受体互作参与HCC诱导的炎症反应被引量：4
- 2019年
- 目的探讨肿瘤微环境(TM)中趋化因子参与肝细胞癌(HCC)引起的炎症反应的可能机制。方法提取肿瘤组织(TM组)和癌旁组织(对照组)总RNA并通过RNA-seq和生物信息学手段分析趋化因子相关差异表达基因的功能及其编码蛋白的互作情况,并以RT-qPCR验证实验结果。结果TM中共有43个趋化因子相关差异表达基因,它们被富集到2个KEGG信号通路、5个生物学过程和2个细胞组分,其中大量趋化因子相关基因参与炎症反应、免疫反应、趋化性、细胞对IL-1的反应和细胞对肿瘤坏死因子的反应过程。尤其值得一提的是,涉及趋化性的7个基因(ACKR3、CCL20、CCL3、CCL5、CCR4、CCR6、PTGDR2)中,有6个参与细胞因子-细胞因子受体信号通路、5个参与免疫反应、4个参与炎症反应;涉及细胞因子-细胞因子受体信号通路的134个基因中有7个参与炎症反应。结论TM中趋化因子通过与细胞因子受体互作的方式参与HCC诱导的炎症反应。
- 韩鑫鑫梁浩源唐玉莲倪安妮陆瑞群李曙波李根亮
- 关键词：趋化因子肿瘤微环境
- 医学生物学实验教学方法改革实践与体会被引量：1
- 2014年
- 在医学生物学教学过程中,综合运用让学生扮演"小老师"、与理论知识相结合、播放实验录像、适当采用课堂考核以及教研结合等方法激发学生的学习兴趣,促使学生更加积极主动地完成实验课程,提高教学质量。
- 陆瑞群庞广福冯治
- 关键词：医学生物学教学方法教学改革
- 生物化学和分子生物学科研型课堂教学模式初探被引量：1
- 2022年
- 目的:实施科研型模块化课堂教学,培养学生的科研素养。方法:通过线上线下结合的科研型模块化教学模式,将原2门学科整合成包含8个教学模块、9个科研讲座、9个科研实验的一门课程。每个模块通过线上学习、理论测试、课题选择、实验探究、综合评价等5个教学环节实施教学。通过问卷调查等评价教改效果。结果:学生对新教改模式的评价好于传统教学模式。结论:新科研模块化教学模式对学生科研素养的提升有明显效果,值得推广。
- 李根亮唐玉莲陆瑞群孙丽双李书
- 关键词：生物化学分子生物学课程整合
- 肝癌模型小鼠中线粒体源外泌体基因的差异性表达分析
- 2020年
- 目的探讨线粒体源外泌体基因参与肝细胞癌(HCC)病理过程的可能分子机制。方法通过RNA-seq和生物信息学手段,分析HCC中差异表达的线粒体源外泌体基因(DEMEs)及其生物学功能。结果HCC组织中共鉴定出93个DEMEs,其中74个表达下调,19个表达上调。表达下调的DEMEs经功能富集,共富集到4个生物学过程(biological process,BP)、4个细胞组分(cellular component,CC)、2个分子活性(molecular function,MF)、1个信号通路(KEGG pathway,KG)和4个蛋白位点序列特征(UP_SEQ_FEATURE,US)。它们参与了氧化还原、脂质代谢等过程,且大量DEMEs还具有线粒体转运肽功能。而上调表达的DEMEs,除了富集到1个CC,即线粒体组分,还发现其中一些参与了跨膜转运、对过氧化氢和对机械刺激的反应过程,有些还具有转移酶活性和ATP结合能力,并参与癌症的发生和转移等病理过程。结论线粒体源外泌体基因在HCC肿瘤组织与非肿瘤组织存在差异性表达,生物信息学分析显示这种差异性表达的基因涉及多个生物学过程,提示它们可能通过多种途径影响HCC的发生。
- 龙晓芳李根亮唐玉莲倪安妮陆瑞群李曙波韦海闻蓝丹陈荣彬
- 关键词：肝细胞癌外泌体线粒体差异表达基因
- 线上线下结合的科研型模块化生化等五门课程整合的初探被引量：1
- 2021年
- 课程整合和教学模式革新成为了当代大学生学生能力提高和学业负担减低的主要手段。生物化学、分子生物学、细胞生物学、遗传学、表观遗传学是生命科学和医学学科的主要基础课程。这些人为分割的各门独立课程不仅内容上有交叉重叠,而且增加学生学业负担,不利于学生科研素养和科学创新能力提高。我们通过转变教育理念和开展教学实践,将以上课程及其理论和实验内容整合成为了一门《细胞、分子和基因》课程,并配套以线上线下科研型模块化教学模式。现将课程整合的设计理念、具体实施流程、整合的实施方案(包括教学内容模块)以及整合的效果评价总结如下,以期为想要进行课程整合的其他学科提供参考。
- 李根亮唐玉莲李曙波陆瑞群蒋利和孙丽双李书
- 关键词：课程整合科研型模块教学生物化学
- 岩黄连的药理作用及临床应用研究进展被引量：9
- 2014年
- 通过查阅有关岩黄连研究的文献资料,归纳总结了岩黄连在药理作用及临床应用方面的研究现状,以期为开发利用岩黄连以及进一步研究岩黄连提供参考。
- 陆瑞群庞雅琴庞广福
- 关键词：岩黄连药理作用
