郭木金
- 作品数:6 被引量:29H指数:3
- 供职机构:厦门出入境检验检疫局检验检疫技术中心更多>>
- 发文基金:质检公益性行业科研专项项目国家质检总局科技计划项目福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 辣椒轻斑驳病毒反转录-环介导等温扩增检测用引物及其应用
- 本发明涉及一种用于辣椒轻斑驳病毒反转录-环介导等温扩增检测的引物、检测方法及其应用,所述引物为PMMoV-F3、PMMoV-B3、PMMoV-FIP和PMMoV-BIP,其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1~4所示...
- 黄天培廖富荣关雄方志鹏吴媛郭木金
- 文献传递
- 进境番茄种子中番茄花叶病毒的检测与鉴定被引量:6
- 2011年
- 利用双抗夹心-酶联免疫吸附试验(DAF〉EI。ISA)和反转录-聚合酶链式反应(Rrr_PCR)方法对来自韩国的番茄种子进行种传病毒检测。结果表明,在该批番茄种子中检测到番茄花叶病毒(ToMV)和烟草花叶病毒(TMV)。PCR产物测序结果表明,ToMV特异引物(ToA/ToB)与TMV特异引物(TA/TB)扩增的片段均为ToMV的外壳蛋白(CP)基因及3’非编码区(3’-UTR),该片段与其他ToMV分离物的核苷酸序列相似性为98.2%~99.9%。本研究利用重新设计合成TMV和ToMV特异引物对该批种子进行RT-PCR检测,仅ToMV特异性引物(ToMfl/ToMrl)扩增到670bp的预期片段,TMV特异引物(TMfl/TMrl)则未出现特异性扩增,表明重新设计的引物可准确区分ToMV和TMV。以上结果证实该批番茄种子仅携带ToMV。
- 廖富荣郭木金林石明陈红运陈青黄蓬英吴媛谢惠明
- 关键词:番茄种子反转录-聚合酶链式反应番茄花叶病毒烟草花叶病毒种子传播
- 台湾甜椒种子中辣椒轻斑驳病毒检测及其致病型鉴定被引量:5
- 2011年
- 利用双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS-ELISA)、反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和基因序列分析法对一批台湾进境的辣椒种子进行病毒检测及致病型鉴定,同时使用特征序列扩增区域(SCAR)标记引物利用PCR方法对该辣椒品种进行L抗性基因检测。DAS-ELISA及RT-PCR结果表明,从该批种子中检测到辣椒轻斑驳病毒(Peppe rmild mottle virus,PM MoV)。PCR产物测序分析表明,该序列为PM MoV的外壳蛋白(CP)基因,与已报道的PM MoV序列同源性为92.4%~99.8%。CP蛋白氨基酸序列分析表明,该分离物(命名为TW分离物)属于PM MoV的P1,2,3致病型。抗性基因检测表明,该辣椒品种携带有L3抗性基因。TW分离物能够系统侵染该辣椒品种,意味着该分离物已经克服L3基因介导的抗性。本研究报道的PM MoV的P1,2,3致病型在中国大陆尚属首次,这对于抗病辣椒品种的选育具有重要的指导意义。
- 廖富荣沈建国吴媛郭木金黄蓬英陈青陈红运林石明
- 关键词:甜椒辣椒轻斑驳病毒种子传播外壳蛋白基因
- 豇豆花叶病毒亚科分子检测及南芥菜花叶病毒荷兰分离物基因组序列分析
- 豇豆花叶病毒亚科(Comovirinae)属于类小RNA病毒目(Picornavirales)、伴生豇豆病毒科(Secoviridae),包含豇豆花叶病毒属(Comovirus)、蚕豆病毒属(Fabavirus)和线虫传...
- 郭木金
- 关键词:南芥菜花叶病毒
- 文献传递
- 豇豆重花叶病毒RT-LAMP检测方法的建立被引量:14
- 2012年
- 豇豆重花叶病毒(Cowpea severe mosaic virus,CPSMV)是我国进境植物检疫性有害生物,本研究根据CPSMV的外壳蛋白基因序列设计引物,以期建立CPSMV的反转录-环介导等温扩增(reverse transcription loop-mediated isothermal amplification,RT-LAMP)检测方法。条件优化后,建立了CPSMV的RT-LAMP方法,该方法可将CPSMV与同属其他病毒准确区分,具有良好的特异性。灵敏度试验显示,RT-LAMP比普通RT-PCR灵敏度高10倍。说明本研究建立的RT-LAMP方法适用于CPSMV的快速、特异和灵敏的检测。
- 郭木金廖富荣陈青林石明陈红运沈建国
- 同时检测豇豆花叶病毒属与蚕豆病毒属病毒的通用RT-PCR检测方法被引量:3
- 2015年
- 【目的】建立一个可同时检测豇豆花叶病毒属(Comovirus)和蚕豆病毒属(Fabavirus)病毒的通用RT-PCR检测方法。【方法】通过基因组序列的多重比对分析,在其保守区域设计简并引物,用于这2个病毒属病毒的通用RT-PCR检测,并进行灵敏性、特异性试验。为便于PCR产物直接测序,在简并引物中引入通用测序引物(RV-M和M13-47),并通过序列分析对病毒种类鉴定。利用该方法对来自福建柘荣的太子参病毒进行检测验证。【结果】设计一对简并引物,建立了一个用于扩增豇豆花叶病毒属和蚕豆病毒属病毒部分依赖于RNA的RNA聚合酶(Rd Rp)基因的通用RT-PCR方法。该方法成功用于检测安第斯马铃薯斑驳病毒(Ap Mo V)、蚕豆染色病毒(BBSV)、蚕豆真花叶病毒(BBTMV)、菜豆荚斑驳病毒(BPMV)、豇豆花叶病毒(CPMV)、豇豆重花叶病毒(CPSMV)、南瓜花叶病毒(Sq MV)、红三叶草斑驳病毒(RCMV)和萝卜花叶病毒(Ra MV)9种豇豆花叶病毒属病毒;蚕豆萎蔫病毒1号(BBWV1)、蚕豆萎蔫病毒2号(BBWV2)2种蚕豆病毒属病毒共计17个分离物,而不能与同亚科的线虫传多面体病毒属病毒及健康寄主植物反应,显示出良好的广谱性和特异性。在简并引物的5′端分别加入一段非互补的通用测序引物序列(RV-M和M13-47),不仅可以利用该通用测序引物进行PCR产物直接测序,而且检测灵敏度可以提高10—100倍。序列及系统发育分析表明,所扩增的序列可以把豇豆花叶病毒属和蚕豆病毒属病毒区分到种的水平。利用该方法测定了BBSV的部分Rd Rp基因序列,显示出与RCMV具有最近的亲缘关系。利用该方法在太子参中检出BBWV2。【结论】建立的通用RT-PCR方法可用于豇豆花叶病毒属和蚕豆病毒属病毒的广谱性检测,结合序列可进行病毒种类的快速鉴定,并且可能用于新病毒种类的检测鉴定。
- 叶志红廖富荣郭木金方志鹏陈青陈红运林石明林毅
- 关键词:RT-PCR