申欣
- 作品数:84 被引量:262H指数:8
- 供职机构:淮海工学院更多>>
- 发文基金:江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学天文地球文化科学更多>>
- 软甲纲动物和星虫动物线粒体基因组特征及分子进化研究
- 在过去的几十年间,利用线粒体基因组序列探讨后生动物深层次的系统发育关系已取得初步进展。这主要得益于,线粒体基因组与其它分子标记相比具备诸多优势。迄今为止,超过1,200个后生动物的线粒体基因组已被测定,然而所获得的数据分...
- 申欣
- 关键词:线粒体基因组分子进化
- 文献传递
- 草鱼葡萄糖激酶基因全长cDNA分子克隆及组织表达研究
- 采用RT-PCR和RACE技术,从草鱼肝胰脏中克隆了葡萄糖激酶(GK)基因全长cDNA.该cDNA全长2066bp,含有1个1431bp的开放阅读框,编码476个氨基酸.GK蛋白计算分子量53.7kDa,等电点5.11....
- 程汉良彭永兴许建和易乐飞董志国孟学平申欣
- 关键词:草鱼葡萄糖激酶全长CDNA
- 基于核基因的无柄目分子系统发育研究被引量:1
- 2018年
- 无柄目是潮间带生态以及海洋污损生物研究中的模式生物.对无柄目17科77属274种的4种核基因(RP-Ⅱ,EF1,18S,H3)618条核酸序列分别进行了多序列比对及系统发育分析.基于3种核基因RP-Ⅱ,18S和H3的进化树显示,在藤壶亚目Balanomorpha中,古藤壶科Archaeobalanidae、藤壶科Balanidae和塔藤壶科Pyrgomatidae形成单系总科Balanoidea;小藤壶科Chthamalidae与笠藤壶科Tetraclitidae成为单系总科Balanoidea的姊妹进化分支,小藤壶科位于系统进化树的基部.基于RP-Ⅱ,EF1和H3的进化树显示,笠藤壶科和小藤壶科是单系群,而藤壶科和古藤壶科是否为单系群尚需进一步探讨.
- 李咏琪蔡月凤沈思瑜宋隽阎斌伦程汉良申欣
- 关键词:核基因分子系统发育
- 草鱼乙酰辅酶A羧化酶β基因全长cDNA分子克隆与表达分析被引量:5
- 2018年
- 本试验采用反转录PCR(RT-PCR)和c DNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得草鱼乙酰辅酶A羧化酶β(ACC2)基因全长c DNA,并采用实时荧光定量PCR技术研究ACC2基因在肝胰脏、脾脏、大脑、前肠、中肠、后肠、肾脏、肌肉、心脏和肠系膜脂肪等组织中的表达,同时,还对饲喂不同脂肪源饲料12周后草鱼肝胰脏和肌肉中以及饥饿再次投喂后3、6、12和24 h肝胰脏中ACC2 mRNA的表达变化进行了研究。结果显示:草鱼ACC2基因c DNA全长7 533 bp,含1个7 149 bp的开放阅读框,编码2 382个氨基酸,ACC2蛋白计算分子质量为268.34 ku,等电点为6.13。草鱼ACC2基因存在可变剪接,形成另外1个同工型(isoforms),比分子质量为268.34 ku的ACC2蛋白少8个氨基酸。ACC2基因在所有检测组织中均有表达,ACC2 mRNA的相对表达量在肌肉中最高,为29.13,在肝胰脏中最低,仅为1.90。肌肉中ACC2 mRNA的相对表达量与大脑、前肠和心脏差异不显著(P>0.05),但显著高于其他组织(P<0.05)。投喂不同脂肪源饲料对草鱼肝胰脏及肌肉中ACC2 mRNA相对表达量无显著影响(P>0.05);饥饿再投喂后草鱼肝胰脏中ACC2 mRNA相对表达量在12 h达到高峰值,为6.17,之后明显下降,24 h时仅为2.84。本试验成功克隆了草鱼ACC2基因全长c DNA,其主要的功能位点ATP结合位点、生物素结合位点与其他脊椎动物相比基本保守。草鱼ACC2基因主要在肌肉等脂肪分解活跃的组织中表达,投喂不同脂肪源饲料对草鱼肝胰脏中ACC2 mRNA的相对表达量无显著影响;饥饿再投喂后,肝胰脏中ACC2 mRNA的相对表达量在投喂12 h后最高。
- 严媛程汉良许建和韩振易乐飞申欣丁祝进
- 关键词:草鱼分子克隆基因表达
- 10种软骨鱼线粒体基因组特征分析被引量:5
- 2011年
- 综合分析了软骨鱼10个物种的线粒体基因组全序列,全面揭示软骨鱼线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因和差异位点等。软骨鱼10个物种线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因,而且其基因排列完全相同。真鲨目和鳐形目线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的Ka/Ks比值都远远低于1(0.019 1~0.156 4),显示出较强的纯化(负)选择。基于线粒体基因组构建的系统发育树结果显示,软骨鱼纲分为两支:全头亚纲和板鳃亚纲。在板鳃亚纲内部,鳐形目和鲼形目聚为一支;真鲨目、鼠鲨目、须鲨目、虎鲨目和角鲨目聚为一支,其亲缘关系为:{[(真鲨目+鼠鲨目)+须鲨目)]+虎鲨目}+角鲨目。软骨鱼线粒体基因组差异位点分析表明,在软骨鱼群体遗传的研究中,nad5和nad4基因是理想的分子标记,可以作为cox1基因辅助的分子标记,用于分析软骨鱼不同群体之间的遗传多样性,为其生物多样性的保护及合理利用其生物资源提供更多保障。
- 申欣田美孟学平程汉良
- 关键词:线粒体基因组系统发育分子标记
- 19种蔓足类线粒体基因组特征及系统发育研究被引量:3
- 2017年
- 综合分析了蔓足类19个物种的线粒体基因组全序列,揭示了蔓足类线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因和差异位点等.蔓足类线粒体基因组长度为14 906~15 955bp,基因组编码链的A+T含量为63.1%~73.1%,表现出不同程度的AT偏好性;19个物种线粒体基因组的基因总数多数为37个,包括13种蛋白质编码基因、2个rRNA和22个tRNA;除笠藤壶科的基因排列顺序较为保守外,其他科物种的基因排列顺序相差较大;在13个蛋白质编码基因中,ATP8和ND2的差异位点比例最高,COX1最为保守.系统进化分析显示,藤壶科和古藤壶科均非单系群.
- 宋隽申欣蔡月凤陈盼盼周亮田美程汉良阎斌伦
- 关键词:蔓足类藤壶线粒体基因组系统发育
- 南极磷虾(Euphausia superba)线粒体基因组特征及其分子标记应用被引量:5
- 2008年
- 为揭示南极磷虾(Eupahusia superba)(甲壳动物:软甲纲:磷虾目)线粒体基因组特征,及通过比较不同海域南极磷虾的线粒体基因组探讨潜在的分子标记,采用Long PCR扩增技术获得采自普里兹湾(Prydz Bay)南极磷虾线粒体基因组DNA,综合Primers-walking和Shotgun方法进行测序;通过生物信息学软件(DOGMA、tRNAscan-SE1.21和DnaSP4.10.7等)进行基因预测及序列分析。南极磷虾线粒体基因组全长15498 bp以上(部分非编码区未测定),包含13个蛋白编码基因、2个核糖体RNA基因和23个转运RNA基因。与后生动物线粒体基因组标准的基因组成相比,存在1个trnN基因的重复。南极磷虾线粒体基因组的基因排列与泛甲壳动物线粒体基因组的原始排列相比,出现4个转运RNA基因的易位:trnL1、trnL2、trnW和trnI以及1个trnN的重复。比较采自普里兹湾(Prydz Bay)和威德尔海(Weddell Sea)南极磷虾的线粒体基因组,作者发现在南极磷虾线粒体基因组的主编码基因中,变异最大的是nad2基因,差异位点高达61个,其次是nad5基因,差异位点有12个;而cox1基因的变异位点仅有3个。Nad2基因和nad5基因可作为cox1基因辅助的分子标记,用于分析南极磷虾不同地理种群之间的遗传多样性,为合理利用南极磷虾生物资源提供保障。
- 申欣孙松王海青王敏晓任建峰张光涛刘斌
- 关键词:南极磷虾线粒体基因组海洋生态浮游动物分子标记
- 草鱼乙酰辅酶A羧化酶基因全长cDNA克隆
- 提取草鱼肝脏总RNA,采用RT-PCR和RACE方法扩增草鱼乙酰辅酶A羧化酶(ACC)基因的核心序列、3′末端和5′末端序列,克隆测序,将各片段序列组装得到草鱼ACC基因全长cDNA序列,并对所得到的序列进行生物信息学分...
- 程汉良姬南京彭永兴申欣吴陈晨许建和董志国
- 关键词:草鱼乙酰辅酶A羧化酶RT-PCRRACE全长CDNA
- 日粮中血粉替代鱼粉对草鱼生长和肌肉氨基酸组成的影响
- 在草鱼日粮中用不同比例的血粉替代鱼粉,饲养过后对草鱼的生长指标及肌肉营养进行分析,从而评估日粮中血粉替代鱼粉对草鱼生长及肌肉氨基酸组成的影响。实验的草鱼共360尾,随机分为4组,每组设3个重复,每个重复30尾鱼。对照组饲...
- 孙树奎高琦韩振许建和易乐飞申欣丁祝进程汉良
- 关键词:血粉草鱼肌肉营养
- 文献传递
- 草鱼葡萄糖激酶基因全长cDNA分子克隆及组织表达研究
- 采用RT-PCR和RACE技术,从草鱼肝胰脏中克隆了葡萄糖激酶(GK)基因全长cDNA。该cDNA全长2066bp,含有1个1431bp的开放阅读框,编码476个氨基酸。GK蛋白计算分子量53.7kDa,等电点5.11。...
- 程汉良彭永兴许建和易乐飞董志国孟学平申欣
- 关键词:草鱼葡萄糖激酶全长CDNA