方柏山
- 作品数:329 被引量:821H指数:14
- 供职机构:厦门大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金福建省自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学轻工技术与工程化学工程自动化与计算机技术更多>>
- 基于修正的伪氨基酸组成预测氧化还原酶辅酶类型被引量:1
- 2008年
- 从序列出发快速确定氧化还原酶的辅酶依赖类型对于了解其结构和功能、催化机制及构建辅酶再生体系具有重要指导作用。对Chou提出的伪氨基酸组成方法进行了修正并用于提取氧化还原酶序列特征值,采用k-近邻算法预测其辅酶依赖类型。当λ=48,w=0.1时,10倍交叉验证结果表明:其ROC曲线下面积为0.9536,预测精度达92.0%,比最优条件下伪氨基酸组成预测精度提高了3.5%;与其他7种常见特征值提取方法相比,修正的伪氨基酸组成表现最好。结果表明从序列出发预测氧化还原酶辅酶依赖类型是可行的,且修正的伪氨基酸组成可望成为一种新的有效提取蛋白质序列特征值方法。
- 张光亚李红春方柏山
- 关键词:氧化还原酶ROC曲线下面积
- 链霉菌G-HD-4产黑色素发酵条件的优化
- 2010年
- 为提高链霉菌G-HD-4的黑色素产生量,以L-酪氨酸为底物,对该菌种产黑色素的工艺条件进行研究,通过单因素试验和均匀设计试验,得到最佳产黑色素的发酵条件为:马铃薯15g/100mL、乳糖2.5g/100mL、干酪素2.07g/100mL、MgSO40.11g/100mL、KH2PO40.25g/100mL、L-酪氨酸0.25g/100mL、以接种量为6%(体积分数),培养基起始pH值为6.0,装液量为25mL,28℃,150r/min振荡培养5d,黑色素产量可达(13.4±0.05)g/L,比在基础培养基中的黑色素产量(5.78g/L)提高约2.3倍。
- 郑晨娜罗婉妹陈慧勤吴晓岚方柏山
- 关键词:黑色素发酵均匀设计
- 克雷伯杆菌利用生物柴油副产物甘油生产氢气和1,3-丙二醇的研究被引量:7
- 2006年
- 以Klebsiella pneumoniae DSM2026为出发菌株,通过紫外线诱变,选育得到能耐较高浓度生物柴油副产物甘油生产H2和1,3-丙二醇(1,3-PD)的菌株21株,命名为Kp1~Kp21。通过比较,Kp8菌株产量最高,1,3-PD和H2产量分别达到0.36g/50mL和0.99mmol/50mL,比出发菌株分别提高了3.5倍和4.2倍。对Kp8菌株发酵条件进行优化,得到最佳培养条件为pH7.0,培养温度37℃,接种量10%(v/v),废甘油浓度为30g/L。在该条件下H2产量为1.0mmoL/50mL,1,3-PD产量为7.5g/L,甘油转化率为83.3%。
- 刘飞方柏山
- 关键词:克雷伯杆菌生物柴油1,3-丙二醇紫外诱变
- 一种苹果酸脱氢酶PbMDH及其编码序列和应用
- 本发明提供一个来自于蒌叶假单胞菌Pseudomonas beteli的苹果酸脱氢酶PbMDH,该苹果酸脱氢酶的编码基因及其应用。本发明提供的带有苹果酸脱氢酶PbMDH核苷酸序列的克隆质粒可以通过转导、转化、结合转移的方法...
- 方柏山王雅丽张永辉苏洁茹
- 补料分批培养过程模拟被引量:3
- 1994年
- 引用广义对数方程描述了两次恒流补料分批培养的全过程。结果表明:过程模拟的好坏很大程度上取决于模拟精度的选择;微生物比生长速度μ及限制底物比消耗速度q与微生物细胞中核糖核酸的含量存在某种定量关系。
- 方柏山
- 关键词:补料分批培养对数方程
- HPLC法检测发酵液中的木糖和木糖醇被引量:8
- 2006年
- 建立高效液相色谱检测发酵液中木糖和木糖醇含量的分析方法.色谱柱为ZORBAX碳水化合物,柱温30℃,流动相为乙腈:水=80:20(V/V),流速1.2mL/min,示差折光检测器检测.木糖和木糖醇在 0.5~40.0mg/mL范围内浓度与峰面积线性关系良好(R2分别为0.9931和0.9947),平均回收率分别为99.80%(n=5,RSD=1.35%)和99.62%(n=5,RSD=1.65%).方法简便、快速、准确。
- 蔡婀娜李夏兰方柏山
- 关键词:木糖木糖醇发酵高效液相色谱
- 一种1,3-丙二醇的制备方法
- 一种1,3-丙二醇的制备方法,涉及一种化工原料。构建生物砖元件dhaT,再构建生物砖元件T7 promoter-RBS-dhaT-TT,然后构建组基因环路装置T7-RBS1.0-dhaB-TT-T7-RBS1.0-yqh...
- 方柏山池帅
- 文献传递
- 两种超嗜热菌基因组中同义密码子使用的分析被引量:2
- 2006年
- 对两种超嗜热菌敏捷气热菌(Aeropyrum pernix)和风产液菌(Aqui fex aeolicus)的密码子使用进行分析.相对密码子使用值(RSCU)的计算表明,它们在密码子使用上具有一定的相似性,但也有不同的使用模式,导致这一现象的机制可能存在差异.密码子RSCU值对应分析表明,两种菌中高表达基因均具有相对较高的GC含量,但基因表达水平对密码子使用偏好的影响程度却不一样.在A.pernix中,它是造成整个基因组密码子使用偏好的最主要因素,而在A.aeolicus中却不是.
- 张光亚葛慧华方柏山
- 关键词:密码子使用
- 一种厌氧培养装置及其应用
- 本发明公开了一种厌氧培养装置及其应用,装置包括厌氧系统、发酵系统和控制系统;所述厌氧系统和发酵系统间通过管路连接,形成厌氧的气体循环,所述控制系统以分组形式实现单独控制各罐体的pH和温度条件;分组的模块化组装,操作便捷,...
- 方柏山张俊楠付友思
- 文献传递
- 源于发酵液的木糖醇的结晶热力学研究被引量:4
- 2007年
- 研究了木糖醇的溶解特性,考察了温度、溶剂组成、杂质等对木糖醇溶解度的影响。结果表明,木糖醇属于溶解度温度系数较大的一类物质;乙醇的加入可降低木糖醇的溶解度;而阿东糖醇、山梨醇等杂质会适当增大木糖醇的溶解度。通过测定木糖醇发酵处理液的介稳区宽度,确定极限过饱和度σ值为0.22,为发酵液制备木糖醇结晶体时的过饱和度确定提供了依据。
- 梅余霞方柏山
- 关键词:木糖醇溶解度发酵液