张莎
- 作品数:6 被引量:32H指数:4
- 供职机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金哈尔滨市科技攻关计划项目国家科技部农业科技成果转化资金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 猪流行性腹泻病毒N蛋白核仁定位信号对宿主细胞周期的影响被引量:5
- 2013年
- 为研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)核衣壳蛋白(N)与宿主细胞相互作用,本研究根据前期已经鉴定的PEDV N蛋白核仁定位信号序列,利用重叠延伸PCR(SOE-PCR)方法扩增出核仁定位信号序列缺失的PEDV N基因(dN),并将其与真核表达载体pAc-GFP-C1连接,构建重组质粒pAc-GFP-dN。将pAc-GFP-dN转染于Vero E6细胞中,利用激光共聚焦显微镜分析重组质粒pAc-GFP-dN表达蛋白的定位情况,并利用流式细胞仪检测转染细胞的周期变化。实验结果表明:与完整的N蛋白相比,缺失核仁定位信号的N蛋白不能定位于细胞核仁,同时丧失了使宿主细胞周期在G2/M期停滞的能力,从而揭示了N蛋白核仁定位信号对宿主细胞具有重要的影响。
- 刘随新石达陈建飞张鑫时洪艳刘孝珍张莎王璐冯力
- 关键词:猪流行性腹泻病毒核衣壳蛋白流式细胞术
- 2012年猪嵴病毒流行病学调查及3D基因的遗传变异分析被引量:11
- 2013年
- 为了解猪嵴病毒(PKV)的流行及变异情况,本研究根据PKV的3D基因保守区域核苷酸序列设计一对特异性引物,并利用RT-PCR方法对2012年来自24个省市84个猪场的病料样品共计236份进行3D基因的检测。结果显示:在236份病料中,共有63份为PKV阳性,阳性率为36.69%;而在检测的84个猪场中,共有36个猪场显示PKV阳性,猪场阳性率为42.85%。此外,对2012年分离的9个PKV部分3D基因进行测序分析,并与GenBank中登录的人、牛、猪以及鼠等嵴病毒株相关序列进行遗传变异分析。结果表明9个PKV 3D基因与国内外其他PKV株无论是在核苷酸水平上还是在氨基端水平上均具有较高的同源性,表明PKV的3D基因具有较高的保守性,可以作为病原检测的靶基因。
- 张莎石达陈建飞时红艳张鑫刘孝珍刘随新王璐陈洪岩冯力
- 关键词:流行病学调查3D基因
- 2011年~2012年G9型猪轮状病毒流行病学调查及VP7基因遗传进化分析被引量:12
- 2013年
- 为分析G9型猪轮状病毒(RV)的遗传变异情况,本研究根据GenBank中VP7序列设计合成一对扩增VP7基因的引物,采用PCR方法对2011年~2012年分离的部分RV VP7基因进行扩增、克隆和序列测定,并进行比对和遗传进化分析。结果表明:531份病料中RV阳性份数为39,阳性率为7.34%;而在检测的121个猪场中,共有23个猪场显示阳性,猪场阳性率为19%。VP7基因全长1 062 bp,含有一个982 bp的开放阅读框,编码326个氨基酸。与参考病毒株VP7全长基因核苷酸比较,同源性为91.5%~99.3%。在31 nt、56 nt、75 nt、82 nt、191 nt、215 nt等位置均存在点突变,无插入和缺失。核苷酸系统发育进化树表明:黑龙江省哈尔滨市、桦南、绥化,辽宁省大连市、内蒙古自治区采集病料样品的基因间差异较小,与采集自中国广西、浙江、贵州、北京的病料样品基因相比差异性较大,这表明VP7基因存在地域差异。
- 王璐时洪艳陈建飞张鑫史楠石达刘随新张莎冯力
- 关键词:轮状病毒VP7基因
- PEDV N蛋白亚细胞定位信号的鉴定
- 石达陈建飞时红艳张莎王璐刘随新刘孝珍冯力
- Vero细胞nucleolin和fibrillarin基因的克隆及序列分析
- 2012年
- 为克隆及分析Vero细胞的nucleolin和fibrillarin基因,本研究根据人类的相关基因设计两对引物,从Vero E6细胞中扩增nucleolin和fibrillarin基因。测序结果显示nucleolin基因序列长度为2 139 bp,编码712个氨基酸;fibrillarin基因序列长度为969 bp,编码322个氨基酸。与GenBank中登录的人类相应序列相似性高达97%,处于同一进化分支,表明该基因具有种属特异性并且保守性很高;同时利用软件对nucleolin和fibrillarin预测蛋白进行了生物信息学分析,从而为研究冠状病毒核蛋白与核仁蛋白相互作用奠定了基础。
- 石达陈建飞时红艳王洪峰张鑫刘孝珍张莎刘随心王璐冯力
- 关键词:核仁素纤维蛋白克隆
- 猪嵴病毒流行病学调查及CH/HZ/2011株全基因序列分析
- 猪嵴病毒(Porcine Kobuvirus,PKV)和其它两个国际官方确认的已知成员:爱知病毒(Aichivirus,AiV)和牛嵴病毒(Bovine kobuvirus,BKV)都属于小RNA病毒科嵴病毒属,但是到目...
- 张莎
- 关键词:3D基因分子流行病学全基因组
- 文献传递