张宏
- 作品数:11 被引量:22H指数:3
- 供职机构:上海海洋大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学水利工程自动化与计算机技术更多>>
- 不同水系银鲴自然群体线粒体COI基因遗传变异研究被引量:6
- 2015年
- 为了解银鲴(Xenocyprisargentea)的遗传资源状况,利用线粒体COl基因序列比较分析长江、钱塘江和黑龙江水系中银鲴群体的遗传多样性和种群分化情况。结果显示,在110条528bp的COl序列中,碱基T、C、A、G的平均含量分布为27.13%、18.56%、28.70%、25.61%,检测出变异位点15个。多样性分析显示,各地理种群单倍型多样性均较高,核苷酸多样性均较低,长江群体单倍型多样性(0.742±0.053~0.911±0.033)高于黑龙江(0.731±0.087)和钱塘江(0.552±0.137)群体,推测与不同地理群体所处生境多样性有关。单倍型网络结构显示出明显的地理分布格局,3个群体两两之问都存在显著的遗传分化,分子变异方差分析(AMOVA)也显示银鲴群体的遗传变异主要发生在水系之问(40.21%),进一步说明银鲴种群之问的遗传分化与种群问的地理隔离有关。种群历史分析显示,只有长江群体的中性检测呈现显著的负值(FS=-7.07821,P〈0.05)且岐点分布呈现明显的单峰,共同支持该群体在近期发生过种群扩张事件,而钱塘江和黑龙江两群体与长江群体都经历着不同的种群历史事件。
- 刘军赵良杰刘其根张宏
- 关键词:COI种群分化
- 千岛湖大眼华鳊形态度量学和D-loop序列分析被引量:7
- 2013年
- 为了解千岛湖大眼华鳊不同地方群体的遗传分化,以千岛湖大眼华鳊为材料,通过形态度量学和分子生物学的方法对其进行了研究。形态变量的主成分分析(PCA)结果的散布图显示,3个群体的标本重叠在一起,表明3个水域的大眼华鳊没有发生形态上的分化。通过对线粒体D-loop区的序列分析共发现了27个变异位点,35个单倍型。NJ树和单倍型网络图均未显示出各群体有分化的趋势。3个群体的平均碱基组成差异很小,且A+T含量(64.82%)高于G+C含量(35.18%),各群体均表现出高单倍型多样性(h)和低核苷酸多样性(π)的特点,汾口的遗传多样性最高(h=0.968±0.018,π=0.004 76±0.000 49),临岐次之(h=0.968±0.017,π=0.004 53±0.000 41),富文最低(h=0.937±0.037,π=0.003 30±0.000 35)。各群体间均具有较强的基因流(Nm>4),其中汾口和富文之间最强(Nm=27.40)。两两群体之间的遗传分化指数(Fst)都呈现出不显著的轻度分化(Fst<0.05,P>0.05)。主成分分析和线粒体序列分析综合表明,千岛湖各水域的大眼华鳊属于一个随机交配群体。为了保护这一重要的渔业资源,建议继续保持千岛湖大眼华鳊的基因流格局,减少人为因素对该物种在库区活动的影响。
- 赵良杰何光喜周小玉贾佩峤武震宋固张宏刘其根
- 关键词:主成分分析D-LOOP千岛湖
- 长江口深水航道及附近海域表层悬浮泥沙光谱特性研究
- 深水航道位于长江口三级分汊口南港~北槽之间,被人们誉为“黄金水道”,对上海的经济发展有着重要的作用。因受到巨大潮流、径流和上游来沙的影响,长江口河槽变化复杂,地处口门的拦门沙航道已经严重制约了上海等长江三角洲地区的经济发...
- 张宏
- 文献传递
- 聚丙烯酰胺凝胶染色、拍照及切胶装置
- 本实用新型涉及一种聚丙烯酰胺凝胶染色、拍照及切胶装置,包括底盘和边栏,边栏安设在底盘上,底盘上设置有若干第一漏水孔,第一漏水孔设置在底盘的周边,且底盘为透明底盘。较佳地,边栏和底盘一体成型,边栏的高度为1.5~2.7cm...
- 刘其根周静杨丽丽张宏赵良杰周小玉
- 文献传递
- 鱼的身体参数测量装置
- 本实用新型涉及一种鱼的身体参数测量装置,所述装置可以承载鱼的重量,该装置包括底板和第一、二和三限位件,所述底板具有一测量平面;三个限位件用于限定鱼的位置。该装置可同时测量鱼体全长、体高、体重,可以简化实验室鱼类样品身体参...
- 张宏刘其根胡忠军刘军黄翠温文科
- 文献传递
- 钱塘江伍氏华鳊(Sinibrama wui.)线粒体控制区的遗传结构
- 本文采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法获得了一个分布于钱塘江水系共334条大眼华鳊个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)924 bp核苷酸的序列,探讨了其种群遗传结构和分化。334条个体的序列经...
- 赵良杰周小玉刘其根张宏
- 关键词:线粒体DNA控制区种群扩张
- 文献传递
- 基于神经网络的长江口深水航道海域悬浮泥沙浓度研究
- 航道治理和维护的核心问题为泥沙问题.本文在充分分析遥感和遥测数据的基础上,利用人工神经网络方法对长江口深水航道水域悬浮泥沙浓度进行了研究.当隐含层神经元个数为8时,模型的预测效果最好,预测的最大相对误差为28%,最小相对...
- 张宏韩震
- 关键词:遥测悬浮泥沙神经网络长江口深水航道
- 基于PCR-DGGE指纹图谱对千岛湖鲢、鳙肠内含物的初步研究被引量:3
- 2014年
- 为了解鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙(Aristichthys nobilis)在千岛湖中的食性差异,对千岛湖鲢、鳙肠道内的原核生物16S rDNA和真核生核18S rDNA中的可变区进行PCR-DGGE指纹图谱分析。分别得到53个原核生物的操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)和45个真核生物的OTUs。基于Dice相似系数进行的聚类以及群落的主成分分析(PCA)显示,鲢、鳙肠道内原核生物种群略有重叠,而真核生物种群差异明显。另外,对13尾鱼类样本的肠道原核生物和真核生物的多样性的曼-惠特尼U检验结果显示,鲢肠道内的原核生物的香浓多样性和物种数均显著低于鳙,而鲢真核生物的物种数要显著多于鳙。研究表明千岛湖鲢、鳙的摄食具有明显的差异。
- 胡忠军张宏赵良杰何光喜陈来生王金朋宋固刘其根
- 关键词:食物选择PCR-DGGE千岛湖
- 基于微卫星标记的四条水系翘嘴鲌种群遗传多样性研究
- 翘嘴鲌广泛分布于我国各大水系,是最主要的经济鱼类之一。随着人类活动的加剧及环境的恶化,翘嘴鲌的野生群体出现了衰退,小型化及低龄化现象严重,亟待开展对翘嘴鲌资源的保护工作,但目前尚无全面的翘嘴鲌遗传背景研究,无法为保护工作...
- 苏超群赵良杰张宏胡忠军刘其根
- 关键词:翘嘴鲌微卫星标记
- 千岛湖和长江圆吻鲴种群的遗传分化研究及对淡水鱼类分布模式的探讨
- 罗衡赵良杰张宏胡忠君刘军刘其根
- 关键词:线粒体COI基因遗传分化单倍型