刘全中
- 作品数:12 被引量:67H指数:4
- 供职机构:西北农林科技大学信息工程学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术文化科学农业科学更多>>
- 基于深度学习的多肽预测方法研究被引量:2
- 2021年
- 多肽,也可简称为肽,是α-氨基酸通过肽键连接在一起而形成的一类化合物,也是蛋白质水解的产物。它对人体的生长、发育、代谢有着重要的影响,部分多肽具有抗癌、抗菌、抗病毒、穿透细胞等特性,对于相应疾病的治疗具有重大意义。因此研究识别具有治疗特性的多肽方法至关重要,然而传统生物实验方法鉴定多肽耗时且昂贵,不适合处理高通量的序列数据。现有的基于机器学习的预测模型虽然大大提高了多肽的识别效率,但存在识别性能不足,泛化能力不够,以及一种模型只能有效识别特定的一种多肽等问题。针对以上问题,该文提出了一种通用深度学习模型DeepPEPred,该模型能有效预测多种不同的肽。在抗癌肽、抗菌肽、细胞穿透肽和结合肽四种不同肽数据集上进行十折交叉验证和独立测试,实验结果表明:与目前最新的方法PEPred-Suit相比,DeepPEPred在抗癌肽数据集上准确度提升了29.6%,MCC提升了59.7%;在抗菌肽、细胞穿透肽和结合肽三种数据集上准确度均提升了1.2%,MCC分别提升了2.3%、2.5%和2.4%,AUC分别提升了0.8%、0.3%和1.2%。
- 梁潇吴昊刘全中
- 关键词:多肽识别方法特征提取
- 基于内容的小麦害虫图像检索系统研究与实现被引量:7
- 2007年
- 以小麦害虫图像为研究对象,研究并开发了基于内容的害虫图像检索系统。重点研究了基于内容的图像检索中的图像特征提取、图像相似性度量和用户相关反馈技术。提出一种重叠四分块颜色矩和一种基于BP神经网络的图像相似性度量方法,并引入灰色相关反馈算法实现了基于语义的图像检索。应用排序评价方法、查准率与查全率对系统的检索性能进行测试,结果表明,系统具有一定的实用性,为快速准确地诊断、识别农作物害虫和害虫图像资源共享提供了技术依据。
- 李峥嵘刘月娥何东健龙满生刘全中
- 关键词:BP神经网络
- 基于堆叠集成的数据流分类被引量:3
- 2009年
- 对数据流分类分析的常用方法是集成学习。为了得到更好的分类效果,给出一种基于堆叠集成的数据流分类分析方法。该方法通过构造一个分类器对基分类器进行集成。实验结果表明,与基于投票或加权投票的集成方法相比,基于堆叠集成方法对概念漂移的快速适应能力以及预测准确率得到了提高。
- 梁春泉张阳刘全中
- 关键词:数据流分类概念漂移
- 基于集成学习的N6甲基化位点预测方法研究
- 2021年
- N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,6mA)是指腺嘌呤第6位氮原子的甲基化修饰。6mA在维持细胞正常的转录活性、DNA损伤修复、染色质重塑、遗传印记、胚胎发育和肿瘤发生等生物过程中起着非常重要的作用。通过生物实验的方法来鉴定6mA位点耗时且昂贵。近年来,研究界提出了一些基于机器学习的6mA位点预测方法,但这些预测方法过度依赖一种学习模型,导致模型的泛化能力不足以及预测的准确度不高等问题。集成学习综合多种预测模型的优点,具有较好的泛化能力及预测性能。因此,为了进一步提升6mA位点的预测准确性,提出了一种基于stacking集成学习的6mA位点预测模型Stack6mAPred。该模型由两层分类器组成,第一层集成了朴素贝叶斯、支持向量机(support vector machine,SVM)和LightGBM等三种主流分类器,第二层使用逻辑回归(logistic regression,LR)分类器。Stack6mAPred利用增强核苷酸组成等5种特征对实验已鉴定6mA序列和非6mA序列进行编码,使用XGBoost(extreme gradient boosting)算法进行特征选择,去除冗余特征。通过在水稻基准数据集上进行五折交叉验证,与目前性能最优的方法MM-6mAPred相比,Stack6mAPred在敏感性、特异性、准确度、MCC和AUC上均获得了更好的性能,分别提高了1.7%、1.36%、1.72%、0.06和0.031。
- 赵媛媛陈进祥李富义吴昊刘全中
- 关键词:支持向量机
- 基于开发模型对比的JavaEE课程教学方法研究被引量:2
- 2015年
- 鉴于Java EE课程具有的工程实践性、项目驱动性和知识整合性,本研究结合该课程的教学建设现状,对比分析了几种主流Java Web开发模型/框架(即经典MVC模型、SSH轻量级框架以及基于EJB的Java EE重量级框架)的开发方式,并以基于项目驱动的面向对象软件工程方法开发的典型业务项目作为教学案例。该研究对Java EE课程教学模式改革以及课程案例建设具有积极意义。
- 聂艳明刘全中李宏利邹青
- 基于梯度提升树算法的夏玉米叶面积指数反演被引量:28
- 2019年
- 为了快速、准确、大范围获取大田夏玉米的叶面积指数(Leaf area index,LAI),基于实地采集的夏玉米LAI和株高,结合同时期的无人机多光谱影像,选择与夏玉米LAI相关性较强的8种植被指数以及株高作为反演LAI的输入变量,采用梯度提升树(Gradient boosting decision tree,GBDT)算法建立植被指数及株高与叶面积指数之间的预测模型,并与支持向量机(Support vector machine,SVM)和随机森林(Random forest,RF)算法建立的模型进行预测精度对比。结果表明,GBDT算法在3个样本组中的LAI预测值与实测值R^2分别为0. 571 0、0. 755 8、0. 644 1,均高于SVM算法(0. 547 2、0. 679 1、0. 616 8)和RF算法(0. 550 5、0. 697 3、0. 629 5);对应的RMSE分别为0. 002 7、0. 001 5、0. 001 6,均低于SVM算法(0. 211 7、0. 152 3、0. 159 7)和RF算法(0. 244 7、0. 214 7、0. 208 0)。该研究为快速准确的大田夏玉米LAI遥感监测提供了技术和方法。
- 张宏鸣刘雯韩文霆刘全中宋荣杰侯贵河
- 关键词:夏玉米叶面积指数多光谱植被指数
- 图像中成熟苹果果实定位方法研究被引量:7
- 2016年
- 针对目前苹果果实图像定位中存在的准确度较低、速度较慢等问题,在分析比较的基础上,对苹果果实定位方法进行了进一步的思考和研究。以3点确定圆算法为中心,配合图像中树枝树叶部分的分割、果实边缘的检测及去除图像的噪声等技术,以使处理速度满足实时要求,并使果实定位结果准确。经测试,本方法对成熟苹果果实具有较好的定位效果。
- 李宏利刘全中
- 关键词:圆检测
- “双一流”建设背景下的高校图书馆学科服务实践探索——以西北农林科技大学图书馆为例被引量:10
- 2018年
- "双一流"建设方案的提出,使得学科服务在高校图书馆服务体系中占有越来越重要的位置。本文阐明了高校图书馆开展学科服务的挑战与机遇,分析了西北农林科技大学图书馆开展学科服务的现状以及存在的不足,提出了高校图书馆学科服务应采取主动出击,改变服务观念、打造一流学科服务团队、建立精品学科服务品牌、建立特色和重点馆藏等措施,确立图书馆在服务学校学科建设中的核心地位。
- 张娜刘全中
- 关键词:学科服务
- 高维度的数据强跳跃显露模式挖掘方法研究被引量:2
- 2013年
- 针对经典的对照模式树挖掘方法仅能有效地挖掘低维度数据的强跳跃显露模式问题,提出了一种高维度的数据强跳跃显露模式挖掘方法.首先,设计了一种动态对照模式树结构存储已拓展的模式及其关键信息;然后,构造了一个初始动态对照模式树存储频繁项及其在正、负例上的二进制串;最后,开发了基于初始动态对照模式树的强跳跃显露模式挖掘算法.在高维度的肿瘤基因表达数据集上进行实验,结果表明:与经典的对照模式树方法及其改进后的方法相比,所提出的方法挖掘速度更快,有效处理的维度更高;在可接受的时间内,该方法能挖掘出一些对照模式树方法不能发现的重要的强跳跃显露模式.
- 刘全中聂艳明宁纪锋
- 关键词:数据挖掘
- 基于计算思维的项目驱动式《Java语言程序设计》课程教学模式探讨被引量:1
- 2013年
- 《Java语言程序设计》课程强调学生动手能力培养,以教师为主、学生被动接受的授课方式严重影响其教学质量。本研究提出了一种基于计算思维的项目驱动式教学方法,该方法以项目驱动为导向、计算思维为主线,重点培养学生动手能力、运用知识解决问题的能力。
- 刘全中杨彩张阳
- 关键词:计算思维JAVA语言程序设计