魏冬青
- 作品数：65 被引量：101H指数：6
- 供职机构：上海交通大学生命科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学医药卫生生物学农业科学更多>>
- 分子亲脂-亲水性的量子化学描述(Ⅰ)——分子的亲脂和亲水表面被引量：2
- 2004年
- 给出基于分子结构的“启发式”亲脂 -亲水势 HMLP ( Heuristic molecular lipophilicity-hydrophilicitypotential)的理论分析和有说服力的算例 .用量子化学计算其分子表面的静电势 V( r)的分布 ,通过与周围原子表面静电势的比较 ,构造表达分子静电势的极性和大小的函数 L( r) .亲脂势 L( r)保留了静电势 V( r)描述分子静电作用的能力 ,并把应用范围扩展到疏水性的描述 .HMLP不使用原子的经验参数 ,但在 L( r)的构造中使用了经验的函数形式 .经参数化和指标化后 ,HMLP有望用于蛋白质结构与功能的研究和药物分子配体与生物大分子受体结合自由能的估算 .
- 杜奇石魏冬青李爱秀
- 关键词：分子模拟生物信息学药物分子设计量子化学
- 花椒素的发现及其抗衰老作用
- 叫做WGX-5O(原名gx50)的分子可以使老鼠的皮肤年轻化。而这个分子是一个花椒提取物，称作花椒素。本文介绍这个分子的发现过程，药效，药理作用的确定，以及最近的一些研究进展，具体包括基于乙酸胆碱受体以及中药有效成分的抗...
- 魏冬青张永红徐沁熊毅童林军朱宝宽
- 关键词：花椒实验药理抗衰老作用
- 细胞色素酶2D6的分子对接以及分子动力学研究被引量：2
- 2010年
- 细胞色素酶P450是人体内重要的药物代谢酶.通常,这类酶在其结构中都含有一个亚铁血红色分子,并且负责代谢超过90%的已知药物分子.细胞色素酶2D6是这类酶中的重要一员,它负责代谢大约20%～30%的已知药物分子.利用分子对接和分子动力学模拟的方法,研究了细胞色素酶2D6的结构特征以及其与药物分子之间的相互作用.并且发现,细胞色素酶2D6活性位点中的Glu216,Asp301,Ser304和Ala305在其与药物分子的相互作用中有着重要的作用.它们可以形成一个或者多个氢键来固定药物分子.同时其活性位点中的Phe120可以通过形成一定的Π-Π相互作用来识别和固定药物分子.这些发现有助于进一步了解细胞色素酶2D6的结构特征,特别是其活性位点附近的结构特征,理解细胞色素酶2D6代谢药物的机理.同时,由于细胞色素酶2D6存在着单核苷酸多肽性,所得到的结果可以为个性化医疗提供一定的理论基础.
- 王靖方张成城魏冬青
- 关键词：细胞色素酶分子对接分子动力学模拟个性化医疗
- 个性化药物,花椒素的发现与抗衰老作用
- 精准医学研究已成为新一轮国家科技竞争和引领国际发展潮流的战略制高点。以我国常见高发重大疾病及若干罕见病为切入点，构建百万人级自然人群国家大型健康队列和特定疾病队列、多层次精准医疗知识库体系和生物医学大数据共享平台，突破新...
- 魏冬青
- 关键词：抗炎作用转录因子-ΚB抗衰老机制
- 航天新材料金属锆的压缩行为
- 2012年
- 在密度泛函理论的基础上,运用局域密度近似(LDA)和广义梯度近似(GGA)两种方法,并通过第一性原理等方法对锆晶体在0～50 GPa下的物理性质进行了深入、系统的研究.结果表明,相比于广义梯度近似的计算结果而言,局域密度近似的计算结果和实验值更接近,但两者相差不是很大.并通过经典方法对锆晶体模拟计算了高压下的结构性质,得到的结果表明,在讨论的压强范围内,晶格参数与晶胞体积发生了非线性的变化,然而晶胞能量却随压强线性变化.通过对其相应的弹性性质的分析,发现随着压强的增大,锆晶体获得较好的延展性以及力学的稳定性.同时还得到了关于金属锆的能带结构特性及其光学性质,证实压强的改变对金属锆电子性质不会带来太大影响.
- 黄琳苑晓丽崔守鑫魏冬青
- 关键词：锆第一性原理机械性质光学性质
- 植物化合物在制备预防和治疗阿尔茨海默症药物中的应用
- 本发明涉及生物医药技术领域，具体涉及植物化合物在制备预防和治疗阿尔茨海默症药物中的应用，在本发明中，选择了三种具有最高结合亲和力的植物化合物表没食子儿茶素‑3‑没食子酸酯，白蛋白素和黑色素来对由大鼠秋水仙碱的集中给药诱导...
- 魏冬青阿里夫·马里克阿南·纳兹苏莱曼·瓦卡塔希尔·穆罕默德
- 文献传递
- 加巴喷丁与阳离子相互作用提高其稳定性的研究
- 2018年
- 目的为了减少或抑制副反应的发生,研究在真空以及乙醇溶剂中添加不同离子前后加巴喷丁药物分子脱水缩合反应的分子机制及反应势垒。方法采用密度泛函理论(DFT)的B3LYP方法,在6-311+G (d,p)基组水平上,对添加不同离子前后的药物分子结构进行优化,计算其结构参数以及热力学参数。结果得到加入不同阳离子的反应势垒均明显高于未加入离子前的反应势垒,其中添加锌离子(Zn2+)抑制效果最好。结论证明加入不同阳离子可以有效抑制加巴喷丁缩合生成3,3-亚戊基丁内酰胺的副反应。其作用规律是通过静电作用以及改变活性基团的电子分布,提高加巴喷丁分子内缩合的反应势垒,从而抑制其副反应的发生。
- 杨理想李代禧刘宝林魏冬青郭柏松栾翰森奚泉王浩
- 关键词：密度泛函理论加巴喷丁反应势垒稳定化
- (R)-N-[[3-[3-氟-4-吗啉基]苯基]-2-氧代-5-噁唑烷基]甲醇的合成被引量：4
- 2005年
- 利奈唑酮是新上市的一种口恶唑烷酮类全合成抗菌药,本研究对其关键中间体(R)-N-[[3-[3-氟-4-吗啉基]苯基]-2-氧代-5口-恶唑烷基]甲醇(1)的合成方法做了改进.合成3-氟-4-吗啉基硝基苯时,用价廉易得的三乙胺代替二异丙基乙胺,反应时间由72h缩短到6h;合成3-氟-4-吗啉基苯胺时,将溶媒改为丙酮,采用Pd/C(10%)还原,反应液直接与氯甲酸苄酯反应制得N-苄氧羰基-3-氟-4-吗啉基苯胺,实现了两步合一,收率提高到93.2%;合成(1)时,反应温度提高到-50℃左右,实验条件较文献方法相对温和.
- 李云黄长江高慧高维娜刘登科徐为人杜奇石魏冬青
- 关键词：噁唑烷酮利奈唑酮
- 碳环类神经氨酸酶抑制剂的2D-QSAR研究被引量：2
- 2006年
- 对32个碳环类神经氨酸酶抑制剂进行了二维定量构效关系(2D-QSAR)研究,27个作为训练集,5个作为测试集,对计算所得的理化和量化参数进行预选后,采用偏最小二乘法(Partial least squares,PLS)建立预测模型,该模型的非交叉法验证相关系数为R2=0.976 2,交叉法验证相关系数为R2CV=0.965 1;以此预测模型对测试集的5个化合物的活性进行预测,相关系数为R2pred=0.877 9,表明该模型具有较强的预测能力,可以指导对已有的流感药物进行化学修饰,并能指导新的神经氨酸酶抑制剂的设计及合成.
- 郑会勤李云蒋志勤杜奇石魏冬青
- 化学基元组学与药物创新
- 2013年
- 化学基元组学(chemomics)是与化学信息学、生物信息学、合成化学等学科相关的交叉学科.生物系统从内源性小分子(天然砌块)出发,通过酶催化的化学反应序列制造天然产物.生物系统通过化学反应和天然砌块向目标天然产物"砌入"一组原子,这样的一组原子称为化学基元(chemoyl).化学基元组(chemome)是生物组织中所含有的化学基元的全体.化学基元组学研究各种化学基元的结构、组装与演化的基本规律.在生存压力和繁衍需求的驱动下,生物系统已经进化出有效手段来合成天然产物以应付环境的变化,并产生了丰富多彩的生物和化学多样性.近年来,人们意识到药物创新的瓶颈之一是药物筛选资源的日益枯竭.化学基元组学可以解决这个瓶颈问题,它通过揭示生物系统制备化学多样性的规律,发展仿生合成方法制备类天然化合物库(quasi natural product libraries)以供药物筛选.本文综述了化学基元组学的主要研究内容及其在药物创新各领域中的潜在应用.
- 徐峻顾琼刘海波周家驹卜宪章黄志纾鲁桂李丁魏冬青王领古练权
- 关键词：化学信息学生物信息学药物创新仿生合成
