雷玥 作品数:22 被引量:146 H指数:7 供职机构: 天津市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 天津市科技支撑计划 天津市科技计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
轮状病毒亚单位疫苗研究进展 2021年 轮状病毒(RV)是全球5岁以下儿童严重腹泻的主要病原体。目前尚无治疗RV的特效药,疫苗是预防和控制RV感染最有效的手段。已上市的RV疫苗在低收入国家疫苗效力低。因此发展新型非复制型亚单位疫苗对于降低低收入国家RV的发病率和死亡率有重要意义。我们就目前RV亚单位疫苗的研究进展进行综述。 雷玥 庄志超 田宏 李晓燕关键词:轮状病毒 亚单位疫苗 腹泻 天津市2018-2020年人轮状病毒株VP7、VP4和NSP4基因特征 被引量:3 2021年 目的对天津流行的人A组轮状病毒VP7、VP4和NSP4基因进行分型和序列特征分析。方法收集2018—2020年天津市急性腹泻A组轮状病毒(Rotavirus group A,RVA)阳性病例的粪便标本,提取核酸,进行RT-PCR扩增VP7、VP4和NSP4基因片段全长并进行测序和进化树分析。结果本次研究所有RVA均属于G9P[8]基因型,进化树分析其VP7和VP4基因分别属于G9-VI和P[8]-3亚型。分析NSP4基因片段发现19株为E1型,12株为E2型。TJ株VP7、VP4、NSP4与疫苗株和参考株比对发现在关键位点有氨基酸替代现象。31个TJ-VP7氨基酸序列与Rotavac G9和Rotasiil G9 VP7相比,各有4个和3个替换位点。31例天津株VP8*核苷酸序列与Rotarix P[8]-1和RotaTeq相比,各有6个和3个氨基酸差异。天津株VP5*核苷酸与两种疫苗相比,仅在RotaTeq的5-1区I388L这一处发现氨基酸位点变异情况,其余11个氨基酸位点高度保守;而与Rotarix5-1到5-5区氨基酸序列完全一致。TJ E1株与疫苗株的NSP4序列相比在ASI和ASII区分别有2和3个氨基酸位点发生变异;TJ E2株与疫苗株的NSP4序列相比在ASI-ASIV分别有3、8、2和5个氨基酸位点发生替换。2018—2020年在天津地区检测到19株G9P[8]-E1型RVA,12株G9P[8]-E2型RVA,这是首次在天津发现G9P[8]-E2重组基因型。结论与同基因型疫苗株和参考株相比,位于TJ株VP7、VP4和NSP4抗原位点的改变对于疫苗保护效力的影响还需进一步研究。需要对轮状病毒分子变异和重组现象进行持续监测,不只是单一监测G/P分型情况,要考虑多基因片段共同分析和全基因组测序,以便及时追踪和掌握轮状病毒的重组和变异情况。 雷玥 庄志超 田宏 李晓燕关键词:轮状病毒 系统进化分析 用于流感病毒分离的咽拭标本液冷藏条件初探 2006年 苏旭 段卫平 孔梅 李晓燕 曾强 雷玥 陈锦英关键词:流感病毒分离 冷藏室 标本 咽拭 保存温度 麻疹实验室确诊病例原发性和继发性免疫失败的回顾性研究 被引量:3 2021年 目的探讨麻疹实验室确诊病例含麻疹成分疫苗(Measles containing vaccine MCV)原发性免疫失败(Primary vaccine failure,PVF)和继发性免疫失败(Secondary vaccine failure SVF)。方法收集天津市2013-2019年麻疹实验室确诊病例的剩余急性期血清标本,采用麻疹IgG抗体亲和力试验和酶联免疫吸附试验分别检测IgG抗体亲和力和IgM/IgG抗体,分析高/低亲和力病例构成、免疫失败比例和IgM/IgG抗体阳性率。结果共纳入麻疹实验室确诊病例367例,其中麻疹IgG抗体高、低亲和力病例分别占65.39%、23.71%;高亲和力病例比例从<1岁病例的26.32%升高至30-34岁的77.01%和≥40岁的63.41%(趋势χ^(2)=12.79,P<0.001)。在91例有MCV免疫史病例中,高、低亲和力病例(SVF、PVF病例)分别占75.82%、15.38%;在1剂次、≥2剂次MCV免疫史病例中高亲和力病例比例分别为74.24%、80.00%(χ^(2)=0.33,P=0.567),低亲和力病例比例分别为19.70%、4.00%(χ^(2)=4.24,P=0.039)。高、低亲和力病例的IgM阳性率分别为58.85%、90.24%(χ^(2)=26.54,P<0.001),IgG阳性率分别为98.09%、63.41%(χ^(2)=68.61,P<0.001)。结论SVF是MCV接种后麻疹发病的主要原因;≥30岁人群SVF风险较高,推荐增加1剂次MCV补充免疫。 丁亚兴 毛乃颖 雷玥 曲江文 郭玉婷 刘莹关键词:麻疹 2019年天津市急性胃肠炎人群诺如病毒基因分型分析 被引量:12 2020年 目的分析2019年天津市急性胃肠炎人群中诺如病毒的基因特征。方法本研究采集2019年全年天津市各区疾病预防控制中心送检的散发、暴发、聚集性腹泻诺如病毒阳性粪便标本,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法将标本进行扩增,对阳性产物进行聚合酶区和衣壳区序列测定,构建系统进化树。结果诺如病毒总体阳性率为6.01%(97/1615),除1月无样本检测外,其他各月份均有诺如病毒的检出。其中GⅠ组检出率1.11%(18/1615),GⅡ组检出率5.02%(81/1615)。聚合酶区和衣壳区基因分型结果:2019年的基因型别为GⅡ.2[P16]、GⅡ.4[P31]、GⅡ.17[P17]、GⅠ.3[P13]、GⅡ.6[P7]、GⅠ.5[P4]、GⅡ.3[P12]、GⅠ.5[P12]、GⅠ.1[P1]、GⅠ.2[P2]等。13起急性胃肠炎暴发或聚集性腹泻病例中占比前3位的基因重组株为GⅡ.2[P16](30.77%,4/13)、GⅡ.4[P31](23.08%,3/13)、GⅡ.17[P17](23.08%,3/13)。结论天津市诺如病毒感染的基因型呈多样性,不同基因型持续共同进化和循环,需进一步加强诺如病毒病原监测及分子分型鉴定工作。 雷玥 庄志超 田宏 李晓燕关键词:诺如病毒 基因型 腹泻 急性胃肠炎 2020年天津市宁河区急性胃肠炎聚集疫情病原体轮状病毒全基因组序列分析 被引量:5 2021年 目的分析2020年天津市宁河区一起急性胃肠炎聚集疫情的病原A组轮状病毒(RVA)的全基因组序列,调查原因及防控措施。方法对送检轮状病毒阳性粪便标本核酸进行提取,经real-time PCR进一步确证;构建DNA测序文库,采用二代测序法进行测序,合格序列拼接为11条基因片段。对轮状病毒重要VP7、VP4和NSP4等序列进行系统进化和重要抗原表位变异分析。结果经确认4份样本为RVA阳性,二代测序成功获得4株轮状病毒全基因序列。4株RVA相似性为99%以上,所获毒株均为Wa-like基因组群,G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1。亲缘关系树分析所有毒株的VP7基因属于G9-Ⅵ,VP4基因属于P[8]-3亚型。基因序列进一步揭示了VP7和VP4抗原表位存在氨基酸位点替代现象。并且在非结构蛋白NSP4基因的Ⅰ型和Ⅱ型抗原表位上存在氨基酸位点的改变。其余结构蛋白和非结构蛋白均相对保守。结论G9-Ⅵ亚型、P[8]-3亚型RVA是本次疫情的病原体,本次所获得的4株轮状病毒与现流行毒株变异较小,但应加强轮状病毒全基因组的进化监测,为掌握其流行趋势的变化和开展有效的疫情防控提供科学数据。 雷玥 庄志超 田宏 董兴华 李晓燕关键词:轮状病毒 全基因组 天津市新型冠状病毒肺炎确诊病例病原学检测结果及影响因素分析 被引量:5 2020年 目的研究天津市新型冠状病毒肺炎确诊病例实验室检测结果特征及影响因素。方法按照标准操作流程完成患者样本采集,使用天隆自动磁珠核酸提取试剂完成核酸提取,使用4种已获得审批的新型冠状病毒核酸检测试剂盒进行实时荧光RT-PCR核酸检测,收集患者相关流行病学资料,使用SPSS25.0软件完成单因素方差分析和非参数检验进行组间差异性分析。结果共完成123例新型冠状病毒肺炎确诊病例的核酸检测,PCR检测次数共162次,11次单靶标阳性结果中有10次为核衣壳蛋白基因(nucleocapsid protein gene,N gene)单靶标阳性;同时使用2种试剂盒对19例确诊病例进行检测,结果显示不同试剂盒检测效果存在差异;采集多种样本类型对13例患者进行检测,痰样本Ct值普遍低于咽拭子样本。不同临床症状分型患者咽拭子Ct值之间差异无统计学意义(PCt-N=0.797;PCt-ORF1a/b=0.551)。根据发病日期与首次检测病毒核酸阳性日期之间的间隔时间分组,不同分组咽拭子Ct值之间差异无统计学意义(PCt-N=0.373;PCt-ORF1a/b=0.058)。结论痰液样本相比上呼吸道样本病毒核酸检测更易检出。N基因检测灵敏度更高,N基因单靶标阳性结果应重新采样检测。应根据实际需求选择合适的检测试剂盒,多时间点、多样本类型、多部位采集样本开展检测。 李晓燕 高鑫 郭丽茹 吕莉琨 雷玥 董晓春 孔梅 邹明 李闻 苏旭关键词:新型冠状病毒 RT-PCR 2020年我国风疹流行病学和病毒基因特征分析 被引量:14 2021年 为了解2020年我国风疹流行病学特征以及流行风疹病毒(Rubella virus,RV)的基因特征,本研究收集整理全国麻疹/风疹监测信息报告管理系统中2020年中国风疹发病数据,分析其流行病学特征;同时,依托全国麻疹/风疹实验室网络获得RV分离株,经鉴定后扩增并测定阳性RV分离株的靶基因序列——E1基因的739个核苷酸片段,并与WHO推荐的基因型参考株序列以及已发表的基因亚型参考株序列进行比对确定基因型和亚型,同时与我国2000-2019年间流行的RV进行亲缘性关系分析。结果显示,2020年中国风疹报告发病率为0.18/10万,继2018-2019年风疹的复发和暴发后出现大幅下降,发病人群年龄组主要为10-29岁无免疫史的青少年和成人;2020年我国RV流行的主要基因亚型为1E-L2与2B-L2c,为2018-2019年间检测到的境外输入性病毒。因此,在实施有效的风疹疫苗免疫后,我国本土流行的病毒逐渐被阻断,然而由于我国风疹易感人群的累积和输入性病毒的持续传播导致了我国近些年风疹疫情的回升。鉴于此,我国应根据现状制定更加切实有效的风疹疫苗免疫策略,消除青少年和成年人中的易感人群;同时应进一步加强风疹流行病学和病毒学监测,从而科学地阻断输入病毒的传播。 刘莹 崔爱利 郭晋源 邓丽丽 范丽霞 魏欢 刘李 丛艳丽 唐小敏 雷玥 周淑洁 彭晓放 周珺 冯燕 张燕 毛乃颖 许文波 朱贞关键词:风疹 流行病学 基因特征 奥密克戎BA.1感染后成人细胞免疫和体液免疫指标定期动态观察分析 2023年 目的分析感染奥密克戎变异毒株BA.1后患者的免疫学特征和抗体变化规律,以评估二次感染的可能性。方法纳入2022年1月8日至2月2日天津市津南区感染BA.1的患者104例,对照组与病例组按照年龄、性别和接种疫苗情况1∶1匹配。采集病例组患者感染后第3、6和9个月血清,同期采集对照组的血清。从细胞免疫和体液免疫两方面进行分析,采用ELISA法检测患者血清白细胞介素4(IL-4)、IL-5及γ干扰素浓度(IFN-γ)以及IgG、IgG1和IgG2的阳性率。结果BA.1感染后6个月病例组患者IFN-γ浓度最高为145.4 pg/ml,随后浓度降低;IL-4与IL-5浓度在感染后6个月开始降低(均P<0.001),在BA.1感染后6个月病例组IgG2阳性率与同期对照组无差异,而第9个月时较对照组下降明显(P=0.003);BA.1感染后3个月IFN-γ/IL4的比值病例组低于对照组(P<0.001),至感染9个月后病例组与对照组无明显差异。结论感染BA.1第3个月患者细胞免疫功能处于受损状态,6个月后机体特异性细胞免疫和体液免疫功能明显下降,二次感染风险上升。 高梦雪 雷玥 郭丽茹 曲江文 王鹤霏 刘晓曼 李蕊 孔梅 庄志超 谭昭麟 李晓燕 李晓燕关键词:抗体检测 疫苗接种 病例对照研究 天津地区风疹病毒的分子特征分析 被引量:4 2010年 目的:了解2009年天津地区风疹病毒(rubella virus,RV)的分子特征。方法:采用Vero/SLAM细胞培养法分离出10株风疹病毒,用RT-PCR方法扩增10株风疹病毒E1基因编码的1170个核苷酸,并对该PCR产物进行序列测定和分析。分离株与WHO各基因型参考株基于E1基因编码的739个核苷酸构建基因亲缘性关系树。结果:10株风疹病毒与1E基因型代表株处于同一分支,属于1E基因型。核苷酸同源性为97.3%~100%,重要抗原位点未发生变异。血凝抑制和中和位点中,只有Tianjin09-06株在E1蛋白第234位氨基酸发生了变化(Trp234→Ser234)。同时所有天津分离的风疹毒株在E1蛋白的第338位氨基酸发生相同突变(Leu338→Phe338),该氨基酸(Phe338)可能是我国1E基因型风疹病毒所特有。结论:天津地区流行的风疹病毒为E1基因型,在基因亲缘性关系树中形成紧密相连的3簇,处于不同的进化链中,显示天津地区存在不同风疹病毒株的传播链。 雷玥 田宏 刘杨 丁亚兴 朱贞 许文波 朱泽关键词:风疹病毒 逆转录 聚合酶链反应 核苷酸类 基因型