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一种对高通量RNA测序数据的质量控制方法及装置: 本发明属于高通量RNA测序技术领域，公开了一种通过加入外源参照物对高通量RNA测序数据进行质量评估和质量控制的方法，其包括：系统评估外源参照序列在测定样品中的比例、定量水平、基因覆盖度及测序错误率等特征，以及评估批次效应...; 郁颖庆涛赵琛杜婷婷郑媛婷石乐明; 文献传递

战后芬兰的工业结构: 该文以芬兰工业结构的变化为主线,以迈可尔·波特的国家竞争优势理论为基础,分析了芬兰工业国际竞争优势和其对国民经济发展的影响和意义,并结合芬兰的新工业政策来进一步预测工业发展的未来趋势.该文根据芬兰各个工业部分的不同发展程...; 赵琛; 关键词：竞争优势; 文献传递

一种基于高通量测序数据的计算机集群的作业调度系统: 本发明属计算机领域，涉及一种基于高通量测序数据的计算机集群的作业调度系统。具体涉及针对高通量组学数据的数据密集性计算的集群作业调度系统。本发明中包括：搭建独立的消息与储存网络构架；指定分析软件与输入数据；通过文件系统自动...; 赵琛郁颖庆涛石乐明; 文献传递

非小细胞肺癌中PTCH1-3’-UTR调控的lncRNAs的ceRNA网络（英文）被引量：1: 2018年; 目的研究PTCH1-3’-UTR对lnc RNAs表达水平的影响,通过调控网络的分析,提示PTCH1-3’-UTR的功能。方法通过芯片筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs,并对部分结果进行荧光定量PCR验证。通过GO和KEGG通路分析调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs可能的生物学功能。通过TCGA数据分析调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs与NSCLC患者生存率的直接关系。结果荧光定量PCR验证了PTCH1-3’-UTR上调表达的lnc RNAs(LOC100507547,FAM41C,DOCK4-AS1,AC009305.1,KLF7-IT1,RP11-749H20.1,LINC01511)。GO和KEGG通路分析结果显示,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs与一系列的生物过程,包括基因转录、信号转导、蛋白质转运、翻译延伸以及钙信号通路、Jak-STAT信号通路、p53信号通路、胰岛素信号通路有关。TCGA数据分析的结果表明,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs中,NSCLC患者中高表达lnc RNA-CDKN2BAS或FAM66D者预后较差,而高表达lnc RNA-LINC00240、LOC400027、ABCC6P2或FLJ10038者可能预示高存活率。结论本研究结果提示了PTCH1-3’-UTR的功能,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNA可作为NSCLC预后标志物。; 赵琛万学超伊传友秦睿孔哲黄燕; 关键词：长链非编码RNA 表达谱非小细胞肺癌

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赵琛