许世磊
- 作品数：15 被引量：44H指数：4
- 供职机构：天津市肿瘤防治重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 人转录因子AP4的生物信息学分析被引量：3
- 2016年
- [目的]预测分析人转录因子激活增强子结合蛋白4(activating enhancer binding protein 4,AP4)的性质、结构和功能。[方法]采用生物信息学方法对人AP4蛋白的理化性质、物种间同源性、信号肽与跨膜区、亲水性、蛋白亚细胞定位、蛋白质二/三级结构、三级结构可靠性、蛋白质相互作用等方面进行预测和分析。[结果]人AP4蛋白全长338个氨基酸,理论等电点5.63,相对分子质量38.73 kDa。AP4在进化上较为保守,不含信号肽与跨膜区,属于亲水性蛋白质,94.1%可信度定位于细胞核。二级结构含10个α螺旋区,占全部氨基酸的54.14%,5个β折叠区,占7.99%,其余37.87%的氨基酸处于无规卷曲状态。三维建模结果可靠。预测到10个与AP4存在相互作用的蛋白。[结论]系统预测分析了人AP4蛋白的性质、结构和功能。
- 赵文铖王兆松周蒙魏梅许世磊
- 关键词：蛋白生物信息学
- 人STC2蛋白的生物学分析被引量：5
- 2018年
- 运用生物信息学方法预测分析不同物种问STC2蛋白的理化性质、同源性以及人STC2蛋白亲水性、核定位序列，跨膜区域、信号肽结构、亚细胞定位，二级结构、三级结构、互作蛋白、GO注释分析。STC2蛋白由302个氨基酸组成，理论等电点为6．93，具有较强亲水性，在哺乳动物中较为保守，不存在核定位序列和跨膜结构，含有信号肽，主要集中在细胞内质网或分泌到胞外；STC2蛋白二级结构预测有11个α螺旋区和1个β折叠区，拉曼图表明三级预测结构可靠，互作蛋白及GO注释提示STC2可参与多种细胞生物学过程。通过对人STC2蛋白结构和功能的预测分析，为STC2蛋白的进一步研究提供一定的理论依据，也为STC2相关疾病的诊治提供新的思路。
- 李伟李伟董秋萍周蒙王星宇董秋萍许世磊
- 关键词：糖蛋白肿瘤生物信息学
- 晚期非小细胞肺癌的内科一线及维持治疗被引量：12
- 2016年
- 目前,肺癌已成为全球癌症死亡的主要原因之一,每年约有超过100万的人口死于该病[1]。流行病学调查结果表明,非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）占所有肺癌的85%以上,而大部分患者在诊断时已是晚期,总体预后差。针对晚期NSCLC的内科治疗一直是全球研究的热点,也是难点。近年来,
- 董秋萍蒋湘俐张连民孙博许世磊
- 关键词：晚期非小细胞肺癌一线治疗
- 人细胞角蛋白Keratin 14的生物信息学分析被引量：2
- 2017年
- 人细胞角蛋白Keratin 14是I型中间丝蛋白家族的亚群,参与形成上皮细胞的细胞骨架。利用生物信息学分析Keratin 14基因的启动子区、CpG岛及其所编码的蛋白质的理化性质、结构特点和功能特征。结果表明,Keratin 14基因存在两个启动子区,启动子区不存在CpG岛;Keratin 14全长472个氨基酸,其等电点为5.09,是一个无跨膜结构的亲水性蛋白质;角蛋白Keratin 14二级结构具7个α螺旋和5个β折叠,预测三级结构的拉曼图分析显示其结构稳定;与Keratin 14相互作用的蛋白质主要是角蛋白,而且Keratin 14还参与细胞的生长和分裂,有促进细胞分化的作用;此外,Keratin 14的氨基酸序列在哺乳动物间的同源性较高。上述对角蛋白Keratin 14的表达、结构和功能的预测可以为研究其在生命过程中的作用提供重要的信息。
- 周蒙董秋萍张连民李伟付欣许世磊
- 关键词：上皮细胞细胞骨架生物信息学
- 人P2Y_2蛋白的生物信息分析
- 2016年
- [目的]利用生物信息学对人P2Y_2蛋白质的理化性质、物种的同源性、亲水性/疏水性、跨膜区域、蛋白质二级结构和三级结构、蛋白质间的相互作用、GO注释进行预测分析。[方法]使用多种分析软件对P2Y_2蛋白进行在线预测分析。[结果]人P2Y_2蛋白有377个氨基酸,等电点为9.72,哺乳动物中保守性较高;二级结构存在8个α螺旋和2个β折叠,三级结构预测结果的可靠性为39.42%,拉曼图分析表明预测结果较稳定,P2Y_2蛋白分布范围广,在神经元、神经胶质、内皮细胞和肿瘤的信号通路中有重要作用。[结论]P2Y_2蛋白存在2种核定位序列的不稳定疏水蛋白,有6个跨膜区且分布广泛,参与细胞衰老、伤口愈合等多种生理过程。
- 魏梅王星宇徐玥许世磊
- 关键词：G蛋白偶联受体信号通路生物信息学
- 人P2X1蛋白生物信息预测
- 2017年
- 利用生物信息学方法对配体门控离子通道受体人P2X_1蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、亲疏水性、二级结构及三级结构、蛋白质间的相互作用、GO注释等进行预测分析。结果显示:P2X_1蛋白是两次跨膜的亲水蛋白质,由399个氨基酸组成,等电点为8.75,有一段核定位序列;二级结构存在6个α螺旋区和15个β折叠区,三级结构预测结果的可靠性为45.35%,拉曼图分析表明预测结构较稳定;与P2X_1相互作用的蛋白质主要是传导信号的嘌呤受体和离子通道蛋白质,而且P2X_1蛋白可能参与血管凝集及炎症反应等生理过程。上述对人P2X_1蛋白结构及功能的预测为研究人P2X_1蛋白在生物过程及疾病治疗方面的作用提供了重要的理论依据。
- 魏梅张连民周蒙李伟董秋萍许世磊
- 关键词：炎症反应生物信息学
- 细胞培养液pH对慢病毒包装及感染效率的影响
- 2015年
- 为解决实验室中包装慢病毒转染效率低、感染效率低的问题,从培养液p H角度对病毒包装及感染进行优化。首先构建慢病毒载体cop GFP质粒,采用磷酸钙法和Lipofectamine2000法,转染不同p H培养液培养的293T细胞。在荧光显微镜下比较转染效率,发现磷酸钙法p H（6.5～7.5）转染效率高,培养液p H（6～8）对Lipofectamine2000法转染几乎无影响。使用标准p H（7.2～7.4）培养液包装慢病毒,收取病毒上清液后调节至不同p H,加或不加Polybrene感染293T细胞,发现p H在8～9附近感染效率高,调节慢病毒p H至弱碱性与Polybrene同时使用有助于提高感染效率。
- 潘利杨少斌姜成文许世磊胡明秋
- 关键词：慢病毒转染
- 转录因子AP4研究进展被引量：4
- 2016年
- 激活增强子结合蛋白4(activating enhancer binding protein 4,AP4)是近年来发现的一个重要转录因子。AP4是c-MYC的重要下游因子,广泛调控细胞增殖与分化、细胞周期、细胞凋亡、免疫应答等进程。AP4可促进正常细胞恶性转化,独立地诱导肿瘤细胞发生上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT),增强肿瘤细胞的迁移侵袭能力,促进肿瘤转移,在临床上与多种肿瘤密切相关。本文综述了AP4的分子特征与作用机制,并介绍了AP4的调控网络和在肿瘤发生发展中的研究进展。对AP4的深入研究将有助于了解生命活动的基本原理,并为肿瘤诊治提供新的思路和方法。
- 赵文铖王兆松许世磊
- 关键词：C-MYC上皮间充质转化肿瘤
- 人TEAD1蛋白质的生物信息学分析被引量：3
- 2016年
- [目的]采用生物信息学方法对人TEAD1蛋白质的理化性质、跨膜区域、亲疏水性、信号肽区域、二级结构、三级结构、蛋白质之间的相互作用、GO注释进行预测分析。[方法]使用多种分析软件对TEAD1蛋白质进行预测分析。[结果]TEAD1蛋白质由426个氨基酸组成,等电点为8.33,在哺乳动物中高度保守;二级结构预测发现6个α螺旋和10个β折叠片层,三级结构预测结果的可靠性为100%,拉曼图分析表明预测结构稳定;与TEAD1相互作用的蛋白质主要是核内转录调控蛋白质,并可参与Hippo信号通路。[结论]TEAD1一种存在核定位序列、无跨膜结构的亲水不稳定蛋白质,具有转录调控因子的作用,可通过Hippo信号通路,表现出促癌作用。
- 王兆松赵文铖张连民周蒙魏梅董秋萍许世磊
- 关键词：转录调控因子生物信息学
- 斑马鱼TATA结合蛋白的生物信息学分析被引量：6
- 2015年
- 斑马鱼TATA结合蛋白(TBP)是转录过程中的重要起始因子。利用生物信息学方法对斑马鱼TBP的理化性质、物种间同源性、保守结构域、跨膜区、亲水性/疏水性、蛋白质二级结构、蛋白质三级结构、蛋白质相互作用进行预测分析。分析表明,斑马鱼TBP全长302个氨基酸,等电点9.8,属于TATA结合蛋白超家族,不含跨膜区,属于亲水蛋白;二级结构以无规则卷曲为主,含5个α螺旋区和8个β折叠区,三维建模空间结构可信度98.9%,进一步分析建模结果可靠;与斑马鱼TBP相互作用的蛋白质均为转录因子或TFⅡD复合物组分。分析结果对于深入研究斑马鱼TBP在基因转录中的作用具有一定的理论指导意义。
- 杨少斌冯婧文赵文铖王兆松许世磊
- 关键词：斑马鱼生物信息学
