范昕琦
- 作品数:12 被引量:16H指数:3
- 供职机构:江苏省农业科学院更多>>
- 发文基金:江苏省农业科技自主创新基金国家科技重大专项转基因生物新品种培育专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 一种棉花纤维长度单QTL近等基因系的创建方法
- 本发明涉及一种棉花纤维长度单QTL近等基因系的创建方法。该方法是利用含有海岛棉(G.barbadense)Pima S-61号染色体上纤维长度QTL的渐渗系与轮回亲本Tamcot2111构建F2群体,构建目标QTL区间的...
- 徐鹏高进沈新莲张香桂范昕琦
- 棉属野生种旱地棉苏氨酸醛缩酶基因GarTHA的克隆及功能验证被引量:2
- 2013年
- 盐胁迫是影响作物生长和发育的重要因素之一。一些棉属野生种具有较好的耐盐性,是开展棉花耐盐性机制研究以及改良陆地棉耐盐性的重要资源。本研究基于cDNA-AFLP技术分离获得的旱地棉(Gossypium aridum)盐胁迫下差异表达片段序列信息,经电子克隆技术和RT-PCR方法克隆了旱地棉苏氨酸醛缩酶基因cDNA全长,命名为GarTHA(GenBank登录号为KC167360)。该cDNA全长为1018 bp,包含一个822 bp的完整ORF,编码273个氨基酸残基,蛋白质分子量为82.57 kD,等电点为4.89。GarTHA基因与杨树PtTHA基因同源性最高,为84.6%。为进一步验证其功能,利用拟南芥逆境胁迫启动子rd29A构建植物表达载体,将GarTHA基因的完整ORF转入拟南芥中,获得转基因植株并进行了耐盐性鉴定。结果表明,在盐胁迫下转基因拟南芥种子的发芽率明显高于野生型,且转基因植株的根长显著高于野生型。说明GarTHA基因可能参与植物的盐胁迫反应,从而提高植物抗逆性。
- 范昕琦刘章伟冯娟徐鹏张香桂沈新莲
- 关键词:旱地棉耐盐性结构特征功能分析
- 盐胁迫下旱地棉叶片数字化基因表达谱分析
- 2016年
- 为了深入研究棉花耐盐的分子机理,利用数字化基因表达谱技术,分析了盐胁迫处理3 h和72 h时旱地棉叶片中基因表达差异,分别获得1 778(1 046个上调、732个下调)和2 873(2 065个上调、808个下调)个差异表达基因。功能注释分析结果表明,这些差异表达基因主要参与了信号转导、逆境应答、能量代谢和转录调节等方面。随机挑选10个差异表达基因进行qRT-PCR验证,结果表明,qRT-PCR结果与数字化基因表达谱分析结果基本一致。
- 翟彩娇徐鹏范昕琦郭琪张香桂徐珍珍沈新莲
- 关键词:旱地棉盐胁迫
- 一种调控植物耐盐性的棉花WRKY转录因子GarWRKY22及应用
- 本发明公开了一种棉花耐盐相关转录因子,即棉属野生种旱地棉WRKY基因GarWRKY22,具有序列表中SEQ ID N0.2的序列。本发明利用电子克隆及RT‑PCR技术分离了一个棉花耐逆性相关蛋白GarWRKY22,通过转...
- 沈新莲范昕琦徐鹏郭琪张香桂
- 文献传递
- 棉属野生种旱地棉蛋白激酶基因GarCIPK8的克隆与功能分析被引量:5
- 2013年
- CIPK(calcineurin B-like calcium sensor interacting protein kinase)是植物钙感受器钙调磷酸酶B类似蛋白特定靶向的一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。在前期的研究中,我们将棉属野生种D亚组旱地棉(Gossypium aridum)盐胁迫前后RNA混合样品进行转录组测序,发现一CIPK相关基因存在较高的转录丰度。盐胁迫下荧光定量PCR分析表明该基因在根部表现诱导上调表达,推测该基因可能参与植物在高盐胁迫下的生理调控。利用电子克隆及RT-PCR方法从旱地棉中克隆了一个ORF全长为1350bp的蛋白激酶基因GarCIPK8。序列分析表明该基因编码的蛋白含有449个氨基酸,分子量为51.12kD,理论等电点为8.13,其N端催化结构域包含一个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶域,C端具有植物CIPK蛋白家族特有的24个氨基酸组成的NAF保守结构域;与水稻OsCIPK8蛋白的相似度为73.95%。为进一步验证其功能,利用组成型高效强启动子CaMV35S和拟南芥逆境胁迫启动子rd29A构建植物表达载体并转化烟草,经PCR和RT-PCR分子检测,证明GarCIPK8基因已经整合到烟草基因组中,并正常表达。T1代转基因植株耐盐性鉴定结果表明GarCIPK8基因对提高转基因植株的耐盐性有较明显的作用,PEG干旱模拟试验也证明GarCIPK8基因可增强植株的抗旱性。
- 冯娟范昕琦徐鹏张香桂沈新莲
- 关键词:旱地棉耐盐性耐旱性
- 盐胁迫下棉属野生种旱地棉(Gossypium aridum)差异表达基因的cDNA-AFLP分析(英文)被引量:6
- 2012年
- 以一个耐盐的二倍体野生种旱地棉和对盐敏感的陆地棉栽培种苏棉12号为材料,运用cDNA—AFLP技术,比较两个材料分别在盐胁迫前后的表达情况,获得了25个仅在旱地棉盐胁迫下特异表达的转录片段(TDF)。将这些片段进行电子克隆,延伸后的序列进行BLAST分析,结果显示23个转录片段推断的氨基酸序列与已知的蛋白同源,这些盐诱导表达的基因主要涉及离子转运、活性氧清除、细胞信号传导、细胞分裂、转录调节、膜保护、渗透调节等功能蛋白。从23个差异表达的转录片段中选择9个进行实时定量PCR(qRT—PCR)分析,结果表明这些基因在盐胁迫后表达显著增强,而且多数在12~24h达到高峰。这些cDNA克隆是开展棉花耐盐性分子基础研究的重要资源。
- 刘章伟冯娟范昕琦徐鹏张香桂沈新莲
- 关键词:棉属盐胁迫
- 一种棉花纤维长度单QTL近等基因系的创建方法
- 本发明涉及一种棉花纤维长度单QTL近等基因系的创建方法。该方法是利用含有海岛棉(G.barbadense)Pima S-61号染色体上纤维长度QTL的渐渗系与轮回亲本Tamcot2111构建F2群体,构建目标QTL区间的...
- 徐鹏高进沈新莲张香桂范昕琦
- 文献传递
- 受盐胁迫诱导表达的旱地棉GarMSL基因结构与表达特征被引量:3
- 2013年
- 棉属野生旱地棉种具有很好的耐盐性,是开展棉花耐盐性机制研究以及改良陆地棉耐盐性的重要资源。基于cDNAAFLP技术分离获得了旱地棉盐胁迫下的差异表达片段序列信息,利用电子克隆方法并在基因组和转录水平上进行全长基因验证,克隆获得1个编码旱地棉类机械敏感离子通道蛋白的基因,命名为GarMSL(GenBank登录号:KC167359)。该基因ORF长为2 124 bp,编码707个氨基酸,含13个外显子和12个内含子。生物信息学分析显示,该蛋白包含ABC转运体功能域、阳离子外排功能域及机械敏感离子通道功能域等多种蛋白功能域。拷贝数分析推测,该基因在二倍体棉种基因组中含1个拷贝,在四倍体棉种基因组中含2个拷贝。qRT-PCR分析显示,该基因在旱地棉不同盐处理时期的叶片和根中均上调表达,在诱导24 h后表达水平达到高峰。
- 郭琪刘章伟范昕琦徐鹏张香桂倪万潮沈新莲
- 关键词:结构特征盐胁迫旱地棉
- SbHKT基因在调节植物抗逆性中的应用和培育抗逆性植物的方法及其应用
- 本发明提供了SbHKT基因在调节植物抗逆性中的应用和培育抗逆性植物的方法及其应用,涉及植物生物工程技术领域,该SbHKT基因在调节植物抗逆性中的应用,包括含有SbHKT基因的重组载体、表达盒、细胞或者重组菌,能够有效的调...
- 沈新莲郭琪范昕琦徐鹏高媛媛张香桂徐珍珍陶淑翠
- 文献传递
- 一种调控植物开花的棉花WRKY转录因子GarWRKY9及应用
- 本发明公开了一种棉花开花相关转录因子,即棉属野生种旱地棉WRKY基因GarWRKY9,具有序列表中SEQ ID N0.2的序列。本发明利用电子克隆及RT-PCR技术分离了一个棉花开花相关蛋白GarWRKY9,通过转化拟南...
- 郭琪沈新莲范昕琦徐鹏张香桂
- 文献传递