童彩环
- 作品数:4 被引量:4H指数:1
- 供职机构:宁波大学生命科学与生物工程学院教育部应用海洋生物技术重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金浙江省科技厅创新团队建设与人才培养项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 鲈3种视黄醇类X受体基因cDNA的克隆和组织表达被引量:3
- 2011年
- 视黄醇类X受体(retinoid X receptor,RXR)属于配体激活的核受体家族,在调节细胞内各种信号途径中起重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,分离到鲈RXR基因3种亚型RXRα、RXRβ和RXRγ的cDNA序列。结果表明,得到的RXRα是长度为1 686 bp 3'末端不完整的cDNA序列,其中包括364 bp的5'非翻译区和1 322 bp的编码序列,可编码440个氨基酸。RXRβcDNA全长为1 741 bp,其中包括150 bp的5'非翻译区,256 bp的3'非翻译区和1 335 bp的开放阅读框,共编码444个氨基酸,理论分子量为49.5 ku。RXRγcDNA全长为1 847 bp,其中5'非翻译区为88 bp,3'非翻译区为397 bp,开放阅读框为1 362 bp,共编码453个氨基酸,分子量约为49.9 ku。氨基酸序列分析显示,鲈RXRα、RXRβ和RXRγ和其它物种的RXRs结构类似,在DNA结合区有P box和D box结构,配体结合区包括12个α螺旋和2个β折叠结构,H12的C端含有AF-2的激活区。系统进化树分析表明,鲈RXRα、RXRβ和RXRγ分别与其他动物的相应亚型聚类。组织分布特异性研究表明,鲈RXRα在肌肉、心脏、眼、大脑、肠、肾脏、脂肪、脾脏、鳃和肝脏10种组织中均有表达,但表达量较低;RXRβ在这10组织中都有较高表达,但心脏中表达量较低;在所检测的10种组织中,RXRγ都有表达,在肌肉、肠、肾脏、脂肪和脾脏表达量较高。
- 童彩环钱云霞郑伟贤
- 关键词:克隆
- 鲈鱼RXRs和RARs基因全长cDNA的克隆和组织表达
- 维生素A(视黄醇类)在鱼类的多种生物过程中起重要作用。维生素A在体内的代谢产物主要是视黄酸,即由视黄醇类氧化成视黄醛,视黄醛再氧化成视黄酸。维生素A的多种生物学功能都是通过视黄酸信号途径实现的,视黄酸作为配体只有运输到细...
- 童彩环
- 关键词:鲈鱼
- 文献传递
- 鲈鱼视黄酸受体α和视黄酸受体γ cDNA克隆和基因表达分析被引量:1
- 2012年
- 本文旨在研究鲈鱼视黄酸受体α(RARα)和视黄酸受体γ(RARγ)的结构及其基因的组织表达特点。采用反转录PCR和cDNA末端快速克隆(RACE)技术,从鲈鱼肝脏中克隆得到RARα和RARγ全长cDNA序列。检测鲈鱼肝脏、肌肉、心脏、眼、肠、肾脏、脂肪、脾脏、鳃和大脑10个组织中RARα和RARγ基因的表达情况。结果表明:1)鲈鱼RARαcDNA全长2 094 bp,5'端和3'端的非翻译区分别为124和608 bp,开放阅读框为1 362 bp,推测编码453个氨基酸,分子质量为50.64 ku,理论等电点为8.20。2)RARγcDNA全长1 671 bp,其中包括36 bp的5'端非翻译区、129 bp的3'端的非翻译区和1 506 bp的开放阅读框,共编码501个氨基酸,分子质量为56.20 ku,理论等电点为4.96。3)鲈鱼RARα和RARγ都具有典型的核受体结构,两者氨基酸序列同源性高达63.1%。鲈鱼的RARα和RARγ与红鳍东方鲀有较高的同源性,分别为96.9%和95.2%。4)RARα和RARγ基因在所有检测组织中均有表达,其中RARα基因在心脏和大脑中表达较少,在眼、鳃和肠中表达较高,而RARγ基因仅在鳃和脾脏中有较高表达。总之,本试验成功克隆了鲈鱼RARα和RARγ的全长cDNA;鲈鱼RARα和RARγ有着典型的核受体结构,在各组织中广泛分布。
- 钱云霞韩柳童彩环郑伟贤
- 关键词:维生素A视黄酸受体克隆鲈鱼
- 鲈鱼FBP基因的克隆和表达分析
- 2012年
- 果糖-1,6-二磷酸酶(fructose-1,6-bisphosphatase,FBP,EC 3.1.3.11)可催化果糖-1,6-二磷酸水解成果糖-6-磷酸和无机磷酸盐,是糖异生途径中的关键酶之一。本研究运用SMART RACE技术从鲈鱼Lateolabrax japonicus肝脏中分离克隆了FBP基因的全长cDNA序列,该基因全长1 357bp,其中5’非翻译区和3’非翻译区分别为42bp和301bp,开放阅读框为1 014bp,共编码337个氨基酸。蛋白质分子量约为36.7kD,理论pI为6.90。氨基酸序列分析表明,鲈鱼FBP与其它动物的肝脏型FBP相似性很高,与裸盖鱼、彩虹胡瓜鱼、斑马鱼、异育银鲫和大西洋鲑的肝脏型FBP的同源性分别为94.3%,90.8%,89.3%,88.1%和84.1%。系统发育分析显示,鲈鱼FBP与其它鱼类的肝脏型FBP成簇后再与哺乳动物的肝脏型FBP聚成一支,然后才与哺乳动物的肌肉型FBP汇成簇。同时用RT-PCR分析了FBP基因在鲈鱼肝脏、肌肉、心脏、眼、肠、肾脏、脂肪、脾脏、鳃和大脑等10个组织的表达,结果表明FBP仅在肝脏、肾脏和肠这3个组织中有较高的表达,与糖异生发生组织基本一致,因此推测该FBP属于肝脏型。
- 童彩环钱云霞郑伟贤韩柳
- 关键词:鲈鱼克隆