目的基于放射性核素标记相对与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)探究化疗相关认知障碍(chemotherapy-induced cognitive impairment,CICI)的发生机制。方法雄性SD大鼠6只,随机分为对照组和化疗组,化疗组大鼠静脉注射环磷酰胺和阿霉素,每周1次,共3周;对照组大鼠给予等剂量的0.9%NaCl注射液。通过iTRAQ技术探究两组间的差异蛋白,根据GO和KEGG数据库分析对差异蛋白的生物功能及相关信号通路进行富集。结果蛋白质组学共鉴定出52764条肽段和7670个蛋白,化疗组与对照组的差异蛋白为434种,其中显著下调蛋白338种,显著上调蛋白96种。结果显示差异蛋白主要富集于细胞器、细胞膜等细胞成分;主要参与细胞代谢、生物调节及代谢等生物学过程;显著富集于结合、催化等分子功能。对差异蛋白进行KEGG信号通路富集分析显示其主要富集于单纯疱疹病毒感染、免疫排斥、自身免疫性甲状腺疾病等与免疫相关的通路。通过构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络发现信号转导及转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)及泛素样修饰剂ISG15处于中心位置,均与免疫相关。结论本研究利用iTRAQ技术CICI的可能机制进行探究,结果进一步说明CICI可能与神经炎症有关,特别是其与自身免疫的相关性值得进一步研究。γ干扰素(interferonγ,IFN-γ)可能是CICI潜在的生物学标志物及治疗靶点。