李艳芬 作品数:34 被引量:154 H指数:6 供职机构: 东莞市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 东莞市科技计划项目 东莞市医疗卫生科技计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
2010-2011年广东省东莞市甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因变异特征研究 被引量:3 2012年 目的了解2010-2011年广东省东莞市甲型H1N1流行性感冒(流感)病毒血凝素(HA)基因的特征及变化。方法反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、基因扩增、测序得到标本HA基因的核酸序列,利用生物信息软件对序列的特征及变化情况进行分析。结果通过测序得到各标本HA基因1701 bp长度的核苷酸序列,566个氨基酸。2年间有24个氨基酸位点发生变异,但其中有12个位点的改变只出现在单个毒株上。发生明显变化趋势的位点只有145、202、391、468,其中202位点属于Sb抗原决定簇区。受体结合位点、潜在糖基化位点及二硫键比较稳定,2年间没有发生变化。结论主要功能区域比较保守,无变化。序列中发生明显变化趋势的位点只有4个,其中1个位于抗原决定簇区,属于流感病毒抗原漂移过程中突变的累积。 黄勇 杨华可 袁达康 黎景全 李艳芬 周建孟 李宇政 陈永迪关键词:流感病毒 血凝素基因 2015年东莞市游泳池水水质卫生监测分析 被引量:4 2019年 目的分析东莞市2015年泳池水卫生质量状况,为进一步做好游泳池水卫生监督工作提供背景资料。方法依据GB/T18204-2013《公共场所卫生检验方法》对276份泳池水进行抽检并对细菌总数、大肠菌群、浑浊度、pH值、游离性余氯、尿素等各项指标进行测定、评价。结果东莞市2015年共抽检游泳池水样276份,各项指标检测合格的有224份,合格率为81.2%,其中公共场所、酒店、住宅小区和学校的合格率分别为80.0%、92.0%、74.8%、100%,各单项检测合格率:pH值、浑浊度、尿素、游离性余氯、菌落总数、大肠菌群分别98.2%、100%、89.9%、88.8%、90.2%、98.9%。结论东莞市游泳池水质卫生状况有待改善,应加强监督检测工作。 方昌勇 张莉萍 黄勇 李艳芬 陈仲威关键词:公共卫生监测 东莞市2004-2008年流感病毒监测结果及分析 目的了解东莞市流感病毒感染流行情况。方法采集门诊疑似流感病人咽拭子分泌物,接种MDCK细胞,于CO2温箱中33.5℃分离培养。培养液血凝试验阳性标本进行分型鉴定。结果2004年412例中有42例分离出流感病毒,分离阳性率... 袁达康 黄勇 杨华可 黎景全 李艳芬关键词:流感病毒 文献传递 2011年东莞市登革热与基孔肯雅热监测结果分析 2012年 目的:尽早发现登革热与基孔肯雅热病例,及时采取有效防控措施。方法:对2011年6月20日-2011年8月31日东莞市应急监测病例及疫情监测病例血清样品,采用荧光PCR检测登革热与基孔肯雅热病毒核酸,登革热核酸检测阴性者,再用ELISA法检测登革热病毒IgM抗体。结果:共收集及检测248份合格血清样品。其中,应急监测病例血清234份,检测结果均为阴性;疫情监测病例血清14份,检出2份为登革热IgM抗体阳性,1份为登革热核酸阳性,为IV型;确诊2例为登革热输入性病例。结论:通过实验室应急监测,发现了登革热病例,及时控制了疫情的传播扩散。 周建孟 袁达康 黄勇 陈平华 杨华可 黎景全 李艳芬 陈永迪 李宇政关键词:登革热 基孔肯雅热 IGM抗体 东莞市2015—2016年柯萨奇病毒A6型流行情况及特征分析 被引量:5 2018年 目的研究东莞市2015—2016年手足口病(HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CVA6)的流行情况及基因特征。方法采用RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行检测,CVA6阳性标本上送广东省疾病预防控制中心,进行病毒分离及鉴定,扩增并测定VP1基因序列。从GenBank中选取其他CVA6代表株进行参考比对,利用DNASTAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega4.0.2软件构建亲缘性进化树。结果在1 145份标本中检出CVA6阳性标本580份,阳性率为50.66%(580/1 145)。序列比对显示,20株CVA6分离株VP1基因之间核苷酸同源性为93.6%~100.0%,氨基酸同源性为97.7%~100.0%。东莞市CVA6分离株VP1与近年来全球各地流行株核苷酸和氨基酸的同源性分别为93.4%~98.5%和97.0%~99.7%,与CVA6原型株Gdula以及我国山东省1996年分离株核苷酸和氨基酸相似性仅为82.5%~85.8%和94.1%~96.4%。系统进化树分析显示,2015—2016年东莞地区CVA6与近年来流行于世界各地的CVA6分离株同源性较高,而与原型株进化距离较远。结论 2015—2016年东莞市HFMD病原以CVA6为主,流行株为近年来流行于全国各地的CVA6新变种。 李艳芬 黄勇 张莉萍 陈永迪 曾汉日关键词:手足口病 进化分析 东莞市2008年麻疹病毒基因型分析 2009年 目的:为了掌握东莞市2008年流行的麻疹病毒的基因型别和核蛋白基因变异情况。方法:采集东莞市2008年麻疹疫情中病人的血清、咽拭子、尿液等标本。对血清IgM抗体检测阳性的标本进行病毒分离,采用VERO-SLAM细胞进行培养,对分离到的病毒株提取核糖核酸(RNA),通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增麻疹病毒N基因序列,对扩增产物进行测序,取病毒株碳末端450bp核苷酸序列进行分析。结果:共分离到11株麻疹病毒株,均属于H1基因型H1 a亚型。11株毒株间的核苷酸同源性为98%~100%,氨基酸同源性为96.7%~100%,11株毒株间,2、4、5、7、8号的序列相同,9、10、11号的序列相同。各毒株与Ch ina93-2毒株同源性最高,为98.7%~99.3%,与Ch ina94-7毒株同源性为96.7%~97.3%,与其它H1亚型的同源性则为97.1%~98.2%。结论:东莞市2008年麻疹病毒流行株均属于H1基因型H1 a亚型,与中国其它地区的流行情况一致。暂无新型及传入性的其它亚型出现。 杨华可 黄勇 袁达康 黎景全 李艳芬关键词:麻疹病毒 基因型 东莞市575份外来员工麻疹IgG抗体水平结果分析 2011年 目的:了解东莞市部分15岁以上外来员工的麻疹IgG抗体水平,为成人麻疹疫苗免疫策略研究与绩效评估提供科学依据。方法:采集东莞市髙埗裕元鞋厂新入厂健康员工血清标本575份,用定量酶联免疫吸附法检测抗体水平。结果:575人中,麻疹IgG抗体的几何平均浓度(GMC)为1339.29 m IU/m l,抗体阳性率为96.5%,保护性抗体阳性率为74.8%;男性和女性的GMC、阳性率、保护性抗体阳性率均无统计学意义;各年龄组的GMC、阳性率、保护性抗体阳性率也没有统计学意义。结论:东莞市的15岁以上的外来员工抗体水平较高,但仍然有大约25%的人未达到有效保护水平。 黎景全 朱建琼 毛东波 刘隽 李艳芬关键词:麻疹 抗体水平 广东省东莞市2017—2018年登革病毒E基因进化分析 被引量:5 2019年 目的测定广东省东莞市2017—2018年Ⅰ~Ⅳ型登革病毒(DENV-1~DENV-4)的E基因序列,分析其系统进化情况及流行基因亚型,从分子水平探讨病毒来源。方法收集东莞市2017—2018年140例可疑登革热患者急性期血清,用实时荧光PCR方法检测病毒核酸,阳性血清用C6/36细胞分离培养登革病毒,测定分离株E基因序列,绘制系统进化树,结合流行病学资料进行分子流行病学分析。结果140份急性期血清中DENV核酸阳性54份,阳性率38.6%,DENV-1阳性占53.7%。分离得到17株毒株。序列比对和系统进化分析显示,10株DENV-1分离株间核苷酸同源性为90.0%~99.9%,氨基酸同源性为96.6%~99.8%,分属基因Ⅰ型和基因Ⅴ型。7株基因Ⅰ型分离株与泰国2015年、缅甸2015年、中山2015年及越南2016年流行株核苷酸同源性较高(99.3%~99.9%),其中2018年本地株D2018078与2017年输入株D2017008核苷酸同源性达99.8%;3株基因Ⅴ型分离株与印度2014年、2017年株及新加坡2014年流行株核苷酸同源性较高(97.7%~99.1%)。4株DENV-2分离株间核苷酸同源性为91.0%~98.6%,推导氨基酸同源性为97.6%~99.8%,分属混合型和亚洲Ⅰ型,2株混合型分离株与马来西亚2014年、台湾2015年流行株核苷酸同源性较高(99.6%~99.7%);2株亚洲Ⅰ型分离株分别与越南2015年、泰国2011年流行株核苷酸同源性较高(99.3%~99.5%)。2株DENV-3分离株间核苷酸同源性为98.4%,氨基酸同源性为99.4%,均属基因Ⅰ型,与缅甸2017年、马来西亚2015年流行株核苷酸同源性较高(99.3%~99.7%)。1株DENV-4分离株与越南2013、2016年流行株同源性较高(99.3%~99.5%),属基因Ⅰ型。结论2017—2018年东莞市登革热的病原体主要为DENV-1,其次是DENV-2,各至少有2种基因亚型同时在流行;DENV-3和DENV-4各至少有1种基因亚型在流行。流行方式主要为南亚和东南亚国家及我国中山、台湾等地输入病例引起的本地暴发流行,存在输入引起本地感染的风险。 陈仲威 张莉萍 方昌勇 黄勇 李艳芬关键词:E基因 基因亚型 序列同源性 进化分析 东莞市2010—2016年病毒性腹泻监测及分析 被引量:19 2018年 目的了解东莞市病毒性腹泻的病原体谱构成及流行情况,为东莞市病毒性腹泻防治提供资料依据。方法 2010年7月开始,每周从监测点医院采集感染性腹泻患者的粪便样品,采用ELISA方法检测轮状病毒抗原,荧光PCR方法检测诺如病毒、腺病毒、星状病毒核酸。结果 2010—2016年共检测粪便样品5 026份,全部检测轮状病毒和诺如病毒,其中600份检测腺病毒和星状病毒。4种病原体的阳性率分别为15.96%(802/5 026)、14.56%(732/5 026)、5%(30/600),1.33%(8/600),总检测阳性率为30.18%。轮状病毒、诺如GⅡ型病毒、腺病毒、星状病毒发病集中在2岁以下低龄儿童,各病原体2岁以下儿童感染比例分别为69.10%、62.26%、82.14%、71.43%。轮状病毒每年有1个流行高峰,每年12月份至次年1月达高峰。诺如GⅡ型病毒每年有2个流行高峰,3月和8月达高峰。结论监测的4种病原体中,轮状病毒和诺如病毒为病毒性腹泻的主要病原体,两者的阳性率相近。诺如病毒以GⅡ型为主。轮状病毒、诺如GⅡ型病毒、腺病毒和星状病毒主要感染2岁以下的婴幼儿,轮状病毒和诺如GⅡ型病毒感染有较强的季节性。 黄勇 陈永迪 李艳芬 黎景全关键词:病毒性腹泻 轮状病毒 诺如病毒 腺病毒 星状病毒 东莞市1例星状病毒核酸检测及分析 被引量:1 2012年 目的对星状病毒进行核酸快速诊断并对其部分核酸序列进行测序分析。方法采用RT-PCR、基因测序技术对标本中的核酸进行检测分析。结果 RT-PCR结果表明标本为星状病毒阳性,对PCR扩增产物测序得到了409bp长度的ORF2部分基因序列,经Blast比对发现其为Ⅰ型血清型,与北京分离的一株星状病毒序列(GenBank号FJ755403.1)最为相似,仅有一个C→T的核苷酸变异。但编码的氨基酸并无改变,均为甘氨酸(Gly)。结论应用PCR技术扩增星状病毒特定片段可用于病毒的快速检测,同时对扩增产物测序还可对病毒进行分型,并了解其基因变异情况。 黄勇 黎景全 李艳芬 李宇政 陈永迪关键词:星状病毒 逆转录-多聚酶链反应 基因测序