李婧 作品数:38 被引量:173 H指数:6 供职机构: 上海交通大学生命科学技术学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 黑龙江省青年科学基金 上海市科技兴农重点攻关项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 自动化与计算机技术 更多>>
动物数量性状单倍体型分析及其应用 动物数量性状基因座(QTL)分析中存在着很多问题:一是一个QTL中可能有多个SNP位点;二是多个QTL可能同时影响一个性状;三是因为一个性状可能涉及众多QTL且易受环境影响而使一个基因效应较小、难以检测;四是QTL在被用... 潘玉春 李婧关键词:QTL 候选基因 单倍体型 文献传递 大型船体焊接变形仿真技术研究及其应用——50000T多用途船货舱双层底结构焊接变形预测 焊接是船舶制造最主要的加工手段,焊接水平的高低在很大程度上决定了船体的质量和生产效率,而焊接变形又是焊接过程中最难控制的一环。焊接变形的存在不仅造成了焊接结构形状变异,尺寸精度下降和承载能力降低,而且在工作荷载作用下引起... 李婧文献传递 人类基因组单核苷酸多态性和单体型的分析及应用 被引量:48 2005年 单核苷酸多态性是人类基因组中最丰富的遗传变异。单体型是指位于一条染色体上或某一区域的一组相关联的SNP等位位点,单体型已经成为近年来人类遗传研究的组成部分。人类基因组单体型图(HapMap)计划的目标就是构建人类DNA序列中多态位点的常见模式,找出代表整个人类基因图谱之中的SNP集合的标签SNP。在复杂性疾病研究中,由多个变异位点组合构成的单体型分析优于单个SNP的分析。文章论述了SNPs、基因型、表现型的定义与HapMap计划的一些情况,综述了单体型的3种推断算法和单体域的不同定义与构建方法,同时介绍了标签SNP的选择及单体型与复杂疾病关联分析的方法,可利用公共SNP数据库的情况以及SNPs与单体型在复杂疾病与药物反应方面的应用。 李婧 潘玉春 李亦学 石铁流关键词:SNPS 单体型 复杂性疾病 民猪保种群产仔数基因、基因型分布变化分析 被引量:4 2005年 本文检测了2002年民猪保种群中,雌激素受体(ESR)基因和促卵泡素β亚基(FSHβ)基因的基因与基因型分布,并将其与2000年保种群的检测结果进行了比较。结果表明:与2000年保种群相比较,两个基因的基因、基因型分布均发生了变化,意味着民猪的产仔性能也发生了变化,这同已有报道的生产性能统计结果相符。因为2000-2002年期间,群体只有部分个体更新,所以尽管上述频率变化经检验部分差异不显著(P>0.05),仍说明群体遗传结构发生了一定变化。这两个基因分布的检测分析可以作为标记辅助保种的参考依据。 李婧 孟和 杨润清 潘玉春关键词:基因频率 民猪 猪单胺氧化酶A蛋白编码序列 一种猪单胺氧化酶A蛋白编码序列,用于基因工程领域。具有SEQ ID NO.1中从第40-1623位的核苷酸序列,其同人、小鼠、牛、狗的单胺氧化酶A蛋白编码序列同源性为91.26%。具有SEQ ID NO.1所示的氨基酸序... 潘玉春 白春艳 孟和 赵威 李婧文献传递 HBV相关肝癌组织中微生物宏蛋白质组特征分析 被引量:1 2021年 越来越多的证据表明微生物菌群和肝脏疾病有着密切联系,但是HBV相关肝细胞癌(hepatitis B virus(HBV)-related hepatocellular carcinoma,HCC)人群肝脏组织内的微生物菌群种类和数量仍不清楚。本研究对来自165个HCC人群的肝癌组织和对应癌旁组织的质谱数据进行宏蛋白质组学层面的鉴定。结果显示,在肝癌组织中,绿弯菌门(Chloroflexi)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、黄单胞菌目(Xanthomonadales)、军团菌目(Legionellales)、颤藻目(Oscillatoriales)等微生物菌群数量出现显著上调。通过将鉴定的微生物蛋白质比对到COG(Clusters of Orthologous Groups)数据库来进行注释,本研究还发现了许多在肝癌组织中高表达的微生物功能分类。对比健康人群的肝脏组织的宏蛋白质组鉴定结果,本研究发现在HCC人群的肝脏组织中,变形菌门(Proteobacteria)的含量降低,厚壁菌门(Firmicutes)的含量升高。这项研究可以对肝脏微生物菌群的失调与HCC发生之间的研究提供更多启发。 朱良全 常亚飞 李婧关键词:乙肝病毒 微生物 蛋白质质谱数据缺失值填补方法的比较与评估 被引量:1 2021年 基于质谱数据的蛋白质定量分析一直是目前高通量蛋白质组学的重要研究手段。但是基于现有质谱技术的限制,大规模蛋白质定量过程中往往会产生大量的缺失值,这在一定程度上影响了下游分析的准确性。尽管很多缺失值填补方法被不断提出,但是蛋白质组学领域对于不同情况下缺失值填补方法效力的综合评估仍然缺乏。本研究基于真实数据的分布特征,构建模拟数据集,在样本量、效应值以及缺失比例这三个维度上,综合评估了kNN、SVD、MLE、BPCA、LLS、Min、QRILC、Mean这8种缺失值填补方法的效力。结果显示,填补效力与样本量和效应值呈正相关,也与缺失比例呈负相关。同时,还发现在不同数据集中填补方法的效力有所差异,研究者需要根据数据集特征和自身需求选择适合的填补方法。本研究总结了不同数据集特征下的最优填补方法,供研究者进行参考和使用。 郭益浩 李婧关键词:蛋白质组学 缺失值 欧债危机的政治化与欧盟成员国的对欧政策
——以英法德三国为例 欧洲议题的政治化是一个新的研究热点,国外学者对此展开了多角度的分析,但中国国内尚鲜有相关研究。欧洲议题的政治化是指国内政治行为体动员大众关注、参与和推动欧盟决策争论的进程。本文关注欧债危机这一被严重政治化的欧洲议题,以欧... 李婧关键词:欧债危机 对欧政策 欧盟成员国 文献传递 猪钙蛋白酶抑制蛋白基因PCR-RFLP多态性与肉质性状及背膘厚间的关系分析 被引量:19 2005年 钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)是钙蛋白酶系统的内源性抑制剂,并且已经被确定能影响宰后肉的嫩度。本研究采用PCR-RFLP技术,分析了CAST基因在125头PIC杂交猪中的多态性分布及其与肉质性状和背膘厚间的相关。结果发现,CAST基因在本研究所检测的位点均具有多态性。进一步分析表明,CASTA2A2基因型个体与其相应的另外两个基因型个体相比肌内脂肪含量有显著差异,CASTB1B2基因型个体对于肌内脂肪含量的影响也有相同的趋势;CASTB1B2基因型个体与其相应的另外两个基因型个体相比背膘厚有显著差异,CASTC1C2基因型个体和CASTD1D2基因型个体对于背膘厚的影响也有相同的趋势。因此可以把CAST基因作为影响猪肉质性状和屠体性状的候选基因。 孙立彬 孟和 李婧 白春艳 潘玉春关键词:背膘厚 钙蛋白酶抑制蛋白 肉质性状 钙蛋白酶系统 巴西耕地资源空间分异特征研究 随着经济的快速发展、工业的不断推进,世界上的耕地也越来越快的减少,人均耕地面积不断变小,耕地资源与人类社会的关系逐渐超出单一的民族和国家的范畴,成为了制约整个人类生存与发展的全球大问题。位于南美洲东部的巴西,作为全球重要... 李婧关键词:耕地资源 文献传递