曹博
- 作品数：11 被引量：55H指数：4
- 供职机构：黑龙江省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 黑龙江省2012-2015年诺如病毒感染的分子流行病学研究被引量：3
- 2016年
- 目的监测2012-2015年黑龙江省诺如病毒腹泻的流行情况及流行株的基因型、重组变异特征。方法 2012年1月-2015年12月共采集480份哨点医院腹泻病人的粪便标本,采用Real-time PCR检测诺如病毒GI和GII基因组,对GII基因组阳性标本经传统RT-PCR扩增诺如病毒部分RNA依赖的RNA聚合酶(Rd Rp)和衣壳蛋白(VP1)序列,对核苷酸序列进行基因分型。结果 2012-2015年采集的腹泻病人粪便标本诺如病毒阳性率为3.54%(17/480),GI阳性1株,GII阳性16株。其中11株GII阳性株扩增测序成功,分为6种基因型,分别为:GII.4 Sydney_2012型、GII.4 Den Haag_2006b型、GII.P7/GII.6型、GII.P12/GII.3型、GII.P16/GII.13型和GII.17型。结论黑龙江省2012-2015年诺如病毒存在多种基因型,并存在不同基因型间重组株,提示诺如病毒在黑龙江省的遗传变异日趋复杂。
- 许军石鑫舒畅冷焱曹博王开利
- 关键词：诺如病毒基因分型
- 黑龙江省2013-2017年流感暴发疫情流行特征及影响因素分析被引量：10
- 2018年
- 目的分析黑龙江省2013-2017年流感暴发疫情流行特点及影响因素,为制定流感暴发疫情的防控策略提供科学依据。方法对2013-2017年黑龙江省流感暴发疫情进行流行病学分析。采用R软件对流感暴发疫情数据进行分析,采用Logistic回归模型分析流感暴发疫情的流行特征及影响因素,运用Pearson相关分析对流感暴发疫情首例发病至疫情报告的时间与整起事件持续时间进行分析。结果 2013-2017年,黑龙江省共报告流感暴发疫情21起,全部为学校及托幼机构报告,报告时间集中在每年的冬春季节。Logistic回归分析结果显示,学校人数、采取措施的及时性与暴发疫情罹患率的高低有关(P <0. 05)。流感暴发疫情首例发病至疫情报告的时间间隔与整起事件持续时间呈正相关(r=0. 667,P <0. 01)。结论黑龙江省2013-2017年流感暴发主要集中在冬春两季,学校和托幼机构是高发场所。加强流感监测,提高对首发病例的监测敏感度,有利于及时控制流感疫情。
- 曹博许军舒畅冷焱石鑫苏杨刘毅夫
- 关键词：LOGISTIC回归分析流感暴发疫情影响因素
- 黑龙江省2014-2015年H3N2流感病毒HA基因特性分析被引量：1
- 2017年
- 目的了解黑龙江省2014-2015年流感病毒优势株H3N2亚型HA基因变异特征。方法选取2014-2015年流感流行季节16株H3N2代表株进行HA基因扩增并测序,用DNAStar软件和MEGA 6软件分析序列并绘制基因进化树。结果 16株H3N2流感毒株经序列拼接后HA基因全长均为1701bp,编码566个氨基酸,同WHO推荐的北半球A/Switzerland/9715293/2013和A/Hong Kong/4801/2014 H3N2流感病毒疫苗株高度同源;黑龙江省从2015年11月开始H3N2亚型流感毒株逐渐由3C.3a向3C.2a支系转变,这与WHO推荐的2015-2016年流感病毒疫苗株A/Switzerland/9715293/2013(3C.3a)相比存在差别;16株H3N2代表株在抗原决定簇A区第142、第144位和B区第159、第160位上氨基酸发生改变。结论黑龙江省H3N2亚型流感病毒抗原性和HA1基因发生了一定的变异。
- 孙巍舒畅石鑫冷焱曹博苏杨刘毅夫许军
- 关键词：流感病毒H3N2亚型HA基因
- 黑龙江省2012-2015年病毒性腹泻监测分析被引量：4
- 2017年
- 目的了解黑龙江省病毒性腹泻的病原学特征,为制定预防措施提供科学依据。方法采用实时荧光定量PCR法对2012-2015年黑龙江省2家哨点医院的腹泻患者粪便标本进行轮状病毒、杯状病毒、星状病毒和肠道腺病毒核酸检测。采用反转录PCR法对A组轮状病毒和诺如病毒阳性标本进行基因分型。结果共检测483份粪便标本,检出121份阳性标本,阳性检出率为25.05%,混合感染占病毒阳性标本的10.74%。病毒阳性检出率排列依次为A组轮状病毒20.08%、诺如病毒3.31%、C组轮状病毒1.24%、肠道腺病毒1.24%、星状病毒1.24%、札如病毒0.62%。97份A组轮状病毒阳性标本进行G、P分型,结果显示G分型中,G9型最多,占50.52%(49/97);P分型中,P8型最多,占32.99%(32/97)。诺如病毒GII共测出6种基因型。结论黑龙江省2012-2015年散发病毒性腹泻患者A组轮状病毒感染率较高,诺如病毒基因型呈多样性,混合感染常见,应加强黑龙江省病毒性腹泻的病原学监测。
- 梁琦许军石鑫舒畅曹博刘毅夫
- 关键词：病毒性腹泻轮状病毒
- 黑龙江省2012-2016年度流感监测分析被引量：21
- 2017年
- 目的分析黑龙江省2012-2016年度流感监测数据,为今后流感防控工作提供参考。方法收集全省20家国家级哨点医院的流感样病例(ILI)数据进行病原学监测。结果哨点医院共报告ILI 168 972例,门急诊就诊病例11115 442例,ILI占门急诊就诊病例比例为1.52%,4个监测年度ILI%差异有统计学意义(χ~2=1 611.74,P<0.01);采集ILI标本50 189例,经核酸检测或病毒分离共检测出阳性标本4 753例,阳性率为9.47%;流感样病例集中在15岁以下的儿童;2012-2013年度以H3N2亚型为主,2013-2014年新甲型H1为优势株,2014-2016两个监测年度以H3N2和B型交替流行,与其他省份监测结果相同;阳性结果时间分布与ILI%趋势图基本一致。结论黑龙江省流感高峰符合北方省份流行特征,应加强对B型流感的监测,并积极推广流感疫苗的接种工作。
- 舒畅石鑫冷焱曹博苏杨刘毅夫许军
- 关键词：流感流感样病例
- 黑龙江省流感预警模型的建立与应用被引量：1
- 2014年
- 目的运用流感监测网络建立流感预警模型,通过预警减少流感暴发或流行。方法收集黑龙江省2011-2013年流感监测网络的监测数据,通过ARIMA运用流行病学研究方法计算建立黑龙江省流感流行预警数据库和预警模型。结果建立流感流行预警数据库和预警模型,基线最大值为2.75%,最小值为1.74%;上限最大值为3.30%,最小值为2.08%;预警线最大值在1月份,最小值在8月份。对2009年和2013年流感样病例(ILI)%流行曲线进行预警应用观察,流行趋势总体平稳,较接近于预警模型下限,全年未超过预警模型上限,未报告流感暴发疫情。模型提示流感流行关注的时间在第6周和第40周。2009年流感ILI%流行曲线明显超过警戒线,高峰出现在9-11月,与全年报告18起流感暴发实际月份相符。流感预警信息发布最佳时间在第33周。结论该流感预警模型有较强的灵敏性和特异性,其建立与应用,可为流感防控工作策略和防控措施提供科学依据。
- 苏杨曹博许军杨明舒畅刘毅夫冷焱王开利
- 关键词：流感预警模型
- 黑龙江省2016年4起胃肠炎暴发中诺如病毒分子特征分析被引量：3
- 2018年
- 目的分析黑龙江省2016年4起急性胃肠炎暴发疫情的诺如病毒分子特征。方法收集4起急性胃肠炎暴发疫情患者的肛拭子或粪便标本，采用荧光定量RT—PCR方法检测诺如病毒，并对阳性标本进行传统RT-PCR方法扩增、序列测定和系统进化分析。结果4起暴发疫情共检测标本102份，诺如病毒阳性35份，其中GI14份，GII21份。序列分析显示，引起黑龙江省2016年4起急性胃肠炎暴发疫情的诺如病毒有多种基因型，包括GII．2型、GII．17型、GII．Pe型、GII．P12／GII．3型、GI．6型、GI．Pd／GI．3型。结论诺如病毒是引起黑龙江省胃肠炎暴发疫情的重要病原体，黑龙江省流行的诺如病毒基因型存在多样性。
- 许军石鑫舒畅冷焱曹博孙巍
- 关键词：诺如病毒基因型
- 黑龙江省活禽市场6株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列分析被引量：2
- 2019年
- 目的了解2018年黑龙江省活禽市场H9N2亚型禽流感病毒变异特点和进化规律。方法采集黑龙江省禽流感监测点活禽市场的环境标本进行H9N2亚型的核酸检测,阳性标本进行病毒分离,对分离的禽流感病毒毒株进行全基因组序列测定,应用生物信息学软件分析其基因特征。结果 6株H9N2亚型禽流感病毒HA基因裂解位点附近氨基酸序列均为PSRSSRGLF,符合典型低致病性禽流感病毒基因的特征,HA蛋白受体结合位点第226位Q→L,具有与α-2,6唾液酸受体亲和力增强的特性,第183位突变为天冬酰氨;NA蛋白中63-65位茎部全部缺失,使病毒的生长受到抑制,在3个可能的血凝素结合位点中,6株病毒发生变异(368N,369G,402D);另外,HA和NA基因潜在糖基化位点也存在增加或缺失的现象;与参考序列相比,PB1、PB2蛋白有3处发生突变,增强了病毒的致病性;M2蛋白发生V27G和S31N突变,对金刚烷类药物产生耐药;NP和NS基因在几个关键位点上均未发生变异。遗传进化分析显示,6株H9N2亚型禽流感病毒在NA、M和NP基因中相似度更高,HA、NA基因位于Y280/97-like分支,PB2、M基因位于G1/97-like分支,PB1、PA、NP和NS基因均位于F/98-like分支。结论 6株H9N2亚型禽流感病毒发生了3配体重组,可能成为高致病性禽流感病毒H5、H7亚型部分基因的供体。因此,应加强对H9N2亚型禽流感病毒的监测,密切关注其变异情况及重组趋势。
- 舒畅冷焱石鑫曹博许军
- 关键词：H9N2禽流感病毒遗传进化分析
- 黑龙江省2009-2014年住院严重急性呼吸道感染病例监测结果分析被引量：4
- 2015年
- 目的了解黑龙江省2009-2014年住院严重急性呼吸道感染(SARI)病例的临床和流行病学特征。方法对符合SARI病例定义的标本进行核酸检测、病毒分离及基因特性分析。结果共采集SARI病例2 053例,主要来自呼吸内科,其中流感病毒阳性127例,阳性率为6.19%;流感病毒阳性最多的年龄组为60岁以上组,占50.39%;临床表现以发热和咳嗽最为常见;从440例SARI病例中检出流感病毒以外的其他呼吸道病毒34例;测序的6例标本与WHO在2014-2015年间推荐的A/Texas/50/2012疫苗株同源性较高。结论住院严重急性呼吸道感染病例的监测,是对流感ILI病例监测的有效补充,反映了流感的严重程度和危险因素,为流感防控工作和临床治疗提供科学依据。
- 舒畅许军王开利曹博冷焱王玉峰刘毅夫
- 关键词：流感病毒
- 黑龙江省流感监测工作质量评估分析被引量：5
- 2015年
- 2009年甲型H1N1流感引起全球大流行,为有效应对和及时掌握流感流行趋势和毒株变异情况,为科学防控提供依据,我国在全国范围内扩大了流感监测网络,覆盖了所有的地级市,现有556家流感监测哨点医院和411家网络实验室。
- 代伟萍许军冷焱曹博舒畅刘毅夫
- 关键词：流感
