徐金刚
- 作品数:5 被引量:12H指数:2
- 供职机构:广东省农业科学院更多>>
- 发文基金:博士科研启动基金引进国际先进农业科技计划广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 香蕉抗病基因类似序列(RGA)的克隆与分析被引量:8
- 2007年
- 根据植物NBS类抗病基因保守氨基酸序列P-loop和疏水氨基酸GLPL保守序列设计简并引物,从香蕉抗镰刀菌枯萎病(4号小种)材料IN21(Musa spp.cv.'IN21',AA)和Rose(M.spp.cv.'rose',AAA)的基因组DNA中扩增获得4个RGA,四条DNA片段长度分别为527 bp、537 bp、534 bp和547 bp,分别命名为"RGA-IN1"、"RGA-IN2"、"RGA-Rose1"和"RGA-Rose2"(GenBank Accession:EF488469、EF488470、EF488471和EF488472);同源性分析表明,均与已报道的植物抗病基因有不同程度的同源性,具有P-loop、Kinase-2、RNBS-B(Kinase-3a)以及GLPL等保守氨基酸序列,属于non-TIR-NBS类候选抗病基因。
- 孟祥春徐金刚黄秉智蔡礼鸿向旭
- 关键词:香蕉
- 荔枝内源多胺的高效液相色谱分析被引量:3
- 2007年
- 采用高效液相色谱法(分离柱为C18反相柱、柱温40℃,流动相为甲醇∶水=36∶64、流速为0.8 mL/min,紫外检测器的检测波长为233 nm,外标法定量)测定了开花坐果期荔枝叶片中内源多胺Put、Spd、Spm的含量,结果表明:Put、Spd和Spm标准品保留时间分别为6.648、8.892、12.246 min,一次样品的测定可在15 min内完成;Put、Spd和Spm在0.03125~2 nmol线性范围内,相关系数分别为0.9996、0.9996、0.9995;精密度和稳定性试验的相对标准偏差均小于5%,说明该测定方法稳定、分析精密度高。
- 蒋学美王晓容徐金刚欧良喜蔡礼鸿向旭
- 关键词:荔枝内源多胺高效液相色谱分析
- 香蕉抗病种质RLK-RGAs的克隆与序列差异分析被引量:1
- 2008年
- 利用其他植物抗病基因PK类保守域的9个结构域所设计简并引物,从抗镰刀菌枯萎病香蕉种质ROSE和GCTCV-119中分离了20个香蕉RGA片段,大小为530bp左右,其中14条DNA片段和6条cDNA片段。根据其推断的氨基酸序列,经过保守结构域分析,其结构域为S_TKc,为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族成员,包含4功能域,分别为ATP binding pocket,substrate binding pocket,catalytic loop和activation loop。具有9个高度保守的氨基酸区域:Ⅰ.FG(K/V/L/S)VY(K/R)G;Ⅱ.VAVK;Ⅲ.FxxE;Ⅳ.(L/V/I)Vx(I/V/L);Ⅴ.ALV;Ⅵ.D(L/I/V)K;Ⅶ.DFG;Ⅷ.G(T/S)xGY(L/I/A)PE;Ⅸ.D(Y/I)YS-(F/Y)G(V/I/M)。将这20条RGAs序列分别命名为Mu-PK1,Mu-PK2,……,Mu-PK20,并提交GenBank,获得登录号分别为EU293391-EU293404(DNA片段),EU338457-EU338462(cDNA片段)。
- 徐金刚向旭蔡礼鸿黄秉智孟祥春
- 关键词:香蕉抗病种质类受体蛋白激酶抗病基因同源序列
- 香蕉抗病种质NBS类RGAs的克隆及相关序列差异分析
- 2008年
- 根据植物NBS类抗病基因保守氨基酸序列P-loop和疏水氨基酸GLPL保守序列设计简并引物,从香蕉抗镰刀菌枯萎病(4号小种)材料GCTCV-119的基因组DNA及cDNA中扩增获得9个DNA片段和10条cDNA片段,均编码为通读的氨基酸序列,命名为"BR-1"-"BR-19",GenBank登录号依次为EF515833-EF515836, EU123871-EU123885。同源性分析表明,均与已报道的植物抗病基因有不同程度的同源性,具有P-loop(Kinase-1a)、Kinase-2、RNBS-B(Kinase-3a)以及GLPL等保守氨基酸序列,属于non-TIR-NBS类候选抗病基因。其中,BR-5和BR-6与番茄抗镰刀菌枯萎病番茄专化型I2、I2-1和I2-2基因聚为一类,可能与香蕉镰刀菌枯萎病的抗性相关。
- 徐金刚向旭蔡礼鸿孟祥春黄秉智
- 关键词:香蕉抗病种质
- 香蕉镰刀菌枯萎病抗病种质RGAs的克隆与分析
- 香蕉镰刀菌枯萎病,又称巴拿马病,是一种由土壤真菌引起的毁灭性病害,目前正严重危害世界香蕉生产。从抗镰刀菌枯萎病种质材料中分离出抗镰刀菌枯萎病基因,为抗病育种服务,已成为业内研究的热点和难点问题。
同源序列候选基...
- 徐金刚
- 关键词:香蕉镰刀菌枯萎病抗病育种
- 文献传递