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干血斑用于HIV-1耐药基因型检测的研究被引量：9: 2010年; 目的通过干血斑样本与血浆、全血的HIV-1基因型耐药性检测结果比较，探讨十血斑样本应用于我国患者HIV—1耐药性检测及监测的可行性。方法选择来自安徽（10例）、云南（13例）、湖南（6例）和新疆维吾尔自治区（10例）4省（自治区）共39例AIDS患者，这些患者感染的HIV-1流行株覆盖中国主要的流行亚型（B、CRF01_AE、CRF07_BC），同时对同一患者的血浆、全血及干血斑3种类型的样本应用实验室自建的套式PCR方法扩增HIV的pol基因区，通过美国斯坦福大学的HIV耐药数据库进行耐药程度判别并比较三者的耐药性结果。结果干血斑、全血与血浆样本相比总扩增成功率分别为95％（37／39）、92％（36／39）及100％（39／39），各亚型样本基因序列的3种样本的一致性均高于99％，同时干血斑样本的耐药性检测结果与血浆相比一致性为86％（31／36），突变位点不一致的主要原因为混合碱基导致。结论综合PCR扩增效果及序列分析差异等因素，十血斑样本可以反映出耐药的整体流行趋势，用于我国HIV-1患者的耐药检测及监测值得推广。; 马鹏飞邢辉廖玲洁陈彬赵全壁全宇孙峰杨绍敏苏斌陈曦邵一鸣; 关键词：HIV-1 干血斑聚合酶链反应

河南和新疆地区HIV-1毒株gp120和gag基因的变异分析被引量：12: 2007年; 目的分析中国河南和新疆地区艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株gp120和gag基因全长序列的变异特征。方法PCR扩增河南和新疆HIV-1确认阳性样本前病毒DNA gp120和gag全长基因,测序得到40份gp120和41份gag基因序列,用GCG软件包等软件进行分析。结果河南省HIV-1毒株为B′亚型,新疆维吾尔自治区HIV-1毒株为CRF07 BC亚型。B′亚型毒株gp120基因中变异程度最大的区段是V5区段,最小的是C1区段;CRF07BC亚型毒株中变异最大的是V1区段,最小的是C4区段。两种亚型毒株gp120和gag基因的Ks/Ka值<1(P<0.05)。结论对于病毒基因全长序列的分析可以更多地反映病毒的特性。gp120基因各个区段在B′和CRF07BC亚型毒株中的变异程度不一致。B′和CRF07 BC亚型毒株的gp120基因和gag基因都受到正向选择压力的作用。; 宋艳辉邢辉王哲张远志孙峰何翔陈建平邵一鸣; 关键词：系统进化树

3起细菌性痢疾聚集性疫情实验室检测分析: 2020年; 目的比较新疆伊犁哈萨克自治州(简称伊犁州)3起细菌性痢疾聚集性疫情实验室检测结果,优化检测程序,为今后及时、准确地开展现场调查和病原排查做好实验室技术储备。方法采用现场流行病学、环境卫生学调查与实验室检测相结合的方法,检测粪便、肛拭子样本、食品样本和生活饮用水样本,开展菌株分离、鉴定和卫生学评价。结果2012,2013和2018年伊犁州疾病预防控制中心实验室共接到3起突发群体性腹泻事件报告,142份人粪便样本中,检出宋内I相菌8株、福氏群7型18株,福氏群3型和4型2株;3起疫情粪便样本中均检出宋内I相菌,在SS和MAC分离鉴定培养基中占优势生长的大肠埃希菌3株;12份学校早餐样本中,检出宋内Ⅱ相菌1株;11份生活饮用水样,菌落总数、总大肠菌群和耐热大肠菌群均不同程度超标。结论3起聚集性疫情均因志贺菌污染水源或食物所致,检出优势菌宋内菌群(D群)基本与国家监测哨点结果一致;水体粪便指示菌的污染,一定程度反映了肠道致病菌的存在;造成志贺菌实验室误诊的关键因素,除经典的宋内菌迟缓发酵乳糖现象外,呈志贺样生化反应、不活泼大肠埃希菌的鉴别也很重要。; 孙峰伊力亚尔·阿不都外力布买力亚·肉孜刘书起王小平; 关键词：细菌性痢疾菌株鉴定

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孙峰