谢玉素
- 作品数:12 被引量:2H指数:1
- 供职机构:中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学历史地理更多>>
- 一种对虾性别探针及其获取方法
- 本发明涉及一种中国明对虾性别探针的开发。即利用分子生物学手段筛选用于对虾性别检测的特异性引物,用于对虾的性别检测。具体地,包括用于检测性别的序列筛选、对虾RNA样品的制备、RNA的反转录、PCR检测等。本发明的优点在于利...
- 李富花李诗豪相建海谢玉素王兵
- 皱纹盘鲍摄食不同藻类的转录组响应及相关硫酸酯酶基因ids-1功能分析
- 2024年
- 为解析皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)对其摄食藻类的分解与适应机制,采用转录组测序、生物信息学分析、基因克隆、荧光定量PCR、原核表达、蛋白纯化及酶活检测等方法,进行了3种藻类[海带(Laminaria japonica)、龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)和孔石莼(Ulva pertusa)]喂养条件下内脏团组织差异表达基因的研究,进一步选取饵料适应相关的硫酸酯酶ids-1基因,进行了基因克隆和初步的功能分析。结果表明:在龙须菜和海带对比组(Long vSHai)中共鉴定到上调差异基因104个,下调差异基因118个;孔石莼和海带对比组(Shi vSHai)中筛选出上调基因80个,下调基因93个;孔石莼和龙须菜对比组(Shi vSLong)中,上调基因与下调基因个数分别为77、72个;富集分析结果显示,差异基因富集到的条目多与物质代谢,尤其是硫酸化物质的合成、分解及代谢有关,其中在GO:0006027(glycosaminoglycan catabolic process)鉴定到多个出现表达差异的硫酸酯酶基因;克隆了皱纹盘鲍硫酸酯酶ids-1基因,其开放阅读框为1767 bp,可编码588个氨基酸,包含N端信号肽结构(1~23 aa)、硫酸酯酶的保守结构域(28~376 aa)及9个糖基化位点;系统发育分析表明,皱纹盘鲍IDS-1与红鲍及黑唇鲍IDS的同源性最高;氨基酸序列比对结果显示,皱纹盘鲍IDS-1既具有硫酸酯酶家族典型的五肽基序“CXPXR”,也含有IDS亚家族高度保守的活性位点;然而,利用大肠杆菌体外表达系统获得的IDS-1重组蛋白并未显示硫酸酯酶的活性;qPCR结果显示,ids-1在皱纹盘鲍消化腺中表达量最高,其次为鳃和外套膜,上足触手组织表达量较低;ids-1的表达还具有发育阶段特异性,在受精卵至浮游幼虫阶段表达量低,自匍匐幼虫开始升高,至成体时表达水平最高;在不同藻类喂养条件下的ids-1表达差异显著,海带喂养组表达量显著高于龙须菜和孔石莼喂养组,孔石莼组表达量最低。研究表明,ids-1与鲍�
- 胡涛泽谢玉素李超姚奕冰刘晓许飞
- 关键词:皱纹盘鲍转录组学硫酸酯酶IDS分子特征
- 海洋线虫Litoditis marina低氧胁迫响应的转录组分析
- 2023年
- 全球气候变化导致海洋氧含量降低,海水低氧胁迫对海洋无脊椎动物的生长、发育和繁殖造成了严重的威胁。以海洋线虫Litoditis marina为实验对象,观察了其在不同氧浓度(21%、3%、1%和0.5%)条件下的生长发育速率,并对不同氧浓度条件下的L1幼虫样品进行了转录组测序和分析。实验结果表明,当环境氧浓度从21%下降至3%时,L.marina的发育成熟速度明显加快,进一步下降至1%时,产卵时间延长并和21%氧浓度接近,但当氧浓度为0.5%时,L.marina的产卵时间显著延迟。比较转录组分析表明,相比于21%氧浓度环境,3%、1%和0.5%低氧条件下L.marina的糖酵解、糖异生、硫代谢和线粒体碳代谢等通路相关基因的表达显著上调;而寿命调控通路、细胞色素P450代谢通路和ABC转运蛋白相关基因的表达显著下调。研究结果发现的海洋线虫应对氧浓度胁迫的基因表达变化模式,为深入理解海洋无脊椎动物应答低氧胁迫分子机制提供了重要参考。
- 李博谢玉素李博
- 关键词:海洋线虫低氧胁迫糖酵解
- 中国明对虾三倍体性腺发育机理的初步研究
- 三倍体培育是水产动物遗传改良的重要途径之一,它在提高养殖产量、改良品质方面发挥着重要作用。对虾三倍体在性腺发育和性别比率方面与二倍体之间存在明显差异。本论文对三倍体性腺发育的分子机理进行了初步探讨,为阐明甲壳动物的性腺发...
- 谢玉素
- 关键词:中国明对虾三倍体性腺发育联会复合体抑制性消减杂交技术性别控制
- 缺氧胁迫对中国明对虾肝胰脏蛋白表达的影响
- 缺氧是中国明对虾养殖过程中一种常见的环境胁迫,它能影响虾池中对虾的生理状态,引起对虾死亡率升高、产量下降。为深入了解对虾应答缺氧胁迫的机制,本研究利用蛋白质组学方法,筛选了缺氧胁迫后中国明对虾肝胰脏差异表达的蛋白质。双向...
- 蒋吴李富花谢玉素相建海
- 关键词:中国明对虾肝胰脏
- 一种对虾性别探针及其获取方法
- 本发明涉及一种中国明对虾性别探针的开发。即利用分子生物学手段筛选用于对虾性别检测的特异性引物,用于对虾的性别检测。具体地,包括用于检测性别的序列筛选、对虾RNA样品的制备、RNA的反转录、PCR检测等。本发明的优点在于利...
- 李富花李诗豪相建海谢玉素王兵
- 利用抑制性消减杂交技术筛选中国明对虾二倍体和三倍体卵巢差异表达的基因
- 课题组前期研究的结果表明,三倍体对虾卵巢发育同正常的二倍体对虾卵巢发育相比明显延迟。为揭示三倍体对虾卵巢发育延迟的分子机理,我们利用抑制性消减杂交技术筛选二倍体和三倍体卵巢差异表达的基因。以三倍体卵巢作为实验组,二倍体卵...
- 谢玉素李富花李诗豪相建海
- 关键词:三倍体卵巢发育中国明对虾抑制性消减杂交技术
- 海洋线虫Litoditis marina酸性pH胁迫响应的转录组分析被引量:2
- 2020年
- 工业革命以来,二氧化碳排放导致了海洋酸化。海水pH下降对无脊椎动物的生长发育、繁殖、代谢和免疫等多个生命过程产生重要影响,但海洋无脊椎动物如何感知和响应酸性pH胁迫的分子机制还很不清楚。本研究以团队建立的海洋线虫Litoditis marina品系为模型,对其在不同酸性pH条件下的表型特征及转录组数据进行了分析。结果表明,当pH从实验室最佳生长条件5.92下降到5.33时,L.marina生长发育的速度明显减慢,但依然可以产卵繁殖;但当pH下降到4.33时,L.marina的生长受到严重影响,表现为不能长成成体且不能产卵繁殖。通过转录组数据分析,发现当pH从5.92下降到4.33时,海洋线虫L.marina脂肪酸β-氧化通路基因和不饱和脂肪酸合成相关基因表达上调;表皮相关基因表达则呈现差异变化,2个nas基因和6个ptr基因表达显著上调,表皮胶原基因col类基因的表达没有发生显著变化;细胞色素P450通路相关基因、凝集素C基因和HSP70家族基因的表达量显著上调。当pH从5.92下降到5.33时,上述提到的这些上调基因中的大多数没有发生显著变化。我们发现的海洋线虫应答酸化胁迫的主要调控模式,为理解生物体能够在低pH环境中生存的分子机制提供了参考,为筛选和识别生物体响应和适应酸化胁迫的关键基因奠定了基础。
- 丛岩懿谢玉素张留所
- 关键词:海洋线虫
- 中国明对虾凝血栓蛋白基因全长cDNA的克隆及其表达特征
- 2006年
- 获得了中国明对虾凝血栓蛋白(TSP)基因全长cDNA,该基因由2868个碱基组成,具有一个2763bp的开放阅读框,编码920个氨基酸,其中包含21个氨基酸组成的信号肽.中国明对虾TSP由四类不同的结构域组成,从N端开始顺序为几丁质结合结构域,EGF-like结构域,Type Ⅲ repeat和TSP carboxyl-terminal domain(TSP-C结构域).结构域分析发现,中国明对虾的N端不具有TSP N-terminal domain(TSPN结构域),但有一个几丁质结合结构域,其C端的Type Ⅲ和TSP-C结构域非常保守.该基因在弧菌感染后的对虾淋巴器官和肝胰脏中的表达量显著增加,并具有不同的时空表达趋势,提示中国明对虾TSP基因在免疫反应中具有重要作用.
- 王兵李富花谢玉素相建海
- 关键词:中国明对虾弧菌感染基因表达
- 对虾性别控制和卵巢发育分子机制初探
- 动物性别控制研究一直国际相关研究的热点和难点。对虾作为我国重要的水产养殖对象,由于其性别二态性的存在,通过性别控制可以达到提高养殖产量的目的,因而对虾性别控制研究引起了国际同行的高度关注。由于在诱导的对虾三倍体群体中,雌...
- 李富花于奎杰李诗豪谢玉素相建海
- 关键词:卵巢发育三倍体性别控制分子机制