胡亮亮
- 作品数:4 被引量:1H指数:1
- 供职机构:陕西师范大学化学化工学院陕西省生命分析化学重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生农业科学化学工程更多>>
- 荧光小分子2-氨基-5,6,7-三甲基-1,8-萘啶识别dsDNA中胞嘧啶凸出被引量:1
- 2011年
- 双链DNA(dsDNA)中单碱基凸出结构(bulge structure)具有重要生物学意义,这种结构也是DNA靶向药物的目标部位之一.荧光小分子2-氨基-5,6,7-三甲基-1,8-萘啶(ATMND)能够通过氢键识别胞嘧啶(cytosine),因而对dsDNA中凸出的胞嘧啶表现出明显的特异性结合.与其余三种凸出的碱基相比,ATMND与凸出部位胞嘧啶的结合伴随着ATMND荧光的明显猝灭,因而可以用于胞嘧啶凸出结构的识别.利用解旋温度测量、荧光、圆二色光谱对ATMND和存在胞嘧啶凸出结构的dsDNA相互作用进行了研究.荧光滴定结果表明ATMND和dsDNA中凸出部位未配对的胞嘧啶的结合常数K11=4.8×105M?1.通过对含胞嘧啶凸出结构的dsDNA与ATMND结合前后的解旋温度曲线进行解析,发现胞嘧啶凸出结构相邻碱基对凸出的胞嘧啶与ATMND的结合有较大的影响.荧光测量结果也表明ATMND荧光的猝灭效率与凸出结构相邻碱基的类型有关,当相邻碱基为鸟嘌呤(guanine,G)时,荧光猝灭效率最高.基于dsDNA中凸出的碱基对ATMND荧光猝灭效率存在明显差异这一现象,设计了探针DNA实现了乳腺癌相关基因(PGR gene rs3740753)中单核苷酸多态性(G/C变异)的荧光分型.
- 胡亮亮薄红艳高强漆红兰张成孝
- 关键词:荧光氢键
- 荧光探针氨氯吡咪对DNA双链中单链断裂损伤的识别研究
- 2010年
- 将氨氯吡咪选择性地嵌入ds-DNA中单链断裂损伤所形成的缺口位点,并通过氢键与缺口位点处的碱基结合从而导致氨氯吡咪荧光猝灭,据此建立了荧光检测DNA单链断裂损伤的新方法.氨氯吡咪荧光的猝灭程度与缺口位点处碱基类型相关,当缺口位点处的碱基为T碱基时,荧光猝灭程度最大.荧光滴定实验表明氨氯吡咪和存在缺口位点的ds-DNA是1∶1结合,结合常数为105mol/L数量级.在正常ds-DNA和存在单链断裂损伤的ds-DNA的溶液中加入氨氯吡咪,在紫外灯照射下通过目视法即可分辨出二者荧光强度的不同.
- 胡亮亮张文艳刘蓓高强
- 关键词:荧光氨氯吡咪氢键
- 基于荧光小分子2-氨基-7-甲基-1,8-萘啶对C碱基的识别检测DNA双链中的C/C错配
- 2009年
- 单碱基错配是单核苷酸多态性(SNPs)的一种,是导致突变的DNA损伤类型之一。单碱基错配的检测对于从分子水平上阐明多种疾病形成的原因,实现基因水平的治疗都是至关重要的前提条件。发展具有高灵敏度、高选择性的单碱基错配检测方法势在必行。常用的单碱基错配检测方法包括凝胶电泳、荧光检测、SPR和质谱检测等。
- 蔺凯胡亮亮张文艳高强张成孝
- 关键词:碱基错配荧光检测C/C氨基双链
- 荧光小分子氨氯吡咪识别ds—DNA中单链断裂损伤的研究
- 2009年
- DNA的单链断裂损伤(single strand breaks,SSBs)是严重的DNA损伤之一。估计每个哺乳类细胞每天DNA单链断裂发生的频率约为5万次。因而发展灵敏、快速、简便的方法检测DNA骨架断裂损伤,对于疾病早期诊断、药物筛选等都具有重要的意义。传统的测定细胞DNA骨架断裂的方法包括:中性或碱性蔗糖密度梯度离心法、DNA碱解旋速率法、中性或碱性膜洗脱法、DNA粘度测量法等。
- 张文艳胡亮亮蔺凯高强张成孝
- 关键词:DNA单链断裂DNA损伤分子氨DS