聂清
- 作品数：25 被引量：36H指数：3
- 供职机构：潍坊市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：山东省医药卫生科技发展计划项目潍坊市卫生局科研项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 2013-2020年潍坊市A(H1N1)pdm09流感病毒血凝素基因特征分析
- 2024年
- 目的分析2013-2020年山东省潍坊市A(H1N1)pdm09流感病毒血凝素(HA)基因遗传进化特征,了解潍坊市A(H1N1)pdm09亚型变异情况,为及早发现新变异株以及精准防控提供科学依据。方法收集2013-2020监测年度山东省潍坊市A(H1N1)pdm09流感病毒阳性样本,进行病毒分离,于阳性毒株中按年度共挑选18株流感毒株,采用二代测序方法获得HA基因序列信息后,使用RAxML软件,采用最大似然法(ML)构建系统进化树,使用BioEdit软件分析氨基酸位点变异情况,使用NetNGlyc 1.0 Server在线软件进行HA糖基化位点分析,使用datamonkey在线软件进行选择性压力分析,选用模型为单似然祖先计数(SLAC)模型、固定效应似然(FEL)模型。结果潍坊市18株A(H1N1)pdm09亚型分离株HA基因分属于6B、6B.1、6B.2等分支,大部分毒株(17/18)与对应年份疫苗株分属相同分支,且与对应年份疫苗株相比,HA基因序列的核苷酸同源性均>97.3%。氨基酸序列分析显示,HA蛋白有12~22个氨基酸突变不等,且均发生了位于抗原决定簇的突变,包括Sa区L161I、S162N、K163Q、S164T位,Sb区S185T、T185I位,Ca区H138Y、S203T位及Cb区S74R位,83.3%病毒发生了两个及以上抗原决定性突变;发现位于受体结合部位220环的Q223R突变及受体结合部位附近的S183P和I216T突变;自2016年开始潍坊分离株的糖基化位点改变较为频繁,包括11NSTD缺失、162NQSY增加,变异糖基化位点162NQTY增加及162NQTY缺失。选择性压力分析显示,dN/dS值分别为0.65与0.279,均未发现正向选择性压力位点。结论2013-2020年山东省潍坊市A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因总体与当年疫苗株比较接近,但HA基因及其编码氨基酸仍存在持续变异,需加强监测。
- 田蒙蒙刘德辉胡林陈莹莹李东英张媛媛刘淑慧聂清
- 关键词：甲型H1N1病毒流感病毒HA基因基因进化
- 护手霜中铜绿假单胞菌的检出被引量：1
- 2008年
- 祝洪山聂清李东英张晓东管益涛
- 关键词：化妆品护手霜铜绿假单胞菌
- 潍坊市2016年——2019年活禽市场禽流感病毒污染情况地域分析
- 2021年
- 目的调查潍坊市9个县市区2016年—2019年活禽市场禽流感病毒(AIV)污染情况,为潍坊市人感染AIV防控工作提供实验数据。方法采集2016年—2019年潍坊市9个县市区活禽市场样本,实时荧光定量PCR法进行A型流感病毒(Flu A)检测,描述性流行病学法进行流行特征分析,arc GIS 10.0进行地域可视化处理。结果 2016年—2019年共采集1 771份活禽市场标本,Flu A污染率为19.09%,2019年污染率最高为21.97%,2017年20.39%,2016年16.98%,2018年为14.76%。污染率从高到低依次为高密市(31.87%)、中心城区(31.52%)、昌乐县(30.09%)、青州市(22.35%)、诸城市(19.33%)、安丘市(9.02%)、昌邑市(8.70%)、临朐县(7.14%)、寿光市(5.00%)。可视化分析显示高密市及中心城区污染最严重,随后依次为昌乐县、青州市、诸城市、安丘市、昌邑市、临朐县、寿光市。结论潍坊市活禽市场存在AIV污染情况,须采取有效措施控制AIV传播途径,从源头上降低人感染AIV风险。
- 刘德辉丁睿聂清李东英张凤娟丁树刚
- 关键词：禽流感病毒活禽市场污染
- 潍坊市艾滋病筛查实验室质量考评结果分析
- 2008年
- 目的了解潍坊市艾滋病筛查实验室规范化管理程度及实验室检测技术水平。方法通过盲样考核和工作职能考评对本市共41家艾滋病筛查实验室进行评估。结果经过评估有32家实验室成绩为优秀,5家成绩良好,4家实验室不合格。结论潍坊市艾滋病筛查实验室网络经过几年的建设,规模已经初步形成,但部分实验室技术人员检验技术水平有待进一步提高。
- 张保强徐斌聂清
- 关键词：艾滋病筛查实验室
- 山东省潍坊市柯萨奇病毒A6型VP1区基因进化特征分析被引量：1
- 2023年
- 目的 探讨2015-2020年山东省潍坊市柯萨奇病毒A6(CV-A6)VP1区核苷酸进化特征,明确潍坊市CV-A6的基本流行状况及VP1区毒力相关的氨基酸位点。方法 收集2015-2020年山东省潍坊市手足口病患者CV-A6核酸阳性标本,进行VP1区全长序列扩增及核苷酸序列测定,根据GenBank中CV-A6原型株及参考序列(含重症、轻症)进行基因分型、选择性压力分析、重症及轻症间氨基酸位点差异对比分析。结果 共获得15条915 bp VP1轻症全长序列,15条序列均位于D3a分支中,且分别与不同地域序列处于不同分支中。与轻症序列相比,重症序列VP1区的5个氨基酸替代位点S5A(χ^(2)=13.37,P=0.001)、A30V(χ^(2)=6.79,P=0.009)、N137S(χ^(2)=5.40,P=0.02)、V242I(χ^(2)=14.41,P=0.000)、A283T(χ^(2)=14.26,P=0.000)差异均有统计学意义(P<0.05)。潍坊市CV-A6 VP1区序列中,有4条序列在两个位点与重症序列突变一致(I174V、A283T)。所有VP1序列只存在负选择压力,Ka/Ks>1,3个碱基A410G、A520G、G724A发生非同义突变,分别位于三个氨基酸替代位点N137S、I174V、V242I的密码子中,突变率与氨基酸替代率一致。结论 2015-2020年山东省潍坊市手足口病CV-A6 VP1区为轻症序列,均位于D3a分支中D3a基因亚型。重症序列中的N137S、I174V、V242I三个氨基酸位点可能与CV-A6致病性相关。
- 刘德辉马淑青聂清张凤娟胡林刘淑慧刘艳菊
- 关键词：手足口病
- 2019年潍坊地区一株登革病毒全基因组序列分析
- 2023年
- 目的 分析2019年潍坊市一株登革病毒(Weifang 2019)全基因组序列及关键性氨基酸位点的突变情况。方法 收集登革病毒感染病例的血清样本,对初检阳性样本进行病毒分离、全基因组测序,构建进化树,对该序列进行核苷酸/氨基酸相似性分析。结果 本研究中,分别以登革病毒1型(DENV-1)参考毒株(NC_001477.1)和原型株(EU848545.1)为对照,Weifang 2019核苷酸基因组的全序列分别检出94个和95个氨基酸位点突变,其中有57个突变位点一致。其中,3个结构蛋白和7个非结构蛋白均存在突变,蛋白NS5、E和NS1位点突变占比前3位。核苷酸序列和氨基酸序列分析发现Weifang2019与Guangdong 2014(99.5%/99.3%)、Wenzhou 2014(99.6%/99.4%)、Guangdong 2016(99.4%/99.2%)、Henan 2014(99.5%/99.3%)处于同一进化分支,且相似性均大于99%。结论 2019年潍坊地区一株登革病毒Weifang 2019与Guangdong 2014(MN018287.1)、Wenzhou 2014(KR024708.1)、Guangdong 2016(MN018286.1)和Henan 2014(KP686070.1)的遗传距离较近、相似性较高,提示Weifang 2019可能由上述地区毒株遗传进化而来。
- 李东英霍锡元孙玉红聂清张作栋刘淑慧
- 关键词：登革热
- 2017年潍坊市手足口病实验室确诊病例EV-A71流行病学特点分析被引量：2
- 2019年
- 目的了解潍坊市2017年由肠道病毒A组71型(EV-A71)引起的手足口病的流行病学特征,为EV-A71型手足口的重点防控提供依据。方法采用实时荧光定量PCR方法对潍坊16县(市、区)上送的手足口病患者粪便进行筛查,从发病人群,时间,空间分布等对EV-A71型手足口病的结果进行分析。结果 2017年度实验室经RT-PCR共检测EV-A71阳性数108例,发病人群,时间,空间分布结果显示手足口病主要的发病季节为夏秋季;多发于4岁以下儿童;男性发病高于女性其比值为1.45∶1;散居儿童是主要的发病人群;发病区域以西部居多。结论针对手足口病发病具有季节性、人群和空间分布性的特点,制定相应的宣传措施,尤其是加大高发年龄组散居幼儿家庭的宣传力度,以便更好地控制EV-A71的感染,降低发病率。
- 刘德辉李春苗张凤娟田蒙蒙聂清
- 关键词：手足口病流行病学特点
- 香菇多糖预处理对急性弓形虫感染小鼠中枢神经系统损伤的保护性作用研究被引量：3
- 2022年
- 目的探究香菇多糖预处理对急性弓形虫感染小鼠脑中枢神经系统的保护性作用。方法将C57BL/6小鼠随机分为对照组(NC)、模型组(TDI)和香菇多糖预处理组(pre-10dLNT TDI)。弓形虫感染前10d,pre-10dLNT组小鼠连续10d腹腔注射LNT(1mg/kg体重,1次/d),弓形虫感染后无任何处理;TDI组小鼠腹腔注射弓形虫悬液0.5 mL/只鼠;NC组小鼠感染前10d开始腹腔注射同等体积的生理盐水(1次/d)。通过观察小鼠的死亡时间及数量计算各组小鼠的存活率,使用流式细胞仪检测感染后第8d小鼠脑组织中CD8+IFN-γ+T细胞百分比,ELISA法检测感染后第4d和第8d小鼠外周血中IFN-γ、GABA和DA水平,应用SoftMax Pro 4.3.1LS软件绘制标准曲线计算各项指标的含量(pg/ml)。采用Grapad 8.0软件进行处理和分析。结果TDI组小鼠第8d存活率为0%,pre-10dLNT TDI组小鼠第8d存活率为60%;与NC组相比,TDI组和pre-10dLNT TDI组CD8+IFN-γ+T细胞亚群水平均明显增高;与TDI组小鼠相比,pre-10dLNT预处理明显降低了弓形虫感染的C57BL/6J小鼠脑组织中CD8+IFN-γ+细胞数量(P<0.01)、明显降低了小鼠第4d和8d的外周血中IFN-γ产生水平(P<0.05;P<0.01)、第8d小鼠外周血中DA和GABA的产生水平显著增加(P<0.01)。结论LNT预处理可以显著提高急性弓形虫感染小鼠的存活率,通过减少CD8+T细胞通过血脑屏障进入CNS,降低神经系统的广泛炎症反应,通过降低脑组织中CD8+IFN-γ+T细胞数量,调节神经递质的分泌水平,从而改善小鼠脑部的炎症反应,对急性弓形虫小鼠中枢神经系统的损伤具有明显的保护作用。
- 陈莹莹管益涛王霞聂清刘海涛
- 关键词：弓形虫香菇多糖中枢神经系统损伤
- 潍坊市2013年麻疹疑似病例血清学检测分析
- 2014年
- 目的通过实验室检查数据分析,了解具体因素对麻疹抗体阳性率的影响,评价麻疹的检测结果。方法 2013年全市各区县送检疑似麻疹患者的血清131份,采用酶联免疫吸附法对送检疑似患者血清进行麻疹IgM抗体检测。结果1 3 1个样本中检出麻疹I g M阳性样本有4 6例,阳性率为3 5.1 1%。>2 0岁年龄组的麻疹诊出率最高,性别差异对检测结果的影响无显著性差异,城乡对检测结果的影响有显著性差异,3 d内送检阳性检出率高。结论加强检测,做好疫苗免疫工作,提高疫苗覆盖率。
- 徐静聂清
- 关键词：麻疹IGM抗体血清学监测
- 登革Ⅱ型病毒Tr1751株E蛋白基因的克隆与表达载体的构建
- 2014年
- 目的从登革Ⅱ病毒Tr1751株中克隆表达E蛋白的基因,构建了真核表达质粒,为其后继的关于结构和功能的研究提供了条件。方法合成DEN2(Tr1751株)的E蛋白基因引物,通过RT-PCR的方法扩增含有信号肽E蛋白的基因片段,并与真核载体p IRES-hr GFP-1α连接,得到重组的质粒p IRES-hr GFP-1α-E,再用PCR、双酶切和测序的方法进行鉴定。结果 RT-PCR得到的为1 527bp的E蛋白基因片段,酶切鉴定和测序显示重组的质粒含有DEN2病毒中的E蛋白的基因。用重组质粒测序后与Gen Bank中的已知Tr1751株进行相似性比对,核苷酸序列和推导的氨基酸序列同源性均为99%。结论成功的构建出含有全长DEN2的E蛋白基因的真核质粒,为登革病毒核酸疫苗的研究奠定了基础。
- 李东英刘德辉聂清孙玉红王晓倩
- 关键词：E蛋白克隆
