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王文平
作品数:
9
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供职机构:
中国科学院计算技术研究所
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相关领域:
自动化与计算机技术
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合作作者
王乐珩
中国科学院计算技术研究所
迟浩
中国科学院计算技术研究所
贺思敏
中国科学院计算技术研究所
付岩
中国科学院计算技术研究所
孙瑞祥
中国科学院计算技术研究所
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2012
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2010
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统,其中该方法包括:步骤1,用并行处理方法,对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列,对肽序列进行排序、去冗余处理,以创建肽索引文件块;步骤2,对质谱谱图进行排序,并将...
王乐珩
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付岩
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贺思敏
文献传递
一种规模化蛋白质鉴定中的索引加速方法及相应的系统
本发明提供一种规模化蛋白质鉴定中的索引加速方法,包括:为肽序列设定质量区间;为计数窗口设定大小,并结合质量区间设定计数窗口的数目以及各个计数窗口的范围;对蛋白质数据库做模拟酶切,根据模拟酶切所得到的肽序列的质量计算肽序列...
李由
李德泉
王乐珩
迟浩
王海鹏
付岩
孙瑞祥
贺思敏
刘超
袁作飞
王文平
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统,该方法包括:步骤1,用并行处理方法,对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列,对肽序列进行排序、去冗余处理,以创建肽索引文件块;步骤2,用并行处理方法,对质谱谱图进...
王乐珩
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一种规模化蛋白质鉴定中的索引加速方法及相应的系统
本发明提供一种规模化蛋白质鉴定中的索引加速方法,包括:为肽序列设定质量区间;为计数窗口设定大小,并结合质量区间设定计数窗口的数目以及各个计数窗口的范围;对蛋白质数据库做模拟酶切,根据模拟酶切所得到的肽序列的质量计算肽序列...
李由
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统,该方法包括:步骤1,用并行处理方法,对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列,对肽序列进行排序、去冗余处理,以创建肽索引文件块;步骤2,用并行处理方法,对质谱谱图进...
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统,其中该方法包括:步骤1,用并行处理方法,对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列,对肽序列进行排序、去冗余处理,以创建肽索引文件块;步骤2,对质谱谱图进行排序,并将...
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pFind蛋白质鉴定搜索引擎的千核并行加速
王乐珩
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统,其中该方法包括:步骤1,对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列,对肽序列进行排序、去冗余处理,以创建肽索引文件块;步骤2,用并行处理方法,对质谱谱图进行排序,并将...
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统,其中该方法包括:步骤1,对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列,对肽序列进行排序、去冗余处理,以创建肽索引文件块;步骤2,用并行处理方法,对质谱谱图进行排序,并将...
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