杨雅冉 作品数:28 被引量:50 H指数:4 供职机构: 中国科学院北京基因组研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 北京市自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 政治法律 更多>>
表观遗传学在法医学中的应用研究进展 被引量:3 2012年 表观遗传学指DNA序列无变化的、可遗传的基因表达改变,主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、基因组印记、X染色体失活以及非编码RNA调控等方面。随着研究的深入,表观遗传学逐渐在法医学实践常遇到的特殊问题中发挥作用,如妊娠期胎儿父权的认定、单亲鉴定中亲代必需等位基因的确定、同卵双生子的区分、微量组织来源确定及伪造DNA的鉴定等。本文介绍了表观遗传学的基本概念、研究内容,并对表观遗传学在亲权鉴定、年龄推断、双生子鉴别及组织来源鉴定和死亡时间推断等方面的最新进展进行综述。 杨雅冉 王鹏翔 方向东 严江伟关键词:法医遗传学 表观遗传学 一种基于ZNA引物的STR分型试剂盒 本发明属于法医DNA检验分析领域,具体涉及一种用于微量降解生物样本的miniSTR分型试剂盒。该试剂盒采用ZNA引物替代传统的DNA引物,同时复合扩增12个miniSTR基因座和一个性别识别基因座:D20S1082、D6... 严江伟 杨雅冉 杨猛 赵晶 陈彤文献传递 miRNA调控恶性黑色素瘤细胞上皮-间充质转化的分子网络及机制 被引量:9 2015年 黑色素瘤是一种极易发生转移的恶性皮肤肿瘤,具有高度的致死性。上皮–间充质细胞转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)在胚胎发育过程中起到非常重要的作用,同时在肿瘤的发生和恶化过程中也扮演着重要的角色。mi RNA具有广谱的调节能力,对于肿瘤发生和EMT形成都能产生不同程度的影响。本文整合黑色素瘤细胞系转录组和mi RNA组测序数据,在转录组数据中筛选得到参与肿瘤EMT过程的基因,通过Mirsystem软件预测并从mi RNA组数据中筛选出与之负相关的11个mi RNA,包括mi R-130a-3p、mi R-130b-3p、mi R-125a-5p、mi R-30a-3p、mi R-195-5p、mi R-345-5p、mi R-509-3-5p、mi R-374a-5p、mi R-509-5p、mi R-148a-3p和mi R-330-3p。经过生物信息学分析mi RNA靶基因富集的分子网络和信号途径,发现了两个与细胞发育和细胞间相互作用密切相关的网络,以及多个参与调控EMT过程的信号通路。对11个mi RNA进行分子生物学验证,发现mi R-195-5p、mi R-130a-3p、mi R-509-5p和mi R-509-3-5p共4个可以调节重要肿瘤基因的mi RNA。本研究运用m RNA和mi RNA两种转录组的测序数据筛选EMT相关mi RNA的方法,为肿瘤多组学数据整合分析提供了新的研究思路,并以期能为肿瘤精准基因组学的发展发挥重要的推进作用。 王冬 李永君 丁楠 王均云 杨琼 杨雅冉 李艳明 方向东 赵华关键词:转录组 基于21个线粒体SNP位点的法医学快速检测试剂盒 本发明提供了一种基于21个线粒体SNP位点的法医学快速检测试剂盒及其在个体识别中的应用。该试剂盒包括:富集引物混合物;单碱基延伸引物混合物;扩增试剂:dNTPs、快速Taq聚合酶;核酸纯化柱;SNaPshot反应混合液;... 严江伟 杨雅冉 杨猛 陈婧文献传递 一种基于高通量测序的10个STR位点的检测试剂盒 本发明属于基因检测领域,具体涉及一种基于高通量测序的10个STR位点的检测试剂盒。该试剂盒可同时扩增的10个基因座,具体为:D1S1656、D3S1358、D5S818、D6S477、D18S535、D19S433、DY... 严江伟 杨猛 杨雅冉 陈婧文献传递 北京汉族群体39个短串联重复序列基因座多态性及其遗传关系 被引量:8 2015年 本文首次对北京地区汉族人群的13个CODIS(Combined DNA index system)和26个非CODIS系统STR基因座的遗传多态性进行了研究,建立了北京地区汉族人群39个STR基因座的群体遗传多态性数据库并对其法医学应用价值进行了评价。39个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡且各基因座之间均不存在连锁现象,个体鉴别力(Power of discrimination,DP)在0.7740-0.9818之间,期望杂合度(Expected heterozygosity,He)在0.6000-0.9350之间,多态性信息含量(Polymorphism information content,PIC)在0.5317-0.9047之间,非父排除率(Power of exclusion,PE)在0.2909-0.8673之间,累积个体鉴别力(Cumulative probability of discrimination,CDP)为0.999999999999999999999999999999999999999964971,累积非父排除率(Cumulative probability of exclusion,CPE)为0.999999999973878。另外,结合已公开报道的国内其他11个群体相应基因座的遗传资料,根据等位基因频率计算遗传距离,构建了系统发生树。本研究可为中国法医DNA数据库和群体遗传学数据库提供重要的基础数据,对北京地区汉族人群开展法医学个体识别、亲权鉴定和遗传学研究具有重要的意义。 阮修艳 王伟妮 杨雅冉 谢兵兵 陈婧 刘雅诚 严江伟关键词:STRS 遗传多态性 基于高通量测序的40个STR等位基因的检测试剂盒 本发明属于基因检测领域,具体涉及一种基于高通量测序STR等位基因检测试剂盒。该试剂盒可同时扩增以下STR基因座,具体为:D1S1656、D2S441、D3S3045、D4S2366、D5S2500、D6S1043、D7S... 严江伟 杨猛 杨雅冉 陈婧 赵晶文献传递 基于高通量测序的38个STR等位基因的检测试剂盒 本发明属于基因检测领域,具体涉及一种基于高通量测序STR等位基因检测试剂盒。该试剂盒可同时扩增以下STR基因座,具体为:D1S1656、D2S411、D3S1358、D4S2366、D5S2500、D6S477、D7S3... 严江伟 杨猛 杨雅冉 陈婧 赵晶一种基于高通量测序的10个STR位点的检测试剂盒 本发明属于基因检测领域,具体涉及一种基于高通量测序的10个STR位点的检测试剂盒。该试剂盒可同时扩增的10个基因座,具体为:D1S1656、D3S1358、D5S818、D6S477、D18S535、D19S433、DY... 严江伟 杨猛 杨雅冉 陈婧文献传递 一种基于ZNA引物的STR分型试剂盒 本发明属于法医DNA检验分析领域,具体涉及一种用于微量降解生物样本的miniSTR分型试剂盒。该试剂盒采用ZNA引物替代传统的DNA引物,同时复合扩增12个miniSTR基因座和一个性别识别基因座:D20S1082、D6... 严江伟 杨雅冉 杨猛 赵晶 陈彤文献传递