李凯
- 作品数：185 被引量：228H指数：8
- 供职机构：东华大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金上海市科学技术委员会资助项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 基于RNA-seq的脂代谢相关基因Tmem176a功能分析
- 2022年
- 探讨在Hepa1-6细胞中过表达、敲低Tmem176a基因对脂质代谢途径的影响。将构建成功的Tmem176a慢病毒过表达载体、siRNA分别转染进Hepa1-6细胞中,将过表达或敲低Tmem176a后的Hepa1-6细胞进行RNA-seq、生物信息学分析、Real-Time PCR验证。与对照组相比,Tmem176a在Hepa1-6细胞中过表达182倍(P<0.05)和敲低0.2倍(P<0.05),OE-Tmem176a相较于OE-Vector差异表达基因共计424个,其中下调基因192个,上调基因共233个;KD-Tmem176a相较于KD-Scramble差异表达基因共计405个,其中下调基因248个,上调基因共157个,部分差异基因富集在脂肪的消化吸收、胆固醇代谢、甘油酯代谢、脂肪酸合成等代谢途径,Real-Time PCR验证部分差异表达的基因,差异基因表达水平的变化趋势与RNAseq一致。RNAseq结果提示Tmem176a基因会影响脂质代谢基因响应。Tmem176a表达水平改变会促进小鼠肝癌Hepa1-6细胞中脂质代谢基因表达水平发生显著变化。
- 崔茂生段维旺李晓宁汤晨李凯周宇荀肖君华
- 关键词：脂质代谢RNA-SEQ
- 两种金小蜂体内Wolbachia的wsp基因分子检测及序列分析被引量：11
- 2006年
- 采用Wolbachia的通用引物及A和B大组特异性引物对蝶蛹金小蜂Pteromaluspuparum和丽蝇蛹集金小蜂Nasoniavitripennis体内Wolbachia的wsp基因进行PCR扩增及序列测定,并对测定的序列进行了同源性比较和基因特征分析。结果表明:蝶蛹金小蜂和丽蝇蛹集金小蜂均被A和B两个大组的Wolbachia复合感染;同种寄生蜂的雌蜂和雄蜂的wsp基因片段序列完全一致。采用通用引物从蝶蛹金小蜂中扩增出Wolbachia的wsp基因片段序列的长度为540bp,属于B大组中Pip组,而从丽蝇蛹集金小蜂中扩增出Wolbachia的wsp基因片段序列的长度为558bp,属于A大组中Uni组。用A-Wolbachia引物从蝶蛹金小蜂和丽蝇蛹集金小蜂中扩增出的wsp基因片段序列长度为548bp,同源性达99.8%;而用B-Wolbachia引物从两者中扩增的两条wsp基因片段序列长度分别为424bp和439bp,同源性达87.5%。
- 王欢李凯刘怀胡萃叶恭银
- 关键词：蝶蛹金小蜂WOLBACHIAWSP基因特征
- 利用慢病毒介导的shRNA在GT1-7细胞中敲低Srsf1及其对GnRH、Kiss1的影响
- 2018年
- 目的:探讨慢病毒介导短发夹RNA(shRNA)敲低丝氨酸/精氨酸富集剪接因子1(Srsf1)基因对小鼠GT1-7细胞中性发育相关基因促性腺激素释放激素(GnRH)、Kiss1的影响。方法:实验分为3组,即空白对照组、阴性对照组及shRNA干扰组。用Srsf1 shRNA慢病毒稳转GT1-7细胞,Real-time PCR和Western blot检测GT1-7细胞中Srsf1在mRNA和蛋白水平的变化,并检测稳转株中GnRH、Kiss1基因的表达情况。结果:慢病毒介导的shRNA成功感染了GT1-7细胞,与空白对照组及阴性对照组相比,shRNA干扰组中Srsf1在mRNA水平降低了45%(P<0.001),在蛋白水平敲低了42%(P<0.05)。在稳定低表达Srsf1的GT1-7细胞中,GnRH、Kiss1基因在mRNA水平也显著降低(P<0.05)。结论:成功的构建了Srsf1基因敲低的细胞株。在GT1-7细胞中敲低Srsf1基因会抑制GnRH、Kiss1基因的表达。
- 陈利李雨李凯周宇荀肖君华
- 一种引导交换介质湍流流动方向的定形机烘箱风道
- 本发明公开了一种引导交换介质湍流流动方向的定形机烘箱风道，包括：风道本体，所述风道本体的一端设有进风口；引流喷嘴，所述引流喷嘴的内部为引流通道，引流喷嘴的一端为连接口，引流喷嘴的另一端为出风口；引流喷嘴设于风道本体的底面...
- 季霞李凯庞静珠闫红霞
- 先天性晚发白内障FVB小鼠突变基因定位及筛选
- 2020年
- 目的以自发突变导致的先天性晚发白内障小鼠为模型,进行遗传方式鉴定和白内障相关基因定位分析。方法首先通过显微镜观察组织切片鉴定白内障病理状态,其次通过构建家系确定先天性晚发白内障在FVB小鼠中的遗传方式,其次利用多重PCR靶向测序进行100只F2代小鼠的全基因组SNP扫描定位,最后利用全外显子测序筛选出候选突变基因。结果组织切片表明自发突变引起为典型白内障性状,全基因组扫描定位显示11号染色体上的rs4228772 SNP位点与白内障表型连锁程度最高;全外显子测序结果进一步表明11号染色体上有三个基因产生了自发突变,分别是Sfi1,Obscn和Ptrh2。结论本研究使用全基因组SNP扫描连锁分析与外显子测序相结合的策略,可在已知参考基因组的物种中快速定位基因突变,结果确定了11号染色体上的三个突变基因为先天性晚发型白内障的候选基因,并以显性方式遗传。该策略亦可应用于其它遗传背景清晰的模式哺乳动物的基因功能研究。
- 庞铂实钱强徐园肖君华周宇荀李凯
- 应用1号染色体替换系小鼠优选血脂QTLs内功能基因
- 2018年
- 目的:利用野生小鼠来源1号染色体替换系B6-Chr1^(SJ)和受体品系C57BL/6J (B6)筛选已知相关数量性状基因座(quantitative trait loci, QTL)内表达差异蛋白编码基因和功能突变基因,再结合人类全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)数据和相关文献优选出候选基因。方法:采用表达谱芯片技术对B6-Chr1^(SJ)和B6进行肝脏基因表达谱检测;运用Transcriptome Analysis Console软件从基因水平进行表达差异分析,鉴定出表达差异蛋白编码基因;运用Ensembl Variant Effect Predictor软件对B6-Chr1^(SJ)小鼠1号染色体上的遗传变异进行功能注释,鉴定功能突变基因;利用小鼠系统遗传学资源数据库,筛选出已鉴定的血脂相关QTLs;利用bedtools中的intersectbed将鉴定的表达差异蛋白编码基因及功能突变基因与已鉴定的QTLs区段进行比较,并结合人类GWAS数据和相关文献优选出血脂相关候选基因。结果:在血脂相关QTLs内,共筛选出34个差异表达蛋白编码基因,分别有32、11和20个位于胆固醇(cholesterol, CHOL)、高密度脂蛋白胆固醇(High-density lipoprotein cholesterol, HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(Low-density lipoprotein cholesterol, LDL-C)相关的QTLs内;共筛选出47个功能突变基因,分别有21、41和14个位于CHOL、HDL-C、LDL-C相关的QTLs内。在上述基因中,共优选出两个候选基因。其中,Marc1在人类GWAS研究中为阳性位点,Soat1已有报道与小鼠血脂代谢有关。结论:Marc1和Soat1可能是引起B6-Chr1^(SJ)血脂异常的功能基因,其中Marc1未明确报道与血脂代谢相关,可作为候选基因进行进一步的功能验证。
- 陆佳涛徐福意胡世贤陈科朱豆豆李凯周宇荀肖君华
- 关键词：GWAS
- 一种双重荧光定量PCR支原体检测试剂盒
- 本发明涉及一种双重荧光定量PCR支原体检测试剂盒。该试剂盒包括PCR混合体系，支原体标准质粒和超纯水，该PCR混合体系包括探针定量PCR混合体系，参考基因标准大肠杆菌基因组，支原体引物及探针和参考基因引物及探针。该检测盒...
- 霍欣洋肖君华赵阿贵周宇荀李凯王斌
- 文献传递
- 基于愿景释意行为视角的绿色创业导向与行动模型研究
- 人类社会与自然环境的关系是一个永恒的话题。新能源业已成为全球的创业热点。新能源企业通过自身的创业活动为社会提供清洁能源、减少温室气体排放和环境污染的同时也实现了明显的经济价值。与传统的创业相比,新能源创业具有明显的特征,...
- 李凯
- 关键词：可持续发展
- 文献传递
- 一种单面96孔易于多孔道移液器取样的离心管架
- 本实用新型提供了一种单面96孔易于多孔道移液器取样的离心管架，其特征在于，包括长方体形的底座，底座的上表面为孔洞排布面，孔洞排布面上设有96个孔洞，所述的96个孔洞沿孔洞排布面的长度方向排列为12列，沿孔洞排布面的宽度方...
- 肖君华陈科徐福义晁天柱周宇荀李凯
- 文献传递
- 一种用于研究Kiss1基因表达调控的报告系统及其构建方法
- 本发明涉及一种用于研究Kiss1基因表达调控的报告系统及其构建方法，所述系统为红色荧光蛋白稳定表达，绿色荧光受Kiss1表达调控元件调控的双荧光Kiss1基因表达调控报告系统。构建方法包括：构建红色荧光蛋白打靶载体Ai9...
- 周宇荀李晓宁王斯佳李文文肖君华李凯
- 文献传递
