廖荷欢
- 作品数:2 被引量:4H指数:2
- 供职机构:中南大学资源加工与生物工程学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 氧化亚铁硫杆菌中铜代谢相关两个基因的差异(英文)被引量:2
- 2009年
- 目的:氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans)在微生物冶金中发挥着重要的作用,研究其铜代谢机理有着十分典型的意义。在A.ferrooxidans全基因组序列数据库中,4个基因被注释与铜代谢相关。其中两个基因,Afe0454和Afe1073目前为止未发现有实验报道。本文旨在研究Afe0454和Afe1073与铜代谢的相关性。方法:通过一系列的方法如实时定量PCR、反转录PCR、序列分析,将基因导入抗铜基因缺陷的大肠杆菌(Escherichia coli)菌株中等,研究了Afe0454和Afe1073。结果:与Afe0454相比,Afe1073的表达对铜压力更敏感;Afe1073作为一个转录子单独转录,而Afe0454与Afe0453一起转录;序列分析显示Afe1073表达一种典型的重金属离子泵P1b1型ATP酶,而Afe0454表达一种未知功能的跨膜蛋白;不像Afe0454,Afe1073能使P1b型ATP酶敲除的大肠杆菌菌株铜抗性提高。结论:单独转录的Afe1073比Afe0454在铜代谢中发挥的作用更加明显。
- 罗焱杰张成桂刘元东吴学玲管昊廖荷欢罗海浪刘学端邱冠周
- 关键词:氧化亚铁硫杆菌铜代谢实时定量PCR
- 氧化亚铁硫杆菌铜代谢基因Afe0329的转录子鉴定及分析被引量:2
- 2008年
- 采用reverse transcriptase PCR技术,研究了嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus fer-rooxidans)标准菌株ATCC23270中铜代谢基因Afe0329的转录子情况;用Vector NTI、Blast、TMHMM Server和PSORTb等软件对此转录子中的各基因做了进一步的生物信息学分析;并用此转录子的引物扩增多种细菌DNA,以鉴定此转录元件在A.ferrooxidans菌株基因组中的普遍性。结果表明基因Afe0329,Afe0330和Afe0331一起转录,处于同一个转录子;基因Afe0329为编码定位于膜上P1b3型ATP酶基因,Afe0330为编码定位于细胞质中的蛋白基因,Afe0330和Afe0331的Blast分析都没有意义的同源性序列;且此转录元件普遍存在于A.ferrooxidans菌株基因组中。
- 罗焱杰廖荷欢张成桂管昊罗海浪刘学端邱冠周
- 关键词:PCR