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GRP78在全长丙肝病毒RNA转染细胞中表达的研究被引量：3: 2008年; 目的用蛋白质组学的方法研究全长丙肝病毒RNA转染细胞的差异表达蛋白,观察差异表达蛋白GRP78的表达变化。方法提取全长丙肝病毒RNA转染Huh-7细胞和未转染Huh-7细胞总蛋白,进行双向凝胶电泳和MALDI-TOF质谱分析,鉴定差异表达蛋白。应用RTQ-PCR检测GRP78的相对表达量。结果经双向凝胶电泳和质谱鉴定,共发现54个差异表达蛋白,其中包括GRP78蛋白。RTQ-PCR检测结果显示,在转染初期GRP78基因转录显著上调,转染24 h的相对表达率是未转染细胞的2.104倍,后随时间推移逐步下调。结论建立了重复性较好、分辨率较高的全长丙肝病毒RNA转染细胞2D图谱。GRP78蛋白的显著差异表达提示GRP78蛋白在丙肝的发生和发展中起一定的作用。; 寻萌赵四海楚雍烈曹春霞安润宋娟徐琨邵明明; 关键词：蛋白质组学丙肝病毒 GRP78

《生物信息学》教学实践探讨被引量：8: 2011年; 从教学实际出发,总结了医学院校《生物信息学》教学实践中的一些体会,探讨了提高学生生物医学信息处理能力的教学模式、教学内容和方法。期望通过《生物信息学》课程的讲授,使学生了解到生物信息学发展的前沿,掌握生物信息学的基本分析方法,最终达到能够在科研中独立应用生物信息学进行分析的目的。; 寻萌陈艳炯杨娥邵明明李薇宋娟楚雍烈; 关键词：生物信息学教学实践教学方式

结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药与embB基因突变的相关性研究被引量：1: 2010年; 目的分析西安地区耐乙胺丁醇(EMB)结核杆菌临床分离株embB基因突变的特点,建立快速检测结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药性的方法。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测104株结核分枝杆菌临床分离株的embB基因。结果以H37Rv标准株为对照,35株药物敏感株的SSCP和RFLP分析结果均与标准株一致,不存在突变;69株耐乙胺丁醇分离株中,39株(56.52%)SSCP泳动与标准株不一致,存在基因异常;19株(27.54%)RFLP分析存在基因异常。结论西安地区结核杆菌临床分离株对乙胺丁醇耐药与embB基因(尤其是306位密码子)突变有关,PCR-SSCP和PCR-RFLP技术可快速、准确地检测结核分枝杆菌对EMB的耐药性。; 李薇薛欣楚雍烈邱奕宋娟郑建武; 关键词：结核分枝杆菌耐药基因突变 EMBB基因

结核分枝杆菌链霉素耐药基因rpsL的检测被引量：3: 2008年; 目的探讨结核分枝杆菌(TB)对链霉素(Sm)耐药的分子机制,建立快速检测结核分枝杆菌Sm耐药性的方法。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测80株结核分枝杆菌临床分离株的rpsL基因。结果以H37Rv标准株为对照,21株敏感株中,1株(4.76%) SSCP和RFLP分析存在rpsL基因异常;59株耐药株中,36株(61.02%)SSCP和RFLP分析存在rpsL基因异常。结论结核分枝杆菌对Sm耐药与rpsL基因突变有关,PCR-SSCP和PCR-RFLP技术可快速、准确地检测结核分枝杆菌对Sm的耐药性。; 邵明明薛欣楚雍烈寻萌宋娟曹春霞邱奕; 关键词：耐药多态性单链构象限制性片段长度

左氧氟沙星对金黄葡萄球菌小RNA表达的影响被引量：3: 2012年; 目的研究左氧氟沙星对金黄葡萄球菌小RNA表达的影响及对细菌生长的作用。方法分别在不同抑菌浓度左氧氟沙星干扰情况下,培养金黄葡萄球菌实验株RN6390和RN1HG001,提取RNA,用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测不同菌株中RNAⅢ、RsaA、RsaE、RsaG、RsaH的含量,比较不同抑菌浓度左氧氟沙星作用下小RNA的表达差异。结果在MH培养液和BH培养液中左氧氟沙星对RN6390和RN1HG001的MIC均为0.25μg/ml。5种小RNA中,RNAⅢ的表达量最多,RsaG最少;当左氧氟沙星浓度≥1/4MIC时,开始对金黄葡萄球菌的生长产生明显抑制作用,5种小RNA的表达均开始下降;在RN6390菌株,1/16 MIC和1/8 MIC的左氧氟沙星能促进RsaH表达。结论不同浓度左氧氟沙星对金黄葡萄球菌小RNA表达具有抑制或者促进作用,提示除了其本身具有的阻碍细菌DNA合成的功能外还可能影响细菌基因的转录。; 宋娟楚雍烈; 关键词：金黄葡萄球菌左氧氟沙星小RNA QRT-PCR

HCV全基因组培养细胞的比较蛋白组学研究被引量：3: 2008年; 利用比较蛋白质组技术研究了转染丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)全基因组的人肝癌细胞系Huh7细胞模型中蛋白质表达谱的变化,建立了Huh7-HCV的双向凝胶电泳蛋白质表达图谱和数据库.通过双向凝胶电泳分离和图像分析,对表达差异2倍以上蛋白质点进行了胶内酶解和MALDI-TOF MS鉴定.得到包括与细胞骨架蛋白、细胞周期、凋亡和信号转导等相关的14个蛋白质,并且用Western blot验证了热休克蛋白70的蛋白质组研究结果.利用HCV全基因组培养系统,采用蛋白质组学技术,为研究HCV病毒和宿主细胞相互作用提供了新的实验数据,为深入研究HCV病毒复制和分子致病机理奠定了基础.; 赵四海寻萌楚雍烈朱彤薛欣徐琨宋娟邵明明; 关键词：培养细胞丙型肝炎病毒蛋白质组学

金黄色葡萄球菌基因调节系统研究进展被引量：3: 2012年; 金黄色葡萄球菌是人类的一种重要病原菌,可以引起许多临床表现不同的感染性疾病。它所致感染的多样性和严重度取决于不同毒力因子的协同表达,而这些数量众多的毒力因子的表达会受到不同调节系统的控制,同时这些调节系统之间也存在着复杂的相互作用关系。这些基因调节系统主要有两大类:一类是双组分信号转导系统(如Agr、SaeRS、SrrAB、ArlSR、LytRS、WalKR);另一类是转录因子(如Sar、Rot、MgrA、SigmaB)。它们的协同作用有助于金黄色葡萄球菌对外界环境信号做出反应,调节致病过程中毒力因子在不同情况下的表达。; 宋娟楚雍烈; 关键词：金黄色葡萄球菌基因调节转录因子

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宋娟