刘文献
- 作品数：64 被引量：167H指数：9
- 供职机构：兰州大学更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学更多>>
- 大豆和百脉根古老原核基因的全基因组鉴定与比较分析被引量：2
- 2018年
- 在漫长的进化过程中,高等真核生物从原核生物中获取了大量基因,对这些基因进行鉴定分析,可为研究高等植物系统演化及基因组水平比较分析提供理论依据。为了进一步解析大豆和百脉根古老原核基因在其基因组中所起的作用及进化关系,本研究利用生物信息学技术对大豆和百脉根基因组古老原核基因进行全基因组鉴定,并对其特征及功能进行了比较分析。研究结果表明,大豆(40.6%)古老原核基因的占比高于百脉根(33.9%),且多分布于内共生细胞器线粒体、叶绿体中。此外,古老原核蛋白质的结构域在大豆和百脉根基因组中的分布相似,表明其在大豆和百脉根进化过程中具有较高的共线性和保守性。通过GO注释发现大豆与百脉根中古老原核蛋白主要分布在膜系统、细胞、细胞组分中。在分子功能上,大豆古老原核蛋白更多地参与代谢和发育过程,这可能与其接受了更多的人为选育有关。在生物过程中,古老原核蛋白更多参与催化反应和结合反应,主要以酶的形式在发挥作用。通过比较分析,本研究揭示了古老原核蛋白在大豆和百脉根中进化的独特模式,可为其他豆科植物基因组分析提供一定理论基础。
- 韦兴燚李昱刘文献金小煜闵学阳张正社Ndayambaza Boniface王彦荣
- 关键词：大豆百脉根进化
- 重要牧草组学数据图形可视化展示工具的构建及应用被引量：2
- 2024年
- 随着高通量测序技术的快速发展,多种牧草的基因组和转录组的测序数据相继公布,生物科学已经进入了后基因组时代;基因组学的研究重心也从基因组的结构转向基因功能的挖掘和验证层次,而基因在不同组织的表达量对基因功能挖掘具有重要指导作用。在先前的研究中,育种科学家经常通过柱状图、表格或普通热图等形式对不同组织间的表达量数据进行展示。但这些展示方法形式较为单一,且结果不够美观,读者难以快速有效地获取相关信息。为了更加直观、美观、全面地展示组学数据,本研究以TBtools软件为基础,以紫花苜蓿、蒺藜苜蓿、羊草、黄花草木樨等10种重要牧草为研究对象,结合Adobe Illustrator绘制的SVG文件,构建了一套牧草组学数据可视化工作流程,并以紫花苜蓿中MsSAP基因的表达模式以及不同逆境胁迫下基因的表达模式等为例,从数据获取、热图绘制以及结果展示等方面进行详细介绍。通过与传统的图形展示方式相比较,结果发现,利用本研究提供的牧草SVG图形文件以及可视化流程对多组学数据进行可视化,科研人员能够更快速、高效、美观地展示自己的多组学研究结果,从而为后续深入挖掘功能基因及功能验证提供指导。
- 陈嘉慧刘文献
- 关键词：牧草育种基因表达图形绘制
- 蒺藜苜蓿microRNA‑SSR分子标记引物及在苜蓿品种鉴定中的应用
- 本发明属于生物技术领域，具体涉及蒺藜苜蓿microRNA‑SSR分子标记引物及在苜蓿品种鉴定中的应用。本发明的检测方法，包括10对引物，本发明可利用较少的引物组合在4h之内完成对供试苜蓿品种与已知苜蓿品种的比对鉴定，具有...
- 刘文献 闵学阳张正社 韦兴燚王彦荣
- 与紫花苜蓿气孔密度相关的分子标记Ms_Chr4_73090327及其应用
- 本发明属于分子标记技术领域，公开了一种与紫花苜蓿气孔密度相关的分子标记Ms_Chr4_73090327及应用。本发明利用GWAS全基因组关联分析结合分子标记开发，对紫花苜蓿气孔密度进行分析，获得了一个与气孔密度紧密连锁的...
- 刘文献陈嘉慧熊聪慧安斐斐曹馨丹冯雅琪隋超
- 一种位于5号染色体与紫花苜蓿产量相关的分子标记及应用
- 本发明属于分子标记技术领域，公开了一种位于5号染色体与紫花苜蓿产量相关的分子标记及应用，扩增所述分子标记的引物对的上游引物序列如SEQ ID NO.1所示，下游引物序列如SEQ ID NO.2所示。所述分子标记位于紫花苜...
- 刘文献陈嘉慧隋超李杭安斐斐
- 位于4号染色体与紫花苜蓿抗旱相关的分子标记及应用
- 本发明提供了一种位于4号染色体与紫花苜蓿抗旱相关的分子标记及应用，属于生物技术领域。插入或缺失片段的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.3所示。用于扩增分子标记的引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1～2所示。本...
- 刘文献隋超刘晓玲刘志鹏
- 紫花苜蓿ILP分子标记引物及在苜蓿品种鉴定中的应用
- 本发明属于生物技术领域，具体涉及紫花苜蓿ILP分子标记引物及在苜蓿品种鉴定中的应用本发明的检测方法，包括36对引物，本发明可利用较少的引物组合在4h之内完成对供试苜蓿品种与已知苜蓿品种的比对鉴定，具有准确、高效、快速、成...
- 刘文献张正社闵学阳韦兴燚王彦荣
- 紫花苜蓿MsASG166基因及在提高植物耐旱中的用途
- 本发明公开了一种紫花苜蓿MsASG166基因及在提高植物耐旱中的用途，本发明首次对紫花苜蓿特有基因进行了鉴定，并对MsASG166响应干旱胁迫的生理和分子功能进行了解析，提供的MsASG166基因及其蛋白定位在细胞膜和细...
- 刘文献 马艺桐 王秋霞刘志鹏
- 一种紫花苜蓿粗蛋白含量鉴定方法、分子标记及应用
- 本发明提供了一种紫花苜蓿粗蛋白含量鉴定方法、分子标记及应用，属于生物技术领域。其中所述InDel分子标记位于紫花苜蓿第8号染色体上，插入或缺失片段的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.3所示。用于扩增所述分子标记的引物...
- 刘文献冯雅琪陈嘉慧隋超刘志鹏
- 白花草木樨MaERF058基因耐旱功能验证
- 2024年
- 干旱是农业生产中最常见的逆境胁迫之一,对植物的生长发育、光合作用、气孔开闭、渗透功能和激素调节等方面都会产生不良影响。白花草木樨在我国北方干旱地区广泛种植,是具有耐旱、耐盐碱、耐贫瘠和粗蛋白含量高等特点的优质牧草。转录因子(TF)作为调控基因表达的重要蛋白分子,可作用于其下游启动子区的特定顺式元件以激活或抑制基因的转录,进而调控植物生长发育及响应逆境。植物ERF转录因子家族基因参与植物对非生物胁迫的抗性,是作物抗逆性改良的理想候选基因。本研究对白花草木樨关键耐旱基因MaERF058进行烟草亚细胞定位分析,发现该基因表达蛋白定位于细胞核。干旱胁迫下,过表达MaERF058的拟南芥长势明显优于野生型。干旱条件下转MaERF058基因白花草木樨毛状根脯氨酸含量较对照显著(P<0.01)增加;丙二醛含量显著(P<0.01)降低;过氧化氢酶活性显著(P<0.05)增加;单胺氧化酶染色(NBT法)结果显示转基因毛状根的活性氧含量低于对照。以上结果表明白花草木樨MaERF058基因编码的转录因子对调控白花草木樨响应干旱胁迫具有积极作用。研究结果为解析白花草木樨耐旱分子机制提供了新思路,同时也能够为加快耐旱牧草分子育种提供优异基因资源。
- 魏娜敬文茂许尔文王荣新赵晶忠马雪娥张吉宇刘文献
- 关键词：白花草木樨ERF转录因子干旱胁迫
