丁小余
- 作品数：144 被引量：1,285H指数：22
- 供职机构：南京师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金江苏省教育厅自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学环境科学与工程更多>>
- 猪基源的肝素粗品及混淆品的AS-PCR及ARMS分子检测被引量：8
- 2008年
- 本文建立了一种简便、准确的鉴别猪基源的肝素粗品及其混淆品的DNA分子鉴定方法。在对家猪、野猪及其他7种动物（均用于加工猪肝素粗品的混淆品）的mtDNA D-loop区进行序列分析的基础上,设计了专门用于鉴别猪基源肝素钠的AS-PCR（allele-specific PCR）引物及ARMS（amplification refractory mutation system）引物,对家猪、野猪及其他7种动物来源的肝素、肌肉或血液共49个样品的基源进行了分子检测。结果表明：AS-PCR及ARMS方法均可用于猪基源肝素粗品的快速鉴别。AS-PCR鉴别时的复性温度为54~56℃,ARMS引物鉴别时的复性温度更宽,为52~58℃。在用两种引物对肝素样品进行鉴别时,仅猪来源的肝素DNA模板能扩增得到约170 bp的扩增条带,而其他动物来源的肝素DNA模板在同样条件下无扩增产物。
- 于智勇丁鸽丁小余褚必海钱亮顾笋
- 关键词：AS-PCRARMS分子鉴别
- 曲茎石斛及其近似种鉴别的形态和DNA分子证据被引量：45
- 2001年
- 目的 探讨曲茎石斛 (南阳居群 )与同属近似种 :细茎石斛 (南阳居群 )、霍山石斛 (霍山居群 )、铁皮石斛(天台居群 )药材鉴别的形态及DNA分子证据。方法 对曲茎石斛 (南阳居群 )及其近似种的药材进行了外部形态和rDNAITS序列比较。结果 曲茎石斛及其近似种药材的外部形态虽无明显区别 ,但在rDNAITS序列上却存在着显著而稳定的差异。曲茎石斛 (南阳居群 )与铁皮石斛 (天台居群 )的rDNAITS序列的差异最小 ,绝对遗传距离为 7;但与细茎石斛 (南阳居群 )及霍山石斛 (霍山居群 )rDNAITS区的差异较大 ,绝对遗传距离分别为 4 0和 4 2。在rDNAITS区域中 ,作者共挑选了 7个碱基位点用作鉴别曲茎石斛 (南阳居群 )及其近似种的DNA证据。结论 根据药材的形态特征及rDNAITS区碱基序列差异 ,可准确鉴别曲茎石斛及其近似种药材。
- 丁小余徐珞珊徐红王峥涛周开亚
- 关键词：曲茎石斛霍山石斛形态学特征中药鉴别
- 中药黄草石斛rDNA ITS序列分析被引量：85
- 2001年
- 目的 研究黄草石斛ITS片段遗传多样性 ,分析该片段在黄草药材DNA分子鉴别和石斛属植物系统学研究中的意义。方法 用一对引物进行PCR扩增 ,扩增产物纯化后用双脱氧终止法 (Sangerdideoxy)测序。结果 获得核糖体DNA中ITS和 5 8SrDNA完整序列 ,14个石斛类群的ITS 1与ITS 2序列的长度分别为 2 2 8- 2 33bp和 2 42 -2 47bp。石斛种间ITS 1序列的差异百分率为 11 79% - 31 5 8% ,ITS 2序列的差异百分率为 10 2 9% - 2 5 30 % ,金钗石斛种内ITS 1序列的差异百分率为 0 87% ,ITS 2序列无差异。石斛各类群与外类群的差异百分率ITS 1序列为2 3 5 6 % - 36 89% ,ITS 2序列为 2 6 5 2 % - 33 31%。用NJ法根据ITS 1与ITS 2序列数据重建系统发生树。结论 两段序列在石斛种内保守 ,在种间有较大的差异 ,与外类群的差异最大 ,可作为中药黄草石斛分子鉴定的标记 。
- 徐红李晓波丁小余王峥涛徐珞珊周开亚
- 关键词：石斛属ITS序列
- 齿瓣石斛的位点特异性PCR鉴别被引量：47
- 2002年
- 目的 设计出齿瓣石斛的位点特异性鉴别引物 ,仅通过PCR就能完成对齿瓣石斛真伪进行准确鉴别。方法 根据齿瓣石斛及其他枫斗类、黄草类石斛的rDNAITS序列数据库 ,设计了齿瓣石斛的位点特异性PCR鉴别引物JB Chiban 0 1S和JB Chiban 0 1X。然后 ,对 38种石斛属植物模板DNA进行了PCR扩增 ,阳性者即为齿瓣石斛正品。结果 当退火温度设定为 5 8℃时 ,只有齿瓣石斛的模板DNA能被扩增出来 ,而其他的 37种石斛属植物均为阴性。该鉴别反应重复性好 ,已在鉴别齿瓣石斛时发挥重要作用。结论 运用位点特异性鉴别引物能成功地对齿瓣石斛进行PCR鉴别 ,与DNA测序鉴别方法相比 ,位点特异性PCR具有高效、准确、简便、省时等优点。
- 丁小余徐珞珊王峥涛徐红周开亚
- 关键词：齿瓣石斛位点特异性PCR
- 汞、镉复合污染对金鱼藻的影响及其抗性机制的探讨被引量：42
- 2002年
- 研究了金鱼藻在不同浓度 Hg2 +、Cd2 +以及 Hg2 +、Cd2 +共同胁迫下叶绿素含量、叶绿素 a/b值、可溶性蛋白含量、SOD活性和游离脯氨酸含量等的变化。结果表明 :低浓度 Cd2 + (≤ 2 mg.L- 1)对上述指标有激应性反应 ,低浓度 Hg2 + (≤ 0 .5mg.L- 1)对叶绿素含量、叶绿素 a/b值、可溶性蛋白含量、SOD活性也有激应性反应 ;可以认为这是植物的一种保护性机制。但随着 H2 +、Cd2 +处理浓度增大 ,上述生理指标呈下降趋势 ,表明植物细胞遭受伤害。Hg2 + 、Cd2 + 共同胁迫下上述生理指标下降幅度明显增大 ,表现为协同作用。
- 常福辰施国新吴国荣丁小余解凯彬陆长梅
- 关键词：汞镉复合污染金鱼藻抗性机制毒害
- 叶绿体基因组在药用植物基因工程及系统进化研究中的应用
- 作为药用植物细胞器的重要组成部分和光合作用的器官,叶绿体在生物进化的漫长历史中发挥了重要作用,叶绿体基因组结构和序列分析则是分析系统进化、进行叶绿体基因工程的基石。伴随着生物技术的深入发展,发现叶绿体基因组结构和序列的信...
- 丁小余侯北伟
- 关键词：植物叶绿体基因组系统进化基因工程
- 文献传递
- 泽泻ISSR反应体系的建立与优化被引量：20
- 2006年
- 以四川泽泻为实验试材，采用改进的CTAB法提取了泽泻的高质量总DNA模板，克服了泽泻中所富含的酚类物质的影响．对泽泻ISSR反应体系中各个主要影响因子进行了优化和筛选，建立了标记位点清晰、稳定、重复性好、可用于泽泻ISSR-PCR分析的最适反应体系，它们是：25μLPCR反应体系中，10×Taq酶配套缓冲液，IUTaqDNA聚合酶，1．8～2．0mmol／L MgCl2，100μmol／LdNTP，0．3μmol／L引物，DNA模板约10-20ng，退火温度在52-60％；
- 贺佳丁小余褚必海刘冬扬丁鸽
- 关键词：泽泻ISSR反应体系
- 物种特异性PCR在中药材白花蛇舌草鉴定中的应用(英文)被引量：2
- 2006年
- 提供中药材白花蛇舌草物种特异性鉴定引物以及建立简便、高效的特异性鉴定方法和研制鉴定试剂盒.为此收集目前市场上出现的所有白花蛇舌草正伪品样品共9种,并测定所有样品的核糖体基因ITS区核苷酸序列,在此基础上设计一对物种特异性引物B174和B53,特异性地鉴定白花蛇舌草.表明用这对引物扩增白花蛇舌草,获得207 bp的特异性产物,而其它伪混品样品没有阳性产物.可以认为用白花蛇舌草特异性鉴定引物B174和B53的所配制的鉴定试剂盒具有很好的应用前景.
- 刘忠权丁小余丁秉中
- 关键词：白花蛇舌草
- 铁皮石斛野生居群遗传多样性的RAPD分析与鉴别被引量：85
- 2005年
- 目的采用RAPD分子标记技术,对铁皮石斛8个野生居群的遗传多样性、亲缘关系以及分子鉴别等进行研究.方法筛选随机引物进行RAPD分析,通过UPGMA聚类,研究铁皮石斛各居群间的遗传关系,构建居群亲缘关系的分子系统树;利用特异性条带对铁皮石斛野生居群进行指纹分析鉴别.结果共筛选出10个有效引物,在8个野生居群材料的RAPD扩增中共得到439个位点,平均每个引物扩增出43.9个位点,每个居群扩增出54.9个位点;在所获得的104条可重现谱带中,9条是单态的,95条是多态的,多态性程度达91.35%,遗传距离在0.590～0.727之间,平均为0.686.结论铁皮石斛居群间遗传差异明显,具有较丰富的遗传多样性;RAPD可以作为铁皮石斛野生居群遗传多态性、居群亲缘关系和分子鉴别研究的有效手段;引物S412可以有效鉴别铁皮石斛的8个野生居群.
- 丁鸽丁小余沈洁唐凤刘冬扬贺佳李雪霞褚必海
- 关键词：铁皮石斛居群RAPD
- 一种利用叶绿体全基因组精准鉴别铁皮石斛及其近缘极易混淆种的方法
- 本发明公开了一种利用叶绿体全基因组序列精准鉴别铁皮石斛及其近缘极易混淆种的方法，该方法包括以下步骤：DNA提取和测序；叶绿体基因组拼接；叶绿体全基因组序列比对和构树；结果判定。本发明的方法针对利用常规方法难以鉴别铁皮石斛...
- 丁小余朱淑颖牛志韬
- 文献传递
