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PRL、PRLR基因在白色杜洛克×二花脸资源群体中遗传变异及其与产仔数关联性分析: ＜正＞引言催乳素（Prolactin,PRL）是由垂体前叶催乳素细胞合成和分泌的一种蛋白质激素,广泛作用于动物的性腺和乳腺,在家畜繁殖过程中起非常重要的作用。猪催乳素基因定位于7p1.1-1.2,位于我们此前在白色杜洛克...; 陈从英朱万成郭源梅黄路生; 关键词：产仔性状; 文献传递

FosB基因在白色杜洛克×二花脸资源家系中的遗传变异及其与分娩母猪母性行为的相关性被引量：3: 2008年; 本研究根据FBJ骨肉瘤原癌基因同源物B(FosB)在动物母性行为发生过程中的重要作用,选择其作为影响母猪母性行为的候选基因,以白色杜洛克×二花脸F2资源群体为材料,分析了FosB基因在此群体中的遗传变异及其与分娩母猪母性行为的相关性。采用PCR产物直接测序法搜寻了FosB基因4888、06 bp 2个片段的单核苷酸多态位点(SNPs),鉴别到FosB-EU163403-g.187A>T,FosB-EU163403-g.188A>C和FosB-EU163403-g.297C>G 3个SNPs。采用PCR-MbiI-RFLP法分析了G297C位点在资源群体中的多态及与母猪母性行为的相关性。传递不平衡检测(TDT)表明该多态位点与母猪杀婴行为、衔草做窝、哺乳、踩仔猪、压仔猪等母性行为均无显著相关性(P>0.364)。FBAT分析结果也证实了这一点(P>0.236)。考虑到母性行为属于复杂性状,可能由微效多基因控制,因此有必要在更大规模群体进行分析或搜寻其他候选基因的突变位点。; 杨竹青陈从英任军郭源梅杨广成麻骏武高军; 关键词：母性行为

利用高密度SNP对猪血糖和糖基化血清蛋白性状的全基因组关联分析被引量：2: 2014年; 【目的】测定苏太猪和白色杜洛克×二花脸F2资源家系240 d血糖(glucose,GLU)和糖基化血清蛋白(glycosylated serum proteins,GSP)浓度,采用全基因组关联分析定位影响GLU和GSP的染色体位点,为最终鉴别影响该性状的因果基因奠定基础,同时为人类低血糖症和糖尿病的遗传学研究提供参考。【方法】分别将435头苏太猪和760头白色杜洛克×二花脸F2资源家系F2个体在相同条件下饲养至240日龄进行统一屠宰,收集血液后分离血清,利用全自动生化分析仪测定GLU和GSP浓度。采集猪只耳组织提取DNA并测定DNA浓度。将质检合格的DNA样品利用Illumina porcine 60K SNP芯片判定基因型。运用PLINK软件对SNP判型结果进行质控,将合格的SNP标记用于后续的关联性分析,利用广义混合线性模型及R语言GenABEL软件包进行全基因组关联分析,定位影响苏太猪和白色杜洛克×二花脸F2资源家系240 d血清GLU和GSP含量的染色体位点。根据全基因组关联分析结果从Ensembl或NCBI网站上分析可能的位置候选基因。【结果】全基因组关联分析共检测到5个与血清GLU和GSP达染色体显著水平相关的SNP位点。其中白色杜洛克×二花脸F2资源群体在10号染色体(SSC10)24.67Mb处定位到与血清GSP含量显著相关的SNP(ALGA0057739,P=1.58×10-5),解释表型变异为3.72%。苏太猪群体共检测到2个与血清GSP显著相关的SNP(ALGA0108699和DRGA0017552,P=1.45×10-5),解释表型变异均为3.72%。使用猪参考基因组序列(10.2版本),无法定位到具体的染色体位置。通过人、猪比较基因组分析,这两个SNP都位于SSC8,距STPG2基因3’端约180.0—193.0 kb。将两个群体进行Meta分析,未发现新的与GSP显著相关的SNP;在1号染色体250.32Mb处(DRGA0002016,P=2.48×10-5)和14号染色体43.97Mb处(ASGA0062984,P=1.29×10-5),定位到与血清GLU显著相关的SNP。通过搜寻显著相关SNP所在染色体区域内的注释基因,发现ASPM、TRPM3和KC; 曾治君刘晨龙杨慧杨斌杨竹青陈从英; 关键词：血糖全基因组关联分析

莱芜猪种质资源特性研究——脂肪沉积性状: 2015年; 莱芜猪是我国优良的地方猪种,具有肉质好、繁殖力高、脂肪沉积能力强等优良种质特性。本试验选取了333头纯种莱芜去势公猪与母猪,在300日龄进行屠宰,测定了不同部位背膘厚、花油质量、腹脂质量、板油质量等脂肪沉积性状指标。通过对不同指标测定所得数据按不同性别和不同屠宰季节进行分类,利用SPSS的数据分析功能统计分析出性别效应和屠宰季节效应对莱芜猪脂肪沉积性状的影响。此外,将莱芜猪脂肪沉积性状的相关数据与苏太猪、杜长大进行对比分析。分析结果表明：（1）去势公猪与母猪在不同部位背膘厚、花油质量、板油质量均具有极显著性差异（P〈0.01）,腹脂质量差异不显著（P〉0.05）。（2）冬季屠宰与夏季屠宰的猪在不同部位背膘厚、花油质量、板油质量均具有极显著性差异（P〈0.01）,但腹脂质量差异不显著（P〉0.05）。（3）莱芜猪与二花脸猪、杜长大在脂肪沉积性状方面具有极显著性差异（P〈0.01）。从以上分析结果可以看出性别效应和屠宰季节效应对莱芜猪的脂肪沉积性状均有极显著性影响,这对莱芜猪育肥猪的选择以及饲养育肥周期的确定具有一定的指导意义。; 方绍明张震季久秀周礼渝陈从英; 关键词：莱芜猪种质特性

牛早期胚胎性别鉴定PCR反应体系的优化研究被引量：45: 2003年; 根据牛SRY基因序列设计合成2对巢式PCR引物作为性别鉴定引物,根据牛酪蛋白基因序列设计了一对引物作为内标引物建立了牛胚胎性别鉴定的PCR反应体系。同时对常规PCR和巢式PCR在牛早期胚胎性别鉴定中的实用性进行比较。15头公牛、13头母牛的DNA样品检测结果表明:使用巢式PCR公牛可以扩增出205bp的SRY基因片段和403bp的酪蛋白基因片段,母牛只能扩增出403bp的酪蛋白基因片段;而使用常规PCR时公牛扩增出255bp的SRY基因片段和403bp的酪蛋白基因片段,母牛只能扩增出403bp的酪蛋白基因片段,其性别鉴定结果和实际完全一致。由于巢式PCR只需10个细胞就可以在紫外透射分析仪下看到扩增结果,而常规PCR则需要20～30个细胞,所以胚胎性别鉴定时使用巢式PCR效果更好。试验采用巢式PCR鉴定了10个奶牛胚胎的性别,同时还对血清是否会对试验结果产生影响进行了研究。; 陈从英黄路生陈静波任军肖海霞; 关键词：早期胚胎性别鉴定 PCR反应体系巢式PCR SRY基因

ESR1和ESR2基因遗传变异与妇女产后抑郁症的关联性被引量：3: 2014年; 目的:研究雌激素受体基因ESR1和ESR2与产后抑郁症发病的相关性。方法:收集113例产后抑郁产妇的血液并建立了数据库,对雌激素受体基因ESR1和ESR2进行SNP搜寻并与产后抑郁症表型做关联性分析。结果:在ESR1基因第1外显子上发现了SNP rs2077647,在ESR2基因第6外显子上发现了SNP rs1256049,并在113例产妇中对这两个SNP进行基因型判定。用R软件进行关联性分析,ESR1基因与产后抑郁症无明显相关性(P=0.115),ESR2基因与产后抑郁症亦无明显相关性(P=0.152)。结论:ESR1基因和ESR2基因可能都不是引起产后抑郁症的主效基因。; 张秋莲陈从英龚水萍黄淑晖; 关键词：产后抑郁症雌激素受体基因单核苷酸多态性关联性分析

肠道微生物培养的研究进展及应用被引量：1: 2023年; 肠道中栖居着组成复杂、功能多样的微生物群,这些微生物群在宿主免疫、营养吸收、代谢调节等方面发挥着重要作用。随着测序技术的快速发展,肠道微生物研究通过16S rRNA基因测序和宏基因组测序产生了大量的数据,其中许多未组装的序列成为微生物“暗物质”。近年来,不少研究利用多种不同微生物分离培养方法,结合高通量鉴定技术,从人、小鼠、猪肠道中分离了大量的微生物,丰富了菌株资源,为解析微生物“暗物质”以及后续肠道微生物功能和应用研究提供了基础和保障。尽管微生物的可培养性受到多种因素的影响,大部分微生物尚处于“未培养”的状态,但无论是病因研究还是生理和遗传特征的解析都离不开微生物实体资源的获取。肠道微生物的分离培养对微生物研究从关联分析向菌群功能验证、因果机制解析和功能菌株开发的深入研究具有重要意义。本文旨在探讨和综述影响微生物可培养性的因素,总结回顾肠道微生物的培养方法并阐述肠道微生物培养研究的进展,以期为肠道微生物培养研究提供新的视角。; 刘莎陈从英; 关键词：肠道微生物

利用犬170 K高密度SNP芯片检测16个中国地方犬种全基因组拷贝数变异被引量：1: 2017年; 旨在解析中国地方犬全基因组拷贝数变异(CNV)分布情况,为分析CNV对犬表型变异的影响提供前期基础。本研究采集了16个来自中国不同地方犬品种和9头罗威纳犬共计185头犬的血液样品,使用血液DNA提取试剂盒提取DNA,利用犬170KSNP芯片和PennCNV软件对中国地方犬进行全基因组范围内的CNV分析。参照Illumina芯片标准操作流程进行芯片扫描和基因分型。将质控后的SNP参考PennCNV软件使用说明书,设定分析参数进行CNV检测分析。从分析结果中随机挑选8个CNV区间(CNVRs)使用实时定量PCR进行验证。利用BioMart以及DAVID软件进行基因和功能注释分析。结果表明,在185个个体中共发现了477个CNV,这些CNV随机分布在38条常染色体上,合并后可以得到220个CNVR,总长度约占犬整个基因组序列的1.25%,平均长度为142.24kb。在220个CNVR中,115个为缺失,74个为重复,31个为缺失/重复CNVR。此外,笔者发现53个CNVR为潜在的中国地方犬品种特异性CNVR。在基因和功能注释中,本研究共发现162个基因位于所检测到的CNVR内,这些基因主要富集的功能类别是嗅觉受体活动,嗅觉的感知,对化学刺激物的感知,感官知觉和神经系统过程。这些结果解析了中国地方犬基因组结构变异分布情况,将有助于进一步研究CNV与犬表型变异的关联性。; 刘晨龙杨前勇陈浩黄晓畅陈从英; 关键词：拷贝数变异基因组

影响初生重的猪9号染色体上的SNP标记: 本发明提供了影响初生重的猪9号染色体上的SNP标记。所述SNP标记的位点位于如SEQ ID No.1所示的核酸上的从5’端起的301位，对应于11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从5’端起的第103669360位，为...; 黄路生陈从英肖石军宿英张洲杨思雨

细菌在影响动物瘦肉率和/或脂肪含量中的应用: 本发明提供了细菌在影响动物瘦肉率中的应用。其中所述细菌包括具有降低动物瘦肉率功能的普氏菌属中的细菌包括寇氏普氏菌(Prevotella copri)、口颊普雷沃菌(Prevotella buccalis)、中间普雷沃菌(...; 黄路生陈从英方绍明杨慧

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陈从英

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