郭妍
- 作品数:28 被引量:37H指数:3
- 供职机构:上海交通大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市卫生局科研基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学自动化与计算机技术理学更多>>
- 新多肽配体GE11与表皮生长因子受体的结合能力分析被引量:3
- 2008年
- 应用亲和毛细管电泳(ACE)分析方法,对表皮生长因子受体(EGFR)和新多肽配体GE11之间的结合能力进行分析。结果表明,EGFR与多肽配体GE11之间存在特异性相互作用,考察EGFR在不同浓度GE11溶液中的迁移情况,采用非线性、双倒数、Y-倒数和X-倒数4个数据处理方法得到较好的数据拟合,并测得结合常数。该文为筛选多肽配体以及测定受体与多肽配体之间的结合常数提供了简便的方法,将有力推动肿瘤靶向药物输送的研究。
- 郭妍李宗海顾健人徐宇虹
- 关键词:表皮生长因子受体亲和毛细管电泳
- 一种新的双重标记免疫组化图像自动分割方法
- 2013年
- 本文描述一种自动分割双重标记免疫组化图像的方法,此方法直接从双重标记的两种阳性组织细胞着色特征对其进行分离。与常用的彩色反卷积方法相比,此方法提高了分割准确度且需要样品切片的数量从3张减少到1张。通过细胞角蛋白和S-100蛋白双重标记,分别经二氨基联苯胺(DAB)与3-氨基-9-乙基咔唑(AEC)显色的舌鳞癌样品图像的实验证明,此方法可以有效地将鳞癌与神经组织细胞两种不同的染色区域分割出来,与手动分割的结果作比较其准确度和精确度都有较大的提高。此方法也适用于分割其他用DAB和AEC双重染色的免疫组化图像。
- 孟军陆伟王丽珍俞志维郭妍程酩邵志峰季彤李小卫
- 关键词:图像处理图像自动分割
- 一种基于操作者意图校正的人机交互系统及方法
- 本发明涉及一种基于操作者意图校正的人机交互系统及方法,包括机械臂、手术工具、六维力传感器、力传感器和控制器;六维力传感器安装在机械臂末端,手术工具通过固定装置安装在六维力传感器上,力传感器安装在手术工具上;操作者牵引手术...
- 陈晓军郭妍胡俊磊张陈平刘剑楠
- CDX1在胃癌中的表达及临床意义被引量:3
- 2015年
- 目的:研究CDX1在胃癌以及胃炎组织中的表达。方法:应用组织芯片免疫组织化学技术检测CDX1在胃癌以及胃炎组织中的表达。结果:CDX1在胃癌组织的表达率为89%,明显高于癌旁胃炎组织的41%。肿瘤组织中CDX1表达与肿瘤细胞分化程度明显相关,随着肿瘤分化程度的降低,CDX1的表达率增高。CDX1表达也与肿瘤直径相关,随着肿瘤的增大,CDX1的表达阳性率增高。在癌旁组织中,具有慢性胃炎伴肠上皮化生和(或)异型增生的组织中CDX1表达明显上调。结论:胃癌以及胃炎组织中的CDX1表达量升高,表明CDX1在胃上皮分化障碍中起重要的作用。这一发现对于胃癌有了进一步的认识,对癌症的治疗具有提示作用。
- 冯璐李建芳张佳年张保贵胡磊邵志峰郭妍刘炳亚
- 关键词:胃癌胃炎
- 一种新型组织单细胞空间转录组技术
- 本发明提供了一种单细胞空间转录组分析方法。具体地,本发明提供了一种可以检测非解离状态的单细胞空间转录组。本发明的方法可以在保有组织中细胞空间位置信息的基础上,高通量地收集单细胞,通过二代高通量测序,获得高灵敏度、高重复性...
- 郭妍胡苗苗邵志峰
- 一种原位高通量染色质结构定向捕获的方法
- 本发明属于生物技术领域,具体公开了一种高通量染色质结构定向捕获并分析的方法。这是一种在组织切片上获取具有原位空间信息和表型定义的高通量染色体构象捕获(Hi‑C)方法。通过对组织切片预先进行固定、破膜、多步酶反应等关键步骤...
- 刘一心唐颖李鑫辉丹尼尔·恰科夫郭妍程酩邵志峰
- 一种基于混合现实的引导的手术机器人力反馈方法和装置
- 本发明涉及一种基于混合现实的引导的手术机器人力反馈方法和装置,其中方法包括:获取基础图像,并在基础图像中分割出用于机械臂末端手术器械移动的路径区域和禁止机械臂末端手术器械进入的禁止区域,其中所述禁止区域为动态区域;获得交...
- 陈晓军涂朴勋郭妍李东远
- 靶向表皮生长因子受体的全新小分子配体筛选被引量:9
- 2005年
- 肿瘤靶向分子的筛选一直是肿瘤治疗和早期诊断的研究热点. 表皮生长因子受体(EGFR) 在很多肿瘤细胞表面过量表达,是一个理想的药物输送靶点. 选择了EGFR表面不同于表皮生长因子(EGF) 结合位点的一个凹陷部位作为计算机模拟筛选的结合位点,然后使用DOCK软件包对DTP-Plated有机小分子数据库进行了两遍筛选,最后选择了7个有机小分子作为可能的靶向分子. BIAcore体外结合实验对所选择的小分子样品进行了进一步的验证,结果表明,小分子NSC51186能特异地与EGFR结合. 小分子NSC51186和EGFR之间的动力学常数也得到进一步的测定. 新的靶向分子和药物、纳米粒子或者基因载体相连,将有可能用于靶向于EGFR的肿瘤治疗和诊断.
- 邓宏伟郭妍孙烨徐宇虹
- 关键词:计算机辅助药物设计靶向
- 单细胞转录组技术及其在人类细胞图谱构建中的应用
- 2019年
- 单细胞转录组技术在单细胞水平上进行转录组测序,提供了单个细胞的基因表达差异信息,使在单细胞尺度下研究个体细胞、相关环境细胞及其相互作用的机理成为可能.近年来,单细胞转录组技术在c DNA扩增原理上经历了从末端加尾、体外逆转录到模板置换的方法发展,大大提高了基因检测的数量、基因表达的准确性等.同时,在单细胞选取方式上进行了从96/384孔板到油包水液滴以及纳米微孔的创新,在提高通量和重复性的同时降低了整体实验成本.单细胞转录组技术广泛应用于细胞群体分类和异质性研究,推动了从发育生物学到正常、病态组织细胞图谱的构建.本文对单细胞转录组技术近年的技术进展以及在人类细胞图谱构建中的应用进行了综述.
- 倪健胡苗苗危莹陈蕊郭妍
- 关键词:单细胞转录组
- 空间转录组技术研究进展被引量:6
- 2022年
- 空间转录组技术旨在对细胞的基因表达进行定量测量,同时提供细胞在组织空间的具体位置信息。与传统的转录组技术相比,空间转录组技术能获得细胞在组织生理环境下真实的基因表达特征,以及与微环境的关系,进一步推进对正常和病理状态下细胞特性的理解。近年来,空间转录组技术的发展取得了重要的进展,检测的细胞通量、转录本数量和质量不断提高,空间定位信息更加准确全面。本文总结了四大类不同空间转录组技术的特点和应用,并比较了目前不同空间转录组技术的优缺点。
- 危莹张小丹胡苗苗吴忠琴程酩郭妍
- 关键词:组学技术单细胞