谭丹
- 作品数：21 被引量：46H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家科技部专项基金国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程轻工技术与工程更多>>
- 环洞庭湖区活禽批发市场和水禽场H4亚型禽流感病毒监测
- 2014年
- 调查2009—2013年洞庭湖地区活禽批发市场和水禽场H4亚型禽流感病毒的分布和流行情况,为该地区H4亚型禽流感的防控提供依据。结果显示:各年度均在环洞庭湖区活禽批发市场上分离到H4亚型禽流感病毒,总的分离率为3.14%;水禽场H4亚型禽流感病毒场间阳性率达到8.72%,拭子的H4亚型病毒分离率为1.12%。提示洞庭湖区活禽批发市场和水禽场H4亚型禽流感病毒带毒率比较高。
- 黄建龙谭丹王昌建范仲鑫朱春霞王伟国张朝阳刘道新邓国华
- 关键词：禽流感病毒洞庭湖区
- 湖南洞庭湖区12株H9N2亚型AIV全基因序列的进化分析
- 2016年
- 【目的】从分子生物学角度了解H9N2亚型禽流感病毒在湖南省洞庭湖区的变异特点和进化规律。【方法】对近年来洞庭湖区分离的12株H9N2亚型禽流感毒株的全基因进行分段克隆测序,应用Mega 5软件包对病毒基因进行多序列比对和进化树的绘制与分析。【结果】12株H9N2亚型禽流感毒株HA裂解位点均没有多个连续的碱性氨基酸插入,属于低致病性病毒。12株H9N2亚型禽流感病毒HA、NA基因进化比较同步,均处于DK/HK/Y280/97分支,而6个内部基因(M、PB2、PB1、PA、NA、NS)与高致病性禽流感H5亚型毒株呈现不同程度重组现象,且与H7N9亚型毒株基因的核苷酸同源性很高,很有可能为其提供内部基因。【结论】湖南省洞庭湖地区H9亚型禽流感病毒的遗传演化较为复杂,存在广泛的基因重组现象。
- 黄建龙谭丹王昌建张朝阳何世成朱春霞汪洪冰邓国华刘道新
- 关键词：H9N2亚型禽流感遗传进化洞庭湖区
- H6亚型禽流感病毒一步法RT-PCR检测方法的建立被引量：3
- 2013年
- 为快速检测临床样品中的H6亚型禽流感病毒(AIV),本研究通过分析流感数据库中H6亚型的HA基因,在HA保守区设计一对引物,建立一种用于扩增H6亚型禽流感病毒HA基因的一步法RT-PCR检测方法,扩增片段为327 bp。采用该方法对H6亚型AIV的尿囊液10倍倍比稀释样品进行检测,结果显示最低检出量为102.5EID50/mL。用该方法检测其他亚型AIV和鸡新城疫病毒等病原均为阴性,具有良好的特异性。对H6 AIV人工感染鸡的咽喉、泄殖腔棉拭子样品进行一步法RT-PCR检测,并与病毒分离进行比较,显示该方法对棉拭子的检测极限可达102.5EID50/mL,同时利用该方法及病毒分离对临床样品进行检测,两者检测结果一致。实验结果表明该RT-PCR方法具有较好的特异性、敏感性,可以应用于临床样品的实验室检测。
- 谭丹邓国华施建忠刘道新陈化兰
- 关键词：禽流感病毒一步法RT-PCR
- 一株鸭源H5N2禽流感病毒全基因组序列分析及对鸡的致病性研究被引量：6
- 2013年
- 2012年在我国重庆市活禽交易市场进行流行病学调查时,从鸭体内分离到1株H5N2亚型禽流感病毒(AIV),DK/CQ036/12(H5N2)。为了解该株H5N2亚型AIV的生物学特性,本研究对其进行了全基因组分析及对SPF鸡和BALB/c小鼠的致病性试验。序列分析显示:HA裂解位点序列为341R-----346TRGLF350,为低致病性AIV特征。内部基因来源较复杂,与KD/CQ/036/12分离株的M基因NP基因同源性最高的病毒株均来自H4、H7等亚型分离株,呈明显的异源性。分离株的感染性试验显示,该分离株在鸡体内可以通过呼吸道和消化道向外排毒,但并不能在鸡体内有效的复制。对小鼠的感染性试验结果显示,仅在鼻甲和肺能检测到病毒存在,其他脏器病毒滴定结果为阴性,表明病毒对鸡和小鼠均呈低致病性。
- 朱占松张曦崔鹏飞谭丹关立峥李文辉邓国华陈化兰
- 关键词：禽流感病毒H5亚型基因组分析
- 1株H12N7亚型禽流感病毒全基因组测定及遗传演化分析被引量：1
- 2014年
- 2011年冬对湖南环洞庭湖地区散养鸭群进行禽流感病毒(AIV)感染情况调查时从一鸭场环境粪便拭子中分离一株H12N7亚型AIV,命名为A/Environment/Hunan/S4484/2011(H12N7),对其进行全基因序列测定及分析。结果显示该毒株HA基因裂解位点无多个连续的碱性氨基酸(PQAQDR↓GLF),具有低致病性AIV的特征,对其全基因进行遗传进化分析表明8个基因片段来源非常复杂,与周边国家野禽中分离的毒株相似性很高,可能有共同的祖先来源,同时提示该毒株可能是不同亚型禽流感毒株之间基因交换所形成的重组体。
- 谭丹崔鹏飞黄建龙王昌建李文辉范仲鑫张芳何世成唐小明刘道新邓国华
- 关键词：禽流感病毒序列测定与分析
- 两株H4N3禽流感病毒全基因组序列分析及对小鼠的致病性研究被引量：4
- 2012年
- 2009年在我国南方活禽交易市场进行流行病学调查时,从鸭体内分离到2株H4N3亚型禽流感病毒(AIV),DK/FJ/S1419/09(H4N3)(FJ/419/2009)和DK/HUN/S1010/09(H4N3)(HuN/010/2009)。为了解这2株H4N3亚型AIV的生物学特性,本研究对其进行全基因组分析及对小鼠致病性研究。结果显示:其HA基因来源于近两年流行的H4亚型病毒株,NA基因来源于其它亚型病毒株。内部基因来源较复杂,与FJ/419/2009内部基因同源性最高的病毒株均来自国内H5、H6等亚型分离株,但与HuN/010/2009同源的内部基因则差异较大,与PA、M和NS同源性最高的病毒株分别为A/wild/duck/Korea/UP122/2007(H1N1),A/muscovy/duck/Thailand/CU-LM1983/2009(H4N6)and A/avian/Japan 8KI0068/2008(H3N6)。用106EID50病毒剂量感染6周龄BALB/c小鼠,结果显示试验组小鼠感染后第3 d采脏器样品,仅在鼻甲和肺部能检测到病毒存在。以上数据表明,尽管这2株H4N3特殊亚型组合病毒来源复杂,但对小鼠的致病性较低。
- 张文亮张曦朱占松谭丹崔鹏飞施建忠邓国华陈化兰
- 关键词：禽流感病毒基因组分析
- 湖区散养鸭群禽流感病毒感染多态性调查
- 引言洞庭湖与鄱阳湖区域是我国候鸟迁徙的重要栖息地,该区域内鸭群多以高密度、开放式饲养,散养鸭群与候鸟接触频繁,为流感病毒在候鸟与鸭群间的传播提供了便利条件。为了解当前洞庭湖与鄱阳湖地区散养鸭群及其周边活禽市场内禽流感病毒...
- 邓国华彭志崔鹏飞王晶谭丹陈化兰
- 文献传递
- 7株H3亚型禽流感病毒HA基因的遗传演化分析
- 2013年
- 采用RT—PCR技术对近年来洞庭湖区分离的H3亚型禽流感毒株的HA基因进行扩增、克隆和测序，并对所得全序列进行同源性和遗传演化分析。结果显示：本试验分离到的7株H3亚型禽流感病毒的HA裂解位点均没有多个连续的碱性氨基酸插入，属于低致病性病毒；7株H3亚型毒株之间HA基因核苷酸同源性在87．6％～98．4％之间，推导氨基酸序列的同源性在93．7％～99．1％之间；从HA基因遗传演化关系来看，7株病毒毒可分为三大分支，与以往从蒙古、韩国、越南、西伯利亚及我国香港、广西、三江等地分离的H3亚型毒株关系密切，提示其HA基因来源非常复杂。
- 黄建龙邓国华谭丹王昌建朱春霞范仲鑫何世成汪洪冰张菁邱立新鲁杏华刘道新
- 关键词：HA基因同源性
- 3株H3N8亚型禽流感病毒对SPF鸡和Balb/c小鼠致病性研究被引量：3
- 2014年
- 为了解从洞庭湖区鸭子和环境中分离的3株H3N8亚型禽流感病毒的致病性。利用这3株毒株对SPF鸡及Balb／c小鼠进行致病性试验，结果显示，3株毒株均能使鸡感染并排毒，但不引起鸡明显的临床症状及死亡，感染鸡后第3天～第7天在泄殖腔排出高滴度病毒，且持续至第11天（仅观察到该天），与以往的研究相比，排毒时间更长。3株H3N8亚型毒株感染小鼠后，能在小鼠鼻甲及肺脏内高滴度复制，但小鼠的体重变化不明显。结果说明3株H3亚型AIV对家禽及哺乳动物感染能力增强，因此加强该亚型的流行病学监测及致病性的研究非常重要。
- 谭丹关立铮王晶崔鹏飞施建忠黄建龙何世成王昌建刘道新邓国华
- 关键词：SPF鸡BALBC小鼠
- 湖南省洞庭湖区5株H6N6亚型禽流感毒株HA、NA基因的遗传进化分析被引量：3
- 2016年
- 为了从分子生物学角度了解H6N6亚型禽流感病毒在湖南省洞庭湖区的变异特点和进化规律,为该地区H6N6亚型禽流感的防控提供一些理论依据,对2012年在洞庭湖区分离的H6N6亚型禽流感毒株的HA、NA基因进行扩增、克隆和测序,并对所得序列进行同源性和遗传进化分析。结果显示,本试验分离到的5株H6N6亚型禽流感毒株HA裂解位点为PQIETR↓GLF,均没有多个连续的碱性氨基酸插入,属于低致病性病毒;5株病毒的HA和NA潜在的糖基化位点有一些差别,这些差别是否会引起其毒力和致病力上的差异还有待研究;从基因遗传进化关系来看,这些毒株与我国汕头、广西分离的毒株同源性较高。
- 宋跃君谭丹邓国华王昌建朱春霞张朝阳刘道新黄建龙
- 关键词：同源性遗传进化
