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刺五加鲨烯合酶基因cDNA的克隆与序列分析被引量：7: 2012年; 采用改良的异硫氰酸胍法提取刺五加总RNA,逆转录为cDNA,根据已报道的人参鲨烯合酶基因(squalene synthasegene,SS)cDNA序列设计引物,利用RT-PCR法克隆刺五加SS基因的cDNA序列。克隆得到长度为1258 bp的刺五加SS基因cDNA序列,开放阅读框全长1248 bp,编码415个氨基酸残基,GenBank登录号为HQ456918,与人参的SS1、SS2和SS3氨基酸序列一致性分别为91.73%、97.59%和96.63%。首次分离并报道了刺五加SS基因cDNA序列,为刺五加苷生物合成中关键酶的表达分析及调控机理研究提供参考。; 龙月红邢朝斌王明艳吴鹏陈龙梁能松何闪; 关键词：刺五加克隆 RT-PCR

内生真菌对刺五加皂苷合成关键酶基因表达及皂苷含量的影响被引量：17: 2012年; 目的:分析刺五加内生真菌菌株P116-1a,P116-1b,P109-4,P312-1对刺五加中皂苷合成关键酶基因SS(squalenesynthase),SE(squalene epoxidase),bAS(β-amyrin synthase)表达量和皂苷含量的影响。方法:伤口法回接内生真菌。以GAPDH为内参照基因,Real time PCR法检测关键酶基因表达量的变化。分光光度法测定刺五加的总皂苷含量。结果:回接P116-1a和P116-1b 30 d,刺五加SS基因的表达量显著提高(P<0.05),P109-4和P312-1无显著变化,之后出现降低-相等-降低的变化趋势。回接菌株P312-1 30 d,刺五加SE的表达量显著提升(P<0.05),回接菌株P116-1b和P312-1 90 d,SE的表达量分别显著提升至对照的130%,161%(P<0.05)。回接120 d,4个菌株处理的SE表达量均显著高于对照(P<0.05)。各处理bAS的表达量在回接60～120 d时均显著高于对照(P<0.05)。4个菌株均显著提高了刺五加的皂苷含量(P<0.05)。结论:菌株P116-1a,P116-1b,P109-4,P312-1可显著影响刺五加SS,SE,bAS的表达量,进而影响刺五加的皂苷含量,其中bAS为主要靶点基因。; 邢朝斌龙月红劳凤云何闪梁能松李宝财; 关键词：刺五加内生真菌关键酶基因

刺五加Cu/Zn SOD的克隆及内生真菌对其表达的影响被引量：3: 2013年; 利用RACE技术从刺五加(Eleutherococcus senticosus Harms)中克隆到铜锌型超氧化物歧化酶基因(Cu/Zn SOD)的cDNA序列。获得的刺五加Cu/Zn SOD的cDNA长641 bp。基因内部含有1个长度为459 bp的开放阅读框,编码长度为152个氨基酸残基的蛋白质,预测分子质量为15.162 ku,理论等电点为5.29。刺五加Cu/Zn SOD氨基酸序列与其它植物的Cu/Zn SOD具有很高的相似性。相对定量RT-PCR的结果表明,回接内生真菌菌株P116-1a、P116-1b、P109-4和P312-1后可显著提高刺五加Cu/Zn SOD基因的表达量(P<0.05),最大表达量出现在菌株P312-1回接60 d时,达对照的4.99倍。; 邢朝斌龙月红李宝财何闪梁能松朱金丽; 关键词：刺五加铜锌超氧化物歧化酶克隆内生真菌

刺五加ATP合酶β亚基基因的克隆与序列分析被引量：2: 2012年; [目的]克隆刺五加叶绿体的ATP合酶β亚基cDNA并对其进行生物信息学分析。[方法]根据已知物种叶绿体ATP合酶β亚基基因的序列,设计1对同源引物,通过RT-PCR扩增得到刺五加ATP合酶β亚基cDNA,并对其进行序列比对及结构预测分析。[结果]RT-PCR扩增获得了长1 099 bp的刺五加ATP合酶β亚基cDNA,该基因编码366个氨基酸。序列比对及结构预测分析表明,刺五加ATP合酶β亚基基因编码的氨基酸与水稻的同源性最高,达96.41%。其二级结构中含有171个α螺旋(alpha helix),占46.72%;53个延伸链(extended strand),占14.48%;27个β折叠(beta turn),占7.38%;115个无规则蜷曲(random coil),占31.42%。第262～271位氨基酸为ATP合酶β亚基的标志性位点。整个多肽链无明显的疏水区域,初步认定为亲水性蛋白。[结论]该试验克隆得到的ATP合酶β亚基基因为叶绿体ATP合酶β亚基基因,为研究刺五加能量代谢对植物次生代谢的影响及了解植物ATP合酶的结构与功能提供了必要的信息。; 曹蕾邢朝斌陈龙梁能松何闪; 关键词：刺五加克隆

刺五加GAPDH基因的克隆及序列分析被引量：25: 2012年; 目的对刺五加Eleutherococcus senticosus GAPDH基因进行克隆及序列分析,使其成为可用的内参照基因。方法采用改良的异硫氰酸胍法提取刺五加总RNA,运用RT-PCR法克隆GAPDH基因的部分序列,并以其为内参照基因进行半定量PCR。结果克隆了长度为627 bp的刺五加GAPDH基因,推测其编码209个氨基酸,与三七、人参、拟南芥的GAPDH氨基酸序列同源性分别为97%、93%、93%,核苷酸同源性分别为94%、86%、84%。其作为内参照基因的半定量PCR具有良好的扩增效果和重现性。结论首次分离并克隆了刺五加GAPDH cDNA,证实该序列可以作为基因表达分析的内参照基因,为刺五加苷生物合成中关键酶的表达分析及调控机制研究奠定基础。; 邢朝斌吴鹏陈龙梁能松何闪; 关键词：刺五加克隆

刺五加鲨烯合酶基因2 cDNA的克隆与蛋白结构分析被引量：4: 2012年; 采用RT-PCR和RACE法克隆了刺五加鲨烯合酶基因2(squalene synthase gene 2,SS2)cDNA的全长序列(GenBank登录号:JN714465)。该序列全长1 463bp,其中5’端非翻译区长10bp,3’端非翻译区长208bp,开放阅读框长1 245bp,编码414个氨基酸。该蛋白具有1个Trans_IPPS_HH保守区域、2个鲨烯合酶和八氢番茄红素合成酶特异性识别区域及2个跨膜区。氨基酸序列比对结果表明,该蛋白与五加科其它植物SS的一致性均大于90%,与刺五加SS1的一致性为91.79%。; 龙月红邢朝斌梁能松何闪李宝财朱金丽; 关键词：刺五加 RT-PCR RACE

刺五加法尼基焦磷酸合酶基因的克隆、生物信息学及表达分析被引量：23: 2012年; 目的:克隆刺五加的法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,FPS)基因,并对其进行生物信息学和表达分析。方法:采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆刺五加FPS基因的全长cDNA序列。运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构与功能。并通过RT-PCR法检测FPS在不同器官中的表达情况。结果:刺五加FPS基因的cDNA全长为1 499 bp,开放阅读框长1 029 bp,编码342个氨基酸的蛋白,包含2个富含天冬氨酸(DDXXD)的保守功能域。FPS蛋白无跨膜区域,定位于细胞质中。RT-PCR的结果显示,刺五加FPS基因在各器官中均有表达,但表达量具有显著差异(P<0.05)。结论:首次分离并报道了刺五加FPS的cDNA克隆,并证实其在不同器官中的表达量不同,为进一步研究FPS对刺五加皂苷合成的影响和表达调控奠定了基础。; 邢朝斌龙月红何闪梁能松李宝财; 关键词：刺五加克隆

刺五加内生青霉鲨烯合酶基因的克隆与序列分析被引量：1: 2012年; 【目的】克隆刺五加内生青霉Penicillium minioluteum P116-1a的鲨烯合酶(Squalene synthase,SS)基因。【方法】采用cDNA 5末端快速扩增(Rapid Amplification ofcDNA 5 Ends,5 RACE)技术扩增P.minioluteum P116-1a SS基因的全长cDNA序列和DNA序列;运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构与功能;并通过RT-PCR法和SDS-PAGE法检测SS的表达情况。【结果】P.minioluteum P116-1a的SS基因含有4个外显子和3个内含子,开放阅读框长1 416 bp,编码471个氨基酸,预测蛋白含67.73%的α螺旋,5.31%的延伸链,2.97%的β折叠,23.99%的无规则卷曲,含有鲨烯合酶和八氢番茄红素合成酶的特异性识别区域,定位于内质网膜。与P.marneffei和Talaromyces stipitatus中SS蛋白的氨基酸同源性达90%以上。不同温度下SS的表达情况不同。【结论】首次在刺五加内生青霉P.minioluteum P116-1a中克隆到SS基因,为进一步研究P.minioluteum P116-1a提高刺五加皂苷含量的机制奠定基础。; 邢朝斌何闪朱金丽龙月红梁能松李宝财; 关键词：PENICILLIUM 鲨烯合酶

刺五加与其愈伤组织中皂苷合成关键酶基因表达的差异分析被引量：2: 2012年; 目的:分析刺五加叶片、叶柄及其愈伤组织中SS、SE和bAS基因表达量的差异。方法:以刺五加叶片和叶柄为外植体,诱导获得愈伤组织。实时荧光定量PCR检测SS、SE和bAS基因的表达量。结果:刺五加SS、SE和bAS基因在刺五加叶片、叶柄及其愈伤组织中都有表达,SS、SE和bAS基因在叶片愈伤组织中的表达量分别为叶片中的89.3%、73.8%和83.4%,在叶柄愈伤组织中的表达量分别为叶柄中表达量的80.2%、87.7%和70.9%。结论:刺五加愈伤组织中SS、SE和bAS基因的表达量显著低于植株中的表达量。; 邢朝斌吴鹏龙月红何闪梁能松; 关键词：刺五加愈伤组织实时荧光定量PCR

Cloning and Sequence Analysis of ATPase Beta Subunit Gene from Eleutherococcus senticosus: 2011年; [Objective] This study aimed to clone and analyze the cDNA of ATPase β subunit gene from Eleutherococcus senticosus.[Method] A pair of homologous primers was designed according to the chloroplast ATPase β subunit gene sequences of the known species;then the gene cDNA of E.senticosus were amplified by RT-PCR and compared with that of the known species;its structure was predicted finally.[Result] 1 099 bp of ATPase beta subunit cDNA of E.senticosus which encodes 366 amino acids was amplified by RT-PCR.Sequence comparison and structure prediction showed that amino acids encoded by the ATPase beta subunit gene of E.senticosus shared the highest homology,up to 96.41% with that of Oryza sativa.In the secondary structure,the protein contained 171 alpha helixes accounting for 46.72%,53 extended strands accounting for 14.48%,27 beta sheets accounting for 7.38% and 115 random coils which took up 31.42%.The amino acids 262-271 were the symbolic site of ATPase β subunit.The whole peptide chain had no obvious hydrophobic region and was primarily confirmed as a hydrophilic protein.[Conclusion] The cNDA of ATPase β subunit gene cloned from E.senticosus in this study will provide reference for learning the effect of energy metabolism on secondary metabolism,structure and function of ATPase in E.senticosus.; 曹蕾邢朝斌陈龙梁能松何闪; 关键词：CLONING

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梁能松

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