【目的】从分子水平上对兰科杓兰属大花杓兰根际土壤真菌群落组成及潜在兰科菌根真菌进行初步研究。【方法】采用克隆文库技术对大花杓兰根际土壤真菌的ITS片段进行PCR扩增、克隆测序及BLAST分析。【结果】共获得96个真菌克隆,其中44个克隆鉴定为未知真菌,52个真菌克隆基于97%的序列相似性被划分为24个操作分类单元(Operational Taxonomic Unit, OTU),属于5门6纲11目16科15属。被孢霉属Mortierella为大花杓兰根际土壤的主要真菌类群。综合兰科植物菌根真菌的研究报道,对24个OUTs进一步分析,发现4个OTUs为潜在的兰科菌根真菌,分别属于角担菌科Ceratobasidiaceae的丝核菌属Rhizoctonia(OTU1)和角担菌属Ceratobasidium(OTU2)及胶膜菌科Tulasnellaceae(OTU3和OTU4)。【结论】根际土壤真菌及潜在兰科菌根真菌类群的构成及多样性研究,对从土壤中分离筛选有效的大花杓兰菌根真菌及其野生种群的迁地保育均具有重要意义。
采用Prot Param、Prot Scale、Signal P 4.1、SOPMA、SWISS-MODEL等在线生物学软件对LaeA蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜结构域、蛋白质二级和三级结构进行预测分析。结果表明,蛹虫草LaeA蛋白质是由20种295个氨基酸组成,不含信号肽、无跨膜结构域、稳定的亲水蛋白;LaeA蛋白二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、伸展链和β-转角组成,其中α-螺旋和无规则卷曲是LaeA蛋白的主要二级结构。通过生物信息学预测分析首次获得了蛹虫草LaeA蛋白的理化性质及各级结构信息,为将来深入研究蛹虫草LaeA蛋白的生物学功能奠定了理论基础。
