张倩
- 作品数:6 被引量:9H指数:2
- 供职机构:中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重大科学仪器设备开发专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生石油与天然气工程更多>>
- 人脐带血间充质干细胞基因组稳定性相关的miRNA及其应用
- 本发明提供了人脐带血间充质干细胞基因组稳定性相关的miRNA标志物及其检测方法。本发明利用新一代高通量测序技术,结合系统的生物信息学分析方法,筛选获得了与人脐带血间充质干细胞基因组稳定性密切相关的miRNA,其RNA序列...
- 方向东张昭军张倩韩忠朝
- 文献传递
- 裂缝性碳酸盐岩储气库注采渗流规律实验研究
- 裂缝性碳酸盐岩储气库储层具有双重结构特征,流体渗流复杂,研究难度大。目前裂缝性碳酸盐岩储气库的注采渗流物理模拟主要从宏观和微观两方面开展研究。论文以华北S裂缝性碳酸盐岩储气库为研究对象,开展储层微观储层特征、气水交互驱替...
- 张倩
- 关键词:渗流规律仿真模拟
- 文献传递
- 先天性纯红细胞再生障碍性贫血斑马鱼模型相关microRNA的组学研究被引量:2
- 2014年
- 目的探讨先天性纯红细胞再生障碍性贫血(DBA)相关microRNA的表达特征及其调控机制。方法利用morpholino技术建立核糖体蛋白基因Rps19表达不足的DBA斑马鱼模型和Rps19与p53同时表达不足的斑马鱼模型,利用新一代高通量测序(RNA-seq)技术,研究DBA斑马鱼模型的microRNA表达谱的特征及p53在其中的调控作用。结果 Rps19 MO的斑马鱼胚胎的循环血细胞明显减少,且尾部呈现出向腹侧弯曲的异常形态。而在p53敲低之后,斑马鱼的形态异常得到了一定程度的恢复。通过对microRNA表达谱的比较分析发现,在Rps19不足的斑马鱼胚胎中约1/4的microRNA表达量显著偏低,这些异常表达的microRNA可能影响到斑马鱼的正常发育过程。而在p53敲低之后,部分microRNA的表达恢复到正常水平。最终确定了47个在DBA发病过程中可能受p53调控的microRNA。结论 DBA斑马鱼模型的microRNA普遍低表达,其中部分microRNA受到p53的表达水平的调控。
- 张倩宋斌峰万扬张昭军鲍丙浩谢尚论刘汉芝竺晓凡袁卫平贾海波方向东
- 关键词:纯红细胞再生障碍性贫血MICRORNAP53RNA-SEQ斑马鱼
- KLF1和KLF9对K562细胞红系分化的协同调控作用被引量:4
- 2018年
- Krüppel样因子(Krüppel-like factors,KLFs)是锌指蛋白超家族的一个亚家族,参与细胞内的多种生理、病理过程,该家族成员在红细胞分化发育过程中发挥非常重要的作用,但是家族成员间对红系分化的协同调控作用还鲜有报道。本课题组前期研究发现,KIF家族成员KLF1和KLF9在已分化的红系细胞中的表达水平显著高于造血干细胞。为进一步探讨二者在红系分化中是否存在协同作用,本研究在K562细胞中分别过表达/敲低表达KLF1和KLF9,检测二者表达的相关性,发现KLF1和KLF9的基因表达呈现正相关,且二者共表达可以显著促进K562细胞红系分化,特异地增强β-珠蛋白的表达。通过对KLF1、KLF9单独和共同过表达、敲低表达的K562细胞转录组数据的分析发现二者可能通过PI3K-Akt和FoxO通路协同调控红系分化,FOS、TF、IL8是协同调控的候选靶基因。本研究结果为后续深入研究KLF1和KLF9协同调控红系分化的分子机制奠定了基础。
- 任岚肖茹丹张倩娄晓敏娄晓敏方向东
- 关键词:红系分化转录组测序转录因子
- 绝缘子调控基因的表达被引量:1
- 2011年
- 绝缘子在调控真核基因时空特异表达的过程中起着至关重要的作用.它的主要功能是增强子阻断和异染色质屏障.已经有竞争、阻断和成环等模型描述其增强子阻断功能;而它的异染色质屏障功能主要是通过影响染色质组蛋白的翻译后修饰来实现.已经确定的绝缘子包括果蝇基因组中的染色质特化结构(specialized chromatin structures,scs)和scs'、gypsy、鸡珠蛋白β基因座上游的DNaseⅠ高敏感位点cHS4以及小鼠或人Igf2/H19基因座上的印记控制区(imprinting controlregion,ICR)和DNA甲基化区域(DNA methylated regions,DMR)元件等.许多转录因子参与绝缘子的基因调控作用,例如脊椎动物中的CCCTC结合因子(CCCTC-binding factor,CTCF).利用基因组学和生物信息学等方法,还可以在基因组中发现新的绝缘子元件.
- 王海张倩方向东
- 关键词:绝缘子异染色质转录调控
- 人脐带血间充质干细胞基因组稳定性相关的miRNA及其应用
- 本发明提供了人脐带血间充质干细胞基因组稳定性相关的miRNA标志物及其检测方法。本发明利用新一代高通量测序技术,结合系统的生物信息学分析方法,筛选获得了与人脐带血间充质干细胞基因组稳定性密切相关的miRNA,其RNA序列...
- 方向东张昭军张倩韩忠朝
- 文献传递