吕梁
- 作品数:9 被引量:27H指数:3
- 供职机构:南方医科大学基础医学院基因工程研究所更多>>
- 发文基金:广州市重大科技攻关项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 细小病毒B19 Oligo探针设计被引量:2
- 2004年
- 利用BLAST软件对细小病毒B19的序列进行序列比对,获得特异序列;利用生物学软件Oligo6.40设计特异性高、Tm值接近、长度均一的Oligo探针。结果获得了13条70bp的Oligo探针,用于芯片打印及细小病毒B19的检测。表明利用BLAST系统和生物学软件Oligo6.40设计细小病毒B19诊断芯片的探针是一种简便而有效的方法。
- 吕梁马文丽孙朝晖马晓冬郑文岭
- 关键词:细小病毒B19生物信息学BLAST
- cDNA文库法在HCV-1b检测芯片研制中的应用被引量:8
- 2005年
- 制备丙型肝炎病毒(HCV) 1b亚型诊断芯片并进行初步验证评价.采用cDNA文库法制备探针,用限制性内切酶Sau3AⅠ消化HCV 1b全长cDNA ,所得的酶切片段72℃补平加A ,AT克隆,PCR初步鉴定,并测序.将筛选出的片段打印在氨基修饰的玻片上制备成检测芯片并进行杂交验证分析.运用cDNA文库法,得到2 2个大小相对一致(2 5 0~75 0bp)的基因片段.序列分析表明,均属于HCV 1b基因,可以作为诊断芯片探针;样品标记采用限制性显示(restrictiondisplay ,RD)技术,标记后进行杂交.杂交结果显示,样品和诊断基因芯片杂交的敏感性和特异性均佳.批内和批间精密度CV值分别为5 4 %和6 8% ,表明用cDNA文库法收集片段是一种快速、简便制备芯片探针的实用方法.
- 孙朝晖郑文岭彭翼飞张宝吕梁马晓冬马文丽
- 人细小病毒B19及其研究进展被引量:1
- 2002年
- 人细小病毒B19(HPV B19)是一类单链线状DNA病毒,可引起无症状性感染和症状性感染,是导致人类多种疾病发生的病因。本文就细小病毒B19的病毒学、流行病学研究及其临床表现和治疗作一综述。
- 吕梁马文丽郑文岭
- 关键词:人细小病毒B19病毒学流行病学
- 制备炭疽芽胞杆菌检测基因芯片的初步研究被引量:1
- 2004年
- 建立制备炭疽芽胞杆菌检测基因芯片的技术 ,并探讨研制检测炭疽芽胞杆菌基因芯片的方法。酶切炭疽芽胞杆菌的毒素质粒和荚膜质粒 ,通过建立质粒DNA文库的方法获取探针 ,并打印在经过氨基化修饰的玻片上 ,制成用于炭疽芽胞杆菌检测的基因芯片。收集了 2 90个阳性克隆探针 ,制备了检测炭疽芽胞杆菌的基因芯片。提取炭疽芽胞杆菌质粒DNA与基因芯片杂交 ,经ScanArrayLite芯片阅读仪扫描得到初步的杂交荧光图像。通过分析探针的杂交信号初步筛选出 2
- 马晓冬马文丽孙朝晖吕梁郑文岭王洪敏石嵘
- 关键词:炭疽芽胞杆菌基因芯片分子探针
- 应用PCR快速制备细小病毒B19诊断芯片探针(英文)被引量:3
- 2003年
- 目的制备细小病毒诊断芯片探针。方法利用Primer Premier 5.0针对细小病毒B19基因保守区域设计PCR引物,将PCR产物克隆pMD-18 T载体。结果序列分析显示,PCR产物均为细小病毒B19特异保守基因。结论利用PCR扩增产物制备诊断芯片探针是一种简便有效的方法。
- 吕梁马文丽王洪敏马晓冬孙朝晖郑文岭
- 关键词:PCR细小病毒B19探针
- 应用PCR快速制备乙型、丁型肝炎病毒诊断基因芯片探针被引量:12
- 2003年
- 目的应用PCR技术扩增乙型、丁型肝炎病毒保守区域基因片段,并进行克隆、测序分析,制备联合诊断乙型、丁型肝炎病毒基因芯片探针。方法利用Oligo6.4软件分别针对乙型、丁型肝炎病毒基因保守区域设计PCR引物,纯化PCR扩增产物,扩增后的产物克隆至pMD18-T载体并进行快速鉴定,提取阳性克隆质粒进行测序分析及鉴定。结果获得多个乙型、丁型肝炎特异性基因片段。序列分析表明,所扩增的片段均属于乙型、丁型肝炎病毒特异基因。结论利用PCR扩增产物制备基因芯片探针是一种快速、简便的实用方法。
- 孙朝晖郑文岭毛向明张宝吕梁马晓冬石嵘马文丽
- 关键词:丁型肝炎病毒基因芯片分子探针技术聚合酶链反应
- 炭疽杆菌保护性抗原基因芯片探针的制备
- 2003年
- 目的快速制备炭疽杆菌保护性抗原基因芯片探针。方法根据PubMed上公布的炭疽杆菌保护性抗原的DNA序列设计引物,扩增保护性抗原基因。利用酶切、AT克隆方法快速分析筛选出保护性抗原基因片段的重组子,从而制备成芯片探针。DNA自动分析仪对克隆片段进行序列测定,生物信息学软件对其基因序列进行分析。结果根据炭疽杆菌保护性抗原设计的引物,可以扩增出长2 205 bp的保护性抗原基因,经酶切、AT克隆方法筛选出约7个长度不一的片段,对其片段进行序列测定并进行Blast序列比对得知这些片段均属于炭疽杆菌保护性抗原基因。结论利用PCR扩增产物并结合酶切、AT克隆方法可以快速、简便地制备基因芯片探针。
- 马晓冬马文丽吕梁肖维威孙朝晖郑文岭
- 关键词:炭疽杆菌保护性抗原
- 细小病毒B19诊断芯片的初步研究被引量:2
- 2004年
- 初步探讨并制备细小病毒B19诊断芯片,进行实验室验证.用基因芯片点样仪将细小病毒B19诊断探针固定在特殊处理的玻片上,以细小病毒B19质粒重复检测.运用限制性显示(RD)技术,用Cy5标记的通用引物进行荧光标记,通过与基因芯片杂交,严谨洗涤,将非特异性的标记片段洗脱后,经扫描仪扫描,计算机解读.杂交结果显示,Cy5标记的探针均出现杂交信号,而阴性对照和空白对照的杂交信号均很弱;芯片检测具有高特异性、敏感性和可重复性.初步建立了较可靠的制备与检测细小病毒B19诊断芯片的方法,经验证诊断准确率高,假阳性率低.
- 吕梁马文丽石嵘马晓冬孙朝晖郑文岭
- 关键词:细小病毒B19基因芯片杂交
- 细小病毒B19诊断芯片探针的制备被引量:2
- 2003年
- 目的 制备细小病毒B19诊断芯片探针。方法 利用PrimerPremier 5 0软件针对细小病毒B19基因保守区域设计PCR引物 ,纯化扩增产物 ,克隆鉴定。结果 序列分析表明 ,扩增片段均为细小病毒B19特异基因。结论 利用PCR扩增产物可制备细小病毒B19诊断芯片探针。
- 吕梁马文丽孙朝晖马晓冬郑文岭
- 关键词:细小病毒B19聚合酶链反应