丁新伦
- 作品数：26 被引量：57H指数：4
- 供职机构：福建农林大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学更多>>
- 植物病毒学课程教学实践研究被引量：1
- 2020年
- 植物病毒学是研究植物病毒的基础知识、植物病毒的诊断和鉴定、植物病毒病的流行及防控的学科,是高等院校植物保护学、生命科学等学科的重要专业选修课。近几年,笔者针对该课程利用启发式教学及课程思政融入教学的方法等进行了教学实践活动,取得了较好的教学效果。
- 张洁丁新伦
- 关键词：植物病毒学教学实践启发式教学
- 水稻草状矮化病毒侵染下水稻根发育相关基因的表达分析被引量：1
- 2014年
- 水稻草状矮化病毒(Rice grassy stunt virus,RGSV)引起的水稻草矮病是热带和亚热带稻区的重要病害,RGSV侵染引起水稻植株根系严重发育不良。为解析RGSV侵染引致水稻根系发育不良的分子机制,以水稻品种‘汕优63’为材料,通过实时荧光定量RT-PCR技术分析水稻经RGSV侵染后根系发育相关基因Os PHR2、QHB、Os RR1、Os EXPB5、Crl-5和Os EXPA17等基因的m RNA表达量变化。结果表明,RGSV侵染引起Os PHR2和Crl-5基因表达下调,下调比率分别为2.18和4.86,而水稻病株QHB、Os RR1、Os EXPB5和Os EXPA17等基因的表达量与健株相比,各基因差异比率分别为1/1.49、1.01、1.39、1/1.37,表明RGSV侵染未引起这些基因的表达量发生变化。RGSV可能通过直接或间接调控根系发育相关基因表达水平而使根系发育异常。
- 丁新伦谢荔岩潘贤吴祖建
- 关键词：实时荧光定量RT-PCR
- 草莓白化相关病毒中国分离物全基因组分析被引量：7
- 2021年
- 草莓白化相关病毒(strawberrypallidosis-associatedvirus,SPa V)属于长线形病毒科(Closteroviridae)毛形病毒属(Crinivirus),可引起草莓病害,2017年在中国首次报道。采用高通量测序、RACE和RT-PCR技术获得了SPa V中国分离物(FJ)的基因组全长。该病毒含有两条正单链基因组RNA1和RNA2。RNA1全长8 048 nt,5′和3′非编码区序列分别为264和197 nt,含有3个开放阅读框(ORF),分别编码ORF 1a/1b融合蛋白和p9蛋白。RNA2全长7 977 nt,5′和3′非编码区序列分别为248和186 nt,含有8个开放阅读框(ORF),分别编码HSP70h、CPh、CP、CPm、p7、p6、p9和p28等8个蛋白。RNA1和RNA2与美国M1分离物分别具有98.5%和99.0%的核苷酸一致性;系统发育分析结果表明,SPa V中国分离物(FJ)单独处在一个分支。对SPa V来源的小RNA的分析表明,来源于SPa V的小RAN长度以21和22 nt为主。
- 陈道张洁吴祖建丁新伦
- 关键词：草莓基因组序列
- 木尔坦棉花曲叶病毒编码4个蛋白的抗血清制备
- 2021年
- 【目的】对入侵我国的木尔坦棉花曲叶病毒(Cotton leaf curl Multan virus,CLCuMuV)编码的V1、V2、C1和C4蛋白抗血清进行制备,为CLCuMuV的检验检疫及其致病机制的研究奠定基础。【方法】利用原核表达技术对V1、V2、C1和C4蛋白进行IPTG诱导表达,western blot分析表达蛋白的特异性后,V1、V2、C1蛋白免疫新西兰大白兔,C4蛋白免疫小白鼠制备抗血清,利用western blot对抗血清的特异性进行分析。【结果】通过PCR分别扩增V1(768 bp)、V2(363 bp)、C1(1089 bp)和C4(300 bp)目的基因片段,分别连接于原核表达载体后,通过SDS-PAGE和western blot分析分别在34、16、44、13 kDa处存在与预期蛋白大小一致的条带,表明该4种蛋白均成功表达。Western blot分析发现获得的4种抗血清均具有较高的特异性。【结论】成功制备了CLCuMuV V1、V2、C1和C4蛋白的抗血清,可用于后续建立CLCuMuV的检疫方法及研究其致病机制。
- 林丹林文忠尚鹏祥林文武丁新伦吴祖建张洁
- 关键词：棉花原核表达免疫印迹抗血清
- 水稻齿叶矮缩病毒基因组S10片段的克隆、原核表达及抗血清制备(摘要)
- 水稻齿叶矮缩病毒(Rice ragged stunt virus,RRSV)是呼肠孤病毒科 (Reoviridae)水稻病毒属(Oryzavirus)的代表种,以水稻为主要侵染寄主。以 RRSV 福建沙县分离物(RRSV...
- 丁新伦段永平谢荔岩林奇英吴祖建
- 文献传递
- 福建地区草莓斑驳病毒全基因组测序和分子变异分析被引量：1
- 2022年
- 为了深入解析草莓斑驳病毒(strawberry mottle virus,SMoV)的分子变异以及遗传多样性,采用小RNA高通量测序结合RACE和RT-PCR技术获得了福建地区SMoV基因组全长序列。SMoV基因组RNA1和RNA2分别为7034 nt和6354 nt,均含有1个ORF,分别编码多聚蛋白P1和P2;SMoV福建分离物同其他15个SMoV分离物的同源性分析表明,RNA1核苷酸和多聚蛋白P1氨基酸同源性分别为79.2%~96.8%和89.0%~99.5%;RNA2核苷酸和多聚蛋白P2氨基酸同源性分别为77.9%~97.8%和89.9%~98.9%。SMoV福建分离物各编码蛋白同其他15个SMoV分离物的同源性分析表明,仅病毒基因组连接蛋白最为保守,其他各蛋白核苷酸序列和氨基酸序列变异均较大。福建分离物和中国部分分离物聚在一个大分支上,和中国分离物DGHY3亲缘关系最近。SMoV中国福建分离物的基因组结构与其他分离物相一致,其核苷酸序列和氨基酸序列分子变异较大,并且和中国其他分离物具有较丰富的遗传多样性,在进化上有一定的地理相关性。
- 陈道王新江山张洁吴祖建丁新伦
- 关键词：高通量测序全基因组序列分子变异遗传进化分析
- 水稻齿叶矮缩病毒基因组S8和S10片段的原核表达及抗血清制备
- 水稻齿叶矮缩病毒(RRSV)是呼肠孤病毒科(Reoviridae)水稻病毒属(Oryzavirus)的典型成员，。RRSV基因组包括10条双链RNA片段(S1-S10)，本文报道了福建农林大学植物病毒研究所分离纯化并经室...
- 丁新伦
- 关键词：水稻齿叶矮缩病毒原核表达抗血清
- 文献传递
- 水稻齿叶矮缩病毒Pns10蛋白在水稻原生质体内的表达被引量：1
- 2017年
- 【目的】水稻齿叶矮缩病毒(Rice ragged stunt virus,RRSV)Pns10蛋白在介体昆虫细胞内可形成类似病毒原质(viroplasm)的内含体,是RRSV侵染介体所必需。然而Pns10蛋白在水稻寄主中是否具有类似功能及其表达情况如何未见报道。【方法】利用大肠杆菌系统表达Pns10蛋白,免疫家兔制备多克隆抗体;通过水稻原生质体病毒侵染体系,利用免疫荧光技术分析Pns10蛋白在水稻原生质体内的分布情况,利用实时定量PCR技术和Western blot技术分别检测Pns10 RNA和Pns10蛋白在水稻原生质体内的积累情况。【结果】将Pns10基因克隆到Gateway系统原核表达载体p DEST17中,IPTG诱导表达成功后,制备融合蛋白抗血清。Western blot检测显示,该抗血清可检测感病水稻叶片中的Pns10蛋白。病毒侵染水稻原生质体后,Pns10蛋白可形成类似病毒原质的内含体;Pns10 RNA在病毒接种8 h后开始积累,24 h后达到最大值,随后开始下降;Pns10蛋白在24 h后开始表达,之后维持较高水平,60 h后略有下降。【结论】成功获得了Pns10抗血清;Pns10在水稻原生质体内成功表达,可形成类似病毒原质的内含体,并且Pns10 RNA的表达先于其蛋白的表达。
- 张洁陈晓敏吴锦鸿朱重庆丁新伦吴祖建
- 关键词：水稻齿叶矮缩病毒水稻原生质体
- 运用代谢组学研究RSV与水稻的互作初探
- 2012年
- 水稻条纹叶枯病严重威胁着我国的水稻生产,该病由水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)引起。目前,对水稻与RSV互作机制的认识还较少,这是制定有效措施来对RSV进行防控的一大障碍。代谢组学是新近发展起来的一种研究手段,它通过考察生物体系包括细胞、组织或整个生物体在受到刺激或扰动后,在代谢水平上的应答,来研究一系列的生物现象。运用代谢组学对水稻与RSV的互作进行了初步探索。GC-MS分析表明,RSV的侵染能显著影响水稻的代谢谱,且在代谢组水平上,不同抗感性的水稻对RSV的响应存在着差异。与NIST质谱数据库中的信息比较,从武育粳3号健康植株中鉴定到内源性代谢物12种、武育粳3号发病植株中11种、KT95-418健康植株中9种、KT95-418发病植株中14种。
- 徐飞谢荔岩丁新伦林奇英
- 关键词：水稻条纹病毒GC-MS
- 水稻条纹病毒胁迫下抗、感病水稻品种胼胝质的沉积被引量：10
- 2008年
- 为进一步探讨脱落酸(abscisic acid,ABA)在水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)与水稻互作中的作用,采用徒手切片法及苯胺蓝荧光染色技术研究RSV胁迫对抗、感水稻品种叶片中胼胝质沉积的影响。在RSV胁迫下,感病水稻叶片组织中胼胝质的荧光强度与健株无显著差异;而抗病水稻叶片组织中胼胝质的荧光强度却较健株明显增强,其中,大维管束中的维管束鞘内层厚壁细胞、木质部和韧皮部以及维管束鞘延伸的厚壁组织、小维管束、表皮细胞以及叶肉细胞均有较强的胼胝质荧光出现;且抗病水稻中的胼胝质荧光强度强于感病水稻。这说明水稻品种的抗性与胼胝质的沉积有关,ABA参与了RSV与水稻的互作,增强了水稻抗RSV的作用。
- 丁新伦谢荔岩林奇英吴祖建谢联辉
- 关键词：抗病品种感病品种水稻条纹病毒脱落酸
