陈微
- 作品数：7 被引量：10H指数：2
- 供职机构：哈佛大学更多>>
- 发文基金：国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 包含BTB锌指结构的新基因Bsg2结构特性及其在发育阶段的组织表达特异性被引量：2
- 2004年
- 通过消减差异筛选法寻找小鼠胚胎发育过程中在脑中特异表达的基因 .克隆得到的脑特异表达新基因 2 (brainspecificgene 2 ,简称Bsg2 )长 36 91bp ,通过生物信息学方法预测其编码一个含713个氨基酸的锌指蛋白 .此蛋白N端有一个BTB(BR C ,ttkandbab)结构域 ,C端有 9个连续的C2H2锌指结构 .该基因定位在小鼠 12号染色体上 ,包含 1个内含子和 2个外显子 .应用生物信息学和RT PCR方法分别检验该基因在小鼠各组织中的表达 .结果表明 ,Bsg2基因在小鼠胚胎及成体的各组织中普遍表达 ,在脾、肾、睾丸、肠、子宫和脑的表达水平较强 .利用整体 (wholemount)原位杂交研究其时空表达模式 .结果显示 ,Bsg2在早期的小鼠胚胎和不同时期鸡胚的头部均特异表达 ,在11d鼠胚的肢芽里也有较强的表达 .Bsg2基因的结构和表达特征预示它编码 1个具有DNA结合功能的转录调控因子 。
- 姚艺桑北京师范大学生命科学学院生物医学研究所邹星慈宏亮陈微李亦平
- 关键词：生物信息学原位杂交
- 人类新基因ACBP5cDNA的克隆及其同源物在小鼠/鸡胚发育过程中的表达被引量：6
- 2005年
- 利用电子克隆的方法寻找具有重要结构域的人类新基因ACBP5 ,根据得到的序列信息用RT PCR的方法获得全长基因 .通过生物信息学方法预测其结构 ,采用整体原位杂交和组织RT PCR的实验方法 ,在小鼠和鸡胚胎实验模型中研究该基因在发育过程中的表达情况 ,并对其功能进行初步的预测 ,获得一个含有乙酰辅酶A结合蛋白 (acyl CoAbindingprotein ,ACBP)结构域的人类新基因ACBP5 .ACBP5基因的cDNA长度为 10 83bp ,生物信息学方法预测其定位在人第 1号染色体上 ,包含 7个外显子 ,6个内含子 ,包含一个 35 4bp的完整阅读框架 ,编码一个 118个氨基酸残基的蛋白 .在以小鼠胚胎和鸡胚为模型的整体原位杂交中 ,以ACBP5基因全长编码区为探针的结果均显示该基因在胚胎头部特异表达 ,并且主要集中在中脑与间脑之间的峡部 .成体小鼠的组织RT PCR的结果显示 ,ACBP5的同源基因在各组织中均有表达 .这提示ACBP5基因在不同物种中的表达可能比较保守 ,并与头部发育有密切关系 ,同时也对维持细胞的正常功能起到重要的作用 .
- 王峦薛鹏程睿付佳琪陈微慈宏亮李亦平
- 关键词：生物信息学峡部
- 一个在小鼠头部特异表达的新基因BSG1 cDNA的克隆及研究被引量：2
- 2004年
- 目的 克隆小鼠头部发育过程中特异表达的新基因并对新基因可能的功能进行初步分析。 方法采用消减差异筛选的方法筛选小鼠头部特异表达的新基因 ,并用生物信息学的方法对克隆到的新基因进行序列分析和蛋白结构域的预测。同时 ,还采用了小鼠胚胎原位杂交、小鼠脑部切片的原位杂交以及鸡胚的原位杂交方法研究BS6 1基因的表达情况。 结果 克隆到 1个与小鼠头部发育相关的新基因BSG1(brainspecificgene 1) ,其GenBank的登录号为AY2 10 4 0 2。该基因包含 1个 2 133bp的完整阅读编码框 ,编码 1个 710aa的C2H2型锌指蛋白。它与人的KIAA0 4 4 1基因在氨基酸水平上有 82 8%的同源性。该基因定位在小鼠的第 10号染色体上 ,含 7个外显子 ,6个内含子。BSG1主要在小鼠胚胎、鸡胚的头部表达 ,并且BSG1在小鼠头部表达的部位局限在海马、齿状回和小脑。 结论 BSG1是 1个可能的转录因子 ,在脑部特异表达。对其研究有助于进一步揭示大脑发育的分子机理。
- 吴婷张晶慈宏亮陈微翟永功桑建利左明雪李亦平
- 关键词：小鼠特异表达新基因克隆锌指结构域
- 人类新基因cegl cDNA的克隆及表达研究被引量：2
- 2004年
- CLECT and EGF-like domain contained Gene l(cegl)基因是用电子克隆的方法获得的人类新基因。该基因定位在人类的第14号染色体上,是一个单一外显子的基因。cegl基因的cDNA长度为2050bp,通过生物信息学方法预测它包含一个1340bp的完整阅读框架,编码一个490个氨基酸的蛋白,含有CLECT、EGF-like结构域各一个。以cegl基因全长编码区为探针的整体原位杂交结果显示该基因的小鼠和鸡的同源基因在各自早期胚胎头部中特异表达,并且在不同时期胚胎神经系统增殖迅速的部位中有大量的表达。RT-PCR结果显示该同源基因在小鼠成体各组织中广泛分布。这提示cegl基因可能与头部生长发育有密切关系,并且对维持成体各组织的正常功能起到重要的作用。对cegl基因在胚胎发育的时间和空间表达模式的研究将有助于进一步深入地揭示它在人脑的正常生长发育中的作用。
- 付佳琪王峦陈微陈微慈宏亮
- 关键词：EGF新基因成体生长发育
- 小鼠胚胎脑特异表达的新基因bsg3的克隆及初步研究被引量：2
- 2004年
- 通过消减差异筛选的方法克隆到一个在小鼠胚胎脑特异表达的基因bsg3(brainspecificgene 3) .它编码的蛋白与人的KIAA0 96 1具有 80 .3%的同源性 .bsg3基因包含一个 16 4 4bp的完整阅读框 ,编码一个含 5 4 8个氨基酸 ,具有 1个KRAB结构域 (kruppel associatedbox)和 13个C2H2型锌指结构域的蛋白 .该基因定位在小鼠第 7号染色体上 ,包含 5个外显子 ,4个内含子 .以bsg3基因全长编码区为探针的原位杂交结果显示 ,bsg3在小鼠胚胎脑及鸡胚脑特异表达 .半定量反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)的结果表明 ,在成体小鼠的组织中 ,bsg3基因脑中表达也较强 .这提示bsg3基因可能在小鼠脑发育中起着重要的作用 .
- 姚艺桑付佳琪陈微杨玮邹星李宁李亦平
- 关键词：小鼠
- 一个新的人类乙酰转移酶基因hNATL的克隆与表达谱研究
- 2006年
- 从小鼠cDNA序列入手,依据同源分析的电子克隆方法得到一个包含N末端乙酰转移酶结构域的人类新基因hNATL(Human NAT Like)。hNATL的cDNA长1803bp,编码区621bp,Genbank 登陆号AY632082。hNATL编码的蛋白长206个氨基酸残基,包含有N乙酰转移酶结构域。hNATL 基因定位于人染色体17q25．2区,包括6个外显子和5个内含子。基因表达汇编分析结果显示, hNATL在人脑和生殖腺中高表达。Northern杂交显示,在成年小鼠中hNATL在心脏,脾脏和卵巢中出现表达。整体原位杂交的结果显示,hNATL特异表达于E7．5和E8．5的小鼠胚胎脑部和HH10期鸡胚胎的头部。上述结果提示,hNATL对胚胎期脑的发育和成体中重要器官行使正常功能发挥十分重要的作用。
- 邹星慈宏亮陈微李亦平
- 关键词：胚胎发育整体原位杂交
- 小鼠BTB/锌指结构新基因Bsg6的克隆及表达谱分析被引量：2
- 2006年
- Bsg6(brain specific gene 6)是用消减差异筛选的方法克隆的小鼠头部特异表达新基因.Bsg6基因cDNA长3 871 bp,编码一个670个氨基酸残基的蛋白,GenBank登录号AY635051,位于小鼠第4号染色体,由2个外显子构成.Bsg6蛋白含有一个N端BTB(Broad-complex,Tramtrack,andBric-a-brac)结构域和两个C端C2H2型锌指结构域.小鼠Bsg6蛋白与其在人类和鸡中同源蛋白的同源性分别为86.2%和79.1%.Bsg6在小鼠胚胎中的表达具有一定动态性,在E8.5的小鼠胚胎中,Bsg6主要在前脑和神经管表达.在E9.5的小鼠胚胎中,Bsg6的表达明显增强并主要集中在前脑的端脑部.Bsg6在E10.5小鼠胚胎端脑的表达出现了下降,但是在中脑和后脑的表达增加,此外,Bsg6 mRNA的表达还出现在肢芽和尾部.在HH10期的鸡胚中,Bsg6主要在头部和神经管前端表达.Northern杂交结果显示,Bsg6在很多小鼠成体组织中没有表达,但是在破骨细胞瘤中高表达.Bsg6的表达谱提示,Bsg6可能是在器官形成期对脑的发育起到重要作用的转录因子,而且其表达受到严格的调控,此外Bsg6还可能与肿瘤的发生有关.
- 慈宏亮李昱华陈微李亦平
- 关键词：锌指蛋白
