邓春兴
- 作品数：5 被引量：14H指数：2
- 供职机构：暨南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 中国胶州湾赤潮异弯藻rDNA ITS区序列分析被引量：2
- 2013年
- 测定了采自中国胶州湾赤潮异弯藻X2藻株18S rDNA ITS区基因序列,结合GenBank中下载的37条同源序列,分析序列特征并构建分子系统树。发现534 bp序列中有可变位点16个、简约信息位点1个,可变位点和简约信息位点分别占全序列的3.0%和0.19%,序列间相似性为97%,A+T含量(47.8%)略小于C+G含量(52.2%)。在分子系统树上,全部序列聚类在一起,遗传距离在0.0000~0.0242之间,说明全部赤潮异弯藻遗传多样性极低。赤潮异弯藻的生长和繁殖受到外界环境因子的较大制约,而人为因素如船只压舱水等则是其传播的主要途径。
- 黎瑞宝章群马奔邓春兴
- 关键词：赤潮RDNAITS
- 基于线粒体COI基因的马鲅科鱼类DNA条形码研究被引量：3
- 2020年
- 为明确中国马鲅科(Polynemidae)鱼类的分类地位,测定了中国7省10个地点马鲅科鱼类3属5种33条COI基因5′端序列,结合GenBank下载的5属16种41条同源序列,共分析了6属20种马鲅科鱼类DNA条形码。结果显示,20种鱼类种间平均遗传距离为19.6%,是种内平均遗传距离0.9%的22倍;其中14种形成了单系分支,支持其物种有效性。四指马鲅(Eleutheronema tetradactylum)和多鳞四指马鲅(E.rhadinum)种间遗传距离(16.0%)是种内平均遗传距离(1.2%)的13倍,支持将二者作为2个独立物种的分类处理。多鳞四指马鲅种内遗传距离(2.3%)大于2%,形成了2个自展数据支持率为99%的分支,分支间遗传距离(4.8%)是分支内平均遗传距离(0.1%)的48倍,表明在中国沿海分布的多鳞四指马鲅有可能存在2个亚种或隐藏种。黑斑多指马鲅(Polydactylus sextarius)与马达加斯加多指马鲅(P.malagasyensis)外部形态极为相似,种间遗传距离仅为1.0%,且在分子系统树上镶嵌混杂为一支,仅根据分子数据结果,推测二者可能为同一物种;但由于没有可检视的标本,也不能排除GenBank序列种名注释中形态鉴定出错的可能。马伦氏多指马鲅(P.mullani)与七丝指马鲅(Filimanus heptadactylus)也混为1支,分支内遗传距离仅为0.1%;如果不是GenBank序列种名注释出错,则二者应为同一物种。GenBank序列中来源于北部湾的六丝多指马鲅(P.sexfilis),则可能是黑斑多指马鲅的错误鉴定。
- 王业磷章群邓春兴徐示裴丽梅黄志基罗纯
- 关键词：DNA条形码COI基因
- 长江和闽江长体鳜遗传多样性的细胞色素b全序列分析被引量：1
- 2014年
- 对长江水系中江西都昌和闽江水系中福建建瓯2个群体23尾长体鳜细胞色素b全基因的1 141 bp序列进行分析,发现15个变异位点,其中简约信息位点7个,共有13个单倍型,总体单倍型多样度(Hd)和核苷酸多态度(Pi)分别为0.933(±0.030)和0.00241(±0.030),呈现出高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特点。中性检验结果显示Fu’s Fs为显著负值,核苷酸不配对分析呈现单峰分布,表明长体鳜在历史上经历过种群扩张事件,推测扩张年代约为6万年前,为更新世晚期。在邻接树和简约性网络图中不同地理来源的单倍型交错分布,群体间的Fst和Nm值分别为0.06667和3.5。AMOVA分析表明,长体鳜群体内遗传差异(95.17%)大于群体间(4.83%)遗传差异,遗传变异主要是集中在群体内部,表明都昌和建瓯的长体鳜群体间没有出现明显遗传分化,可作为一个管理保护单位。
- 周文漪阮燕如邓春兴薛丹章群
- 关键词：细胞色素B
- 基于线粒体控制区序列的海南须鲫遗传多样性分析
- 2014年
- 测定了海南岛南渡江和万泉河2个水系33尾须鲫线粒体控制区5'端520 bp序列,共发现5个变异位点,其中简约信息位点4个,没有插入、缺失,转换颠换比为4,定义了5个单倍型。万泉河和南渡江群体的单倍型多样度分别为0.6762(±0.1006)与0.6993(±0.0435),核苷酸多样度分别为0.00249(±0.001849)与0.00260(±0.001887),二者均处于较低水平。中性检验结果显示Fu's Fs为正值且不显著(0.288,P>0.1),核苷酸不对称分布不呈明显单峰,表明海南须鲫历史上没有发生快速种群扩张,种群大小相对稳定。2个群体间没有显著遗传分化(Fst=0.03638,P>0.1),海南须鲫群体可作为一个管理保护单位。
- 邓春兴周文漪郜星晨许忠能章群
- 关键词：线粒体控制区
- 基于COI基因序列的中国东南沿海四指马鲅属鱼类的遗传多样性分析
- 四指马鲅属(Eleutheronoma)是广泛分布于印度-西太平洋的名贵海洋鱼类,也是东南亚地区各国重要的养殖对象。本文在对中国东南沿海10个地理群体194尾四指马鲅属鱼类进行形态鉴定的基础上,通过PCR扩增技术和DNA...
- 邓春兴
- 关键词：COI基因序列种群结构
- 文献传递
