许晶晶
- 作品数:40 被引量:79H指数:6
- 供职机构:厦门大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金福建省自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域:理学医药卫生轻工技术与工程农业科学更多>>
- 用于预测蛋白质翻译后修饰位点的深度学习方法
- 用于预测蛋白质翻译后修饰位点的深度学习方法,涉及生物信息学领域。包括:从公共数据库上收集带有蛋白质翻译后修饰位点注释的蛋白质序列数据;对收集到的蛋白质序列进行去冗余处理,并删除可信度较低的位点注释信息,得到不同PTM类型...
- 许晶晶黄自鑫郭磊董继扬
- 联合1H NMR和NIR技术应用于铁观音茶叶溯源
- 孟维君徐向南刘晓莎许晶晶沈桂平董继扬
- 一种受扰动代谢通路确定方法及系统
- 本发明涉及一种受扰动代谢通路确定方法及系统,包括:获取待测生物样本;采用高通量分析技术和谱数据处理方法对生物样本进行分析和处理,得健康和异常生物样本代谢物的浓度集合;计算健康生物样本代谢物集合中任意两种代谢物的健康生物样...
- 董继扬张璇邓伶莉许晶晶
- 文献传递
- 电针胃经穴对胃溃疡模型大鼠血清和尿液代谢轮廓的影响被引量:5
- 2016年
- 目的:采用核磁共振氢谱技术(1H NMR)研究电针胃经穴对胃溃疡模型大鼠血清和尿液代谢轮廓的影响。方法:40只SD大鼠随机分为空白组、模型组、胃经穴组和胆经穴组,每组10只。除空白组外,利用束缚冷应激法制备大鼠胃溃疡模型,造模成功后用电针分别刺激胃经组和胆经组相关穴位,收集大鼠的血清和尿液,获取一维1H NMR谱,并利用模式识别方法分析各组间的代谢轮廓差异。结果:与模型组比较,胃经穴组血清中的肌醇、甘氨酸、谷氨酰胺、异亮氨酸、缬氨酸和尿液中的肌酸酐、乳酸、醋酸盐、肌酸、琥珀酸盐、牛磺酸、甘氨酸、苯乙酰甘氨酸、尿囊素、胆碱、三甲胺、甲酸盐、甜菜碱代谢物的表达水平得到了明显地恢复(P<0.05),更接近空白组的代谢水平。结论:电针胃经穴可通过调节胃溃疡大鼠的氨基酸代谢和脂肪代谢促进胃黏膜损伤的修复。
- 杨宗保王亚东董继扬刘琼王超马富强文磊全仁夫许晶晶
- 关键词:电针胃溃疡核磁共振
- 基于核磁共振和质谱的代谢组学数据融合方法及其应用
- 本发明公开了基于核磁共振和质谱的代谢组学数据融合方法及其应用,该方法包括:分别利用核磁共振谱仪和液相色谱‑质谱仪器采集生物样品的代谢轮廓,得到基于核磁共振(NMR)和基于质谱(MS)的两种代谢组学数据;利用Diffreg...
- 秦家辉徐向南董继扬许晶晶
- 文献传递
- 一种板级安规绝缘结构
- 本实用新型提供了一种板级安规绝缘结构,包括PCB板,所述PCB板上设置有一次侧高压电路功能模块、安全特低电压电路功能模块及接地系统;所述接地系统设置于所述一次侧高压电路功能模块与安全特低电压电路功能模块之间;所述一次侧高...
- 王亚军苏雅萍冯志斌潘啸陈忠宋争勇高玉琳林玉兰崔晓红朱丽虹许晶晶陈阿鹏
- 文献传递
- 一种肝泡型包虫病的代谢组学分析及初步筛查模型的构建方法
- 本发明公开了一种肝泡型包虫病的代谢组学分析及初步筛查模型的构建方法,包括:收集健康人和肝泡型包虫病患者血清和尿液样品;采集每个样品的一维核磁共振氢谱,得到样品的代谢轮廓谱;对代谢轮廓谱进行数据预处理,得到二维数据矩阵;将...
- 林彩桂董继扬沈桂平许晶晶陈忠
- 文献传递
- 电针秩边穴和水道穴对急性脊髓不完全损伤大鼠脑皮质代谢物的影响被引量:8
- 2016年
- 目的:观察电针秩边穴和水道穴对急性脊髓不完全损伤大鼠脑皮质代谢物的影响。方法:将36只雄性 SD 大鼠随机分为假手术组、模型组、电针组,每组12只。采用改良 Allens 法将模型组和电针组大鼠制成 T10急性脊髓不完全损伤模型,假手术组大鼠手术摘除 T10椎板暴露硬脊膜后立即缝合。造模结束后,假手术组和模型组大鼠仅进行抓取和固定;电针组大鼠予以电针秩边穴和水道穴,每天1次,连续治疗1周。电针干预结束后断头处死所有大鼠,采集大鼠脑皮质和 T9~T10椎体对应节段脊髓1 cm。将取得的脊髓组织制成切片,HE 染色后光镜下观察脊髓组织形态;对取得的脑皮质进行磁共振波谱分析,比较3组大鼠脑皮质代谢物的浓度。结果:至处死前各组均无大鼠死亡。假手术组大鼠脊髓结构完整,神经细胞形态正常、分布均匀,细胞膜、细胞核及组织间隙均正常;模型组大鼠脊髓形态不完整,损伤区域有神经组织残缺,存在较多出血,组织疏松水肿,部分细胞核固缩,神经细胞数量明显减少,细胞周围基质消失呈空泡状;电针组大鼠脊髓形态结构基本完整,组织中散在血细胞,组织水肿较轻,神经细胞形态基本正常,空泡变性较轻。3组大鼠脑皮质中异亮氨酸、谷氨酸、N -乙酰天门冬氨酸、甘油磷脂胆碱、肌醇、维生素 C、乳酸、苏氨酸、肌苷浓度比较,组间差异均有统计学意义(1.63±0.20,1.13±0.12,1.35±0.01,F =43.195,P =0.000;9.51±0.40,8.66±0.74,9.94±1.25,F =6.728,P =0.004;2.54±0.22,2.21±0.19,2.38±0.45,F =3.332,P =0.048;9.47±1.26,8.10±1.34,9.38±0.88,F =5.070,P =0.012;3.66±1.10,3.17±0.89,4.55±1.81,F =3.365,P =0.047;2.45±0.33,2.15±0.21,2.34±0.17,F =4.388,P �
- 全仁夫胡华辉黄小龙刘飞杨宗保许晶晶
- 关键词:电针代谢组学
- 五常稻花香米的^1H-NMR波谱分析及掺假鉴别被引量:7
- 2016年
- 结合核磁共振氢谱(^1H NMR)技术和多变量统计分析方法,研究五常稻花香米的掺假鉴别方法。采集稻花香米与掺假样品的^1H NMR谱,分析它们的化合物组成模式的差异,分别建立基于1H NMR谱和基于20种主要成分半定量数据的掺假鉴别模型。结果表明:五常稻花香米与掺假大米在α-葡萄糖、淀粉、蔗糖、甜菜碱、β-葡萄糖、胆碱、天冬酰胺、天冬氨酸、琥珀酸、谷氨酸、乙酸、γ-氨基丁酸、丙氨酸、苏氨酸、异亮氨酸和缬氨酸等16种主要成分上存在显著差异(p〈0.05);基于-1H NMR谱的模型预测准确率为83.5%,而基于20种半定量化合物的模型预测准确率为70.1%。
- 何瑶郑彦婕邓伶莉许晶晶沈桂平杨万颖董继扬
- 关键词:核磁共振波谱
- 基于PCA的代谢组学数据滤噪方法
- 2012年
- 代谢组学数据不可避免地受到各种刺激因素的作用,如何降低干扰因素的影响是代谢组学数据预处理的一个重要任务。详细分析了代谢组学数据方差的构成及其在特征空间中的分布特点,并在此基础上提出一种滤除未知干扰因素的新方法,提高感兴趣因素的显著性。文中采用真实的代谢组学数据验证新滤波算法的有效性,并与正交信号校正(orthogonal signalcorrection,OSC)方法进行比较。实验结果表明,新滤波方法可以在抑制未知干扰因素影响的同时,较好地保留感兴趣因素信息以及生物体内在的个体差异信息,降低模型发生过拟合的危险,使后续的统计分析结果更可靠。
- 丁俊邓伶莉许晶晶董继扬
- 关键词:代谢组学